RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295767.9

CHCHD4-201, Transcript of coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 4, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CHCHD4, Length 1,603 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4-201ENST00000295767 CLASP1Q7Z460 1538 aa45.37■■■■■ 4.85
CHCHD4-201ENST00000295767 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa45.3■■■■■ 4.84
CHCHD4-201ENST00000295767 IQGAP2Q13576 1575 aa45.25■■■■■ 4.83
CHCHD4-201ENST00000295767 UBTFP17480 764 aaKnown RBP45.25■■■■■ 4.83
CHCHD4-201ENST00000295767 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa45.2■■■■■ 4.83
CHCHD4-201ENST00000295767 SHROOM2Q13796 1616 aa45.14■■■■■ 4.82
CHCHD4-201ENST00000295767 TNIKQ9UKE5 1360 aa45.06■■■■■ 4.8
CHCHD4-201ENST00000295767 JPH4Q96JJ6 628 aa45.02■■■■■ 4.8
CHCHD4-201ENST00000295767 UGGT2Q9NYU1 1516 aa45■■■■■ 4.79
CHCHD4-201ENST00000295767 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP44.9■■■■■ 4.78
CHCHD4-201ENST00000295767 ERCC6L2Q5T890 1561 aa44.88■■■■■ 4.78
CHCHD4-201ENST00000295767 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP44.88■■■■■ 4.78
CHCHD4-201ENST00000295767 DISP1Q96F81 1524 aa44.84■■■■■ 4.77
CHCHD4-201ENST00000295767 SAMD9Q5K651 1589 aa44.83■■■■■ 4.77
CHCHD4-201ENST00000295767 KIAA0556O60303 1618 aa44.82■■■■■ 4.77
CHCHD4-201ENST00000295767 ARHGEF11O15085 1522 aa44.8■■■■■ 4.76
CHCHD4-201ENST00000295767 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa44.76■■■■■ 4.76
CHCHD4-201ENST00000295767 EFCAB5A4FU69 1503 aa44.76■■■■■ 4.76
CHCHD4-201ENST00000295767 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa44.75■■■■■ 4.75
CHCHD4-201ENST00000295767 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa44.75■■■■■ 4.75
CHCHD4-201ENST00000295767 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa44.75■■■■■ 4.75
CHCHD4-201ENST00000295767 CEP162Q5TB80 1403 aa44.73■■■■■ 4.75
CHCHD4-201ENST00000295767 CLIP1P30622 1438 aa44.69■■■■■ 4.74
CHCHD4-201ENST00000295767 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa44.69■■■■■ 4.74
CHCHD4-201ENST00000295767 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.68■■■■■ 4.74
CHCHD4-201ENST00000295767 P3H3Q8IVL6 736 aa44.63■■■■■ 4.73
CHCHD4-201ENST00000295767 FHOD3Q2V2M9 1422 aa44.57■■■■■ 4.73
CHCHD4-201ENST00000295767 ARAP1Q96P48 1450 aa44.51■■■■■ 4.72
CHCHD4-201ENST00000295767 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP44.46■■■■■ 4.71
CHCHD4-201ENST00000295767 PTPRGP23470 1445 aa44.45■■■■■ 4.71
CHCHD4-201ENST00000295767 FMN1Q68DA7 1419 aa44.29■■■■■ 4.68
CHCHD4-201ENST00000295767 CYB5RLQ6IPT4 315 aa44.27■■■■■ 4.68
CHCHD4-201ENST00000295767 PLB1Q6P1J6 1458 aa44.26■■■■■ 4.68
CHCHD4-201ENST00000295767 ABCA8O94911 1581 aa44.25■■■■■ 4.67
CHCHD4-201ENST00000295767 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa44.22■■■■■ 4.67
CHCHD4-201ENST00000295767 UACAQ9BZF9 1416 aa44.2■■■■■ 4.67
CHCHD4-201ENST00000295767 ADCY10Q96PN6 1610 aa44.18■■■■■ 4.66
CHCHD4-201ENST00000295767 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP44.16■■■■■ 4.66
CHCHD4-201ENST00000295767 ABCC2Q92887 1545 aa44.15■■■■■ 4.66
CHCHD4-201ENST00000295767 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa44.12■■■■■ 4.65
