RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298564.14

TSPAN17-201, Transcript of tetraspanin 17, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TSPAN17, Length 2,810 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TSPAN17-201ENST00000298564 PBRM1Q86U86 1689 aa25.48■■□□□ 1.67
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TSPAN17-201ENST00000298564 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.31■■□□□ 1.64
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TSPAN17-201ENST00000298564 WDR62O43379 1518 aa25.28■■□□□ 1.64
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TSPAN17-201ENST00000298564 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.25■■□□□ 1.63
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TSPAN17-201ENST00000298564 UACAQ9BZF9 1416 aa25.21■■□□□ 1.63
TSPAN17-201ENST00000298564 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.21■■□□□ 1.63
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TSPAN17-201ENST00000298564 DISP1Q96F81 1524 aa25.14■■□□□ 1.61
TSPAN17-201ENST00000298564 GRIN2AQ12879 1464 aa25.14■■□□□ 1.61
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TSPAN17-201ENST00000298564 BCL11AQ9H165 835 aa25.12■■□□□ 1.61
TSPAN17-201ENST00000298564 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
TSPAN17-201ENST00000298564 KIAA0556O60303 1618 aa25.1■■□□□ 1.61
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TSPAN17-201ENST00000298564 MIA2Q96PC5 1412 aa25.07■■□□□ 1.6
TSPAN17-201ENST00000298564 FBLN2P98095 1184 aa25.06■■□□□ 1.6
TSPAN17-201ENST00000298564 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
TSPAN17-201ENST00000298564 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
TSPAN17-201ENST00000298564 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
TSPAN17-201ENST00000298564 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.99■■□□□ 1.59
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TSPAN17-201ENST00000298564 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.98■■□□□ 1.59
TSPAN17-201ENST00000298564 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
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