RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301886.3

ARL2-SNX15-201, Transcript of ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ARL2-SNX15, Length 2,392 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ERICH6Q7L0X2 663 aa31.83■■■□□ 2.69
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SETD5Q9C0A6 1442 aa31.83■■■□□ 2.69
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa31.83■■■□□ 2.69
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP31.8■■■□□ 2.68
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP31.78■■■□□ 2.68
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SIN3AQ96ST3 1273 aa31.73■■■□□ 2.67
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa31.71■■■□□ 2.67
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.7■■■□□ 2.67
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MAP3K1Q13233 1512 aa31.67■■■□□ 2.66
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ERICH6BQ5W0A0 696 aa31.66■■■□□ 2.66
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.64■■■□□ 2.66
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DEKP35659 375 aaKnown RBP31.61■■■□□ 2.65
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TIAM1Q13009 1591 aa31.6■■■□□ 2.65
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP31.58■■■□□ 2.65
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.57■■■□□ 2.64
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KIF27Q86VH2 1401 aa31.56■■■□□ 2.64
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa31.48■■■□□ 2.63
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP31.48■■■□□ 2.63
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PPP4R2Q9NY27 417 aa31.48■■■□□ 2.63
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PHLDB1Q86UU1 1377 aa31.45■■■□□ 2.63
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP31.45■■■□□ 2.62
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP31.4■■■□□ 2.62
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CUX1P39880 1505 aa31.37■■■□□ 2.61
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TONSLQ96HA7 1378 aa31.35■■■□□ 2.61
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP31.32■■■□□ 2.6
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CFAP43Q8NDM7 1665 aa31.29■■■□□ 2.6
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP31.28■■■□□ 2.6
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.26■■■□□ 2.59
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP31.14■■■□□ 2.58
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa31.14■■■□□ 2.58
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KDM5BQ9UGL1 1544 aa31.12■■■□□ 2.57
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NBR1Q14596 966 aa31.11■■■□□ 2.57
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP31.11■■■□□ 2.57
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 UACAQ9BZF9 1416 aa31.11■■■□□ 2.57
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 IGF1RP08069 1367 aa31.1■■■□□ 2.57
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CCDC18Q5T9S5 1454 aa31.1■■■□□ 2.57
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP31.09■■■□□ 2.57
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NCOA2Q15596 1464 aa31.08■■■□□ 2.57
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 WASHC2AQ641Q2 1341 aa31.07■■■□□ 2.56
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZBED9Q6R2W3 1325 aa31.05■■■□□ 2.56
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HFM1A2PYH4 1435 aa31.01■■■□□ 2.55
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CNTLNQ9NXG0 1405 aa31■■■□□ 2.55
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.99■■■□□ 2.55
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP30.99■■■□□ 2.55
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP30.98■■■□□ 2.55
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CCDC184Q52MB2 194 aa30.97■■■□□ 2.55
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PTPN23Q9H3S7 1636 aa30.97■■■□□ 2.55
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FYCO1Q9BQS8 1478 aa30.97■■■□□ 2.55
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FGD6Q6ZV73 1430 aa30.95■■■□□ 2.55
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP30.95■■■□□ 2.54
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NCAPD3P42695 1498 aa30.93■■■□□ 2.54
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP30.93■■■□□ 2.54
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CFTRP13569 1480 aa30.92■■■□□ 2.54
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP30.91■■■□□ 2.54
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP30.9■■■□□ 2.54
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FAM9BQ8IZU0 186 aa30.9■■■□□ 2.54
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.9■■■□□ 2.54
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP30.9■■■□□ 2.54
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HMGXB3Q12766 1538 aa30.89■■■□□ 2.54
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.89■■■□□ 2.542e-6■■■■□ 24.9
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa30.89■■■□□ 2.53
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP30.88■■■□□ 2.53
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MRS2Q9HD23 443 aa30.87■■■□□ 2.53
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.86■■■□□ 2.53
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP30.85■■■□□ 2.53
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PTPRKQ15262 1439 aa30.85■■■□□ 2.53
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NAIPQ13075 1403 aa30.85■■■□□ 2.53
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP30.83■■■□□ 2.53
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 P3H3Q8IVL6 736 aa30.82■■■□□ 2.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RNF123Q5XPI4 1314 aa30.81■■■□□ 2.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 EFCAB5A4FU69 1503 aa30.79■■■□□ 2.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FMN1Q68DA7 1419 aa30.79■■■□□ 2.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FHOD3Q2V2M9 1422 aa30.79■■■□□ 2.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NCOA1Q15788 1441 aa30.78■■■□□ 2.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CCDC7Q96M83 1385 aa30.78■■■□□ 2.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 IL27Q8NEV9 243 aa30.77■■■□□ 2.52
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CCDC136Q96JN2 1154 aa30.74■■■□□ 2.51
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PRDM2Q13029 1718 aa30.74■■■□□ 2.51
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 AKNAQ7Z591 1439 aa30.7■■■□□ 2.51
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.69■■■□□ 2.5
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP30.69■■■□□ 2.5
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NUDCQ9Y266 331 aa30.67■■■□□ 2.5
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP30.66■■■□□ 2.5
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 USP35Q9P2H5 1018 aa30.66■■■□□ 2.5
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HECW1Q76N89 1606 aa30.66■■■□□ 2.5
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MTUS2Q5JR59 1369 aa30.65■■■□□ 2.5
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MYOM3Q5VTT5 1437 aa30.63■■■□□ 2.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP30.6■■■□□ 2.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa30.6■■■□□ 2.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.58■■■□□ 2.49
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GCC2Q8IWJ2 1684 aa30.56■■■□□ 2.48
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 L3MBTL2Q969R5 705 aa30.55■■■□□ 2.48
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP30.52■■■□□ 2.48
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KIF7Q2M1P5 1343 aa30.51■■■□□ 2.48
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP30.51■■■□□ 2.47
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa30.49■■■□□ 2.47
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.49■■■□□ 2.47
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa30.49■■■□□ 2.47
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa30.48■■■□□ 2.47
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NEFMP07197 916 aa30.48■■■□□ 2.47
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