CHCHD4-201ENST00000295767 VPS8Q8N3P4 1428 aa44.12■■■■■ 4.65
CHCHD4-201ENST00000295767 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa44.06■■■■■ 4.64
CHCHD4-201ENST00000295767 HECW1Q76N89 1606 aa44.05■■■■■ 4.64
CHCHD4-201ENST00000295767 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP44.03■■■■■ 4.64
CHCHD4-201ENST00000295767 FYCO1Q9BQS8 1478 aa44.03■■■■■ 4.64
CHCHD4-201ENST00000295767 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa44.01■■■■■ 4.64
CHCHD4-201ENST00000295767 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP43.95■■■■■ 4.63
CHCHD4-201ENST00000295767 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP43.92■■■■■ 4.62
CHCHD4-201ENST00000295767 KDM5BQ9UGL1 1544 aa43.92■■■■■ 4.62
CHCHD4-201ENST00000295767 ARID3CA6NKF2 412 aa43.89■■■■■ 4.62
CHCHD4-201ENST00000295767 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP43.87■■■■■ 4.61
CHCHD4-201ENST00000295767 ATP10BO94823 1461 aa43.85■■■■■ 4.61
CHCHD4-201ENST00000295767 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP43.85■■■■■ 4.61
CHCHD4-201ENST00000295767 CCDC18Q5T9S5 1454 aa43.8■■■■■ 4.6
CHCHD4-201ENST00000295767 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP43.77■■■■■ 4.6
CHCHD4-201ENST00000295767 CFAP43Q8NDM7 1665 aa43.74■■■■■ 4.59
CHCHD4-201ENST00000295767 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP43.7■■■■■ 4.59
CHCHD4-201ENST00000295767 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP43.7■■■■■ 4.59
CHCHD4-201ENST00000295767 TIAM1Q13009 1591 aa43.67■■■■■ 4.58
CHCHD4-201ENST00000295767 MAPKBP1O60336 1514 aa43.66■■■■■ 4.58
CHCHD4-201ENST00000295767 MAP3K1Q13233 1512 aa43.6■■■■■ 4.57
CHCHD4-201ENST00000295767 ASXL2Q76L83 1435 aa43.6■■■■■ 4.57
CHCHD4-201ENST00000295767 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa43.56■■■■■ 4.56
CHCHD4-201ENST00000295767 WDR7Q9Y4E6 1490 aa43.54■■■■■ 4.56
CHCHD4-201ENST00000295767 APLP2Q06481 763 aa43.53■■■■■ 4.56
CHCHD4-201ENST00000295767 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP43.51■■■■■ 4.56
CHCHD4-201ENST00000295767 PLEKHD1A6NEE1 506 aa43.5■■■■■ 4.55
CHCHD4-201ENST00000295767 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP43.45■■■■■ 4.55
CHCHD4-201ENST00000295767 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa43.43■■■■■ 4.54
CHCHD4-201ENST00000295767 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa43.43■■■■■ 4.54
CHCHD4-201ENST00000295767 MTUS2Q5JR59 1369 aa43.41■■■■■ 4.54
CHCHD4-201ENST00000295767 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP43.39■■■■■ 4.54
CHCHD4-201ENST00000295767 KIF14Q15058 1648 aa43.36■■■■■ 4.53
CHCHD4-201ENST00000295767 DIP2BQ9P265 1576 aa43.35■■■■■ 4.53
CHCHD4-201ENST00000295767 KCNH8Q96L42 1107 aa43.34■■■■■ 4.53
CHCHD4-201ENST00000295767 ABCC10Q5T3U5 1492 aa43.32■■■■■ 4.53
CHCHD4-201ENST00000295767 KIF13AQ9H1H9 1805 aa43.32■■■■■ 4.52
CHCHD4-201ENST00000295767 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP43.28■■■■■ 4.52
CHCHD4-201ENST00000295767 GLI2P10070 1586 aa43.24■■■■■ 4.51
CHCHD4-201ENST00000295767 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP43.24■■■■■ 4.51
CHCHD4-201ENST00000295767 ABCA9Q8IUA7 1624 aa43.23■■■■■ 4.51
CHCHD4-201ENST00000295767 TTC37Q6PGP7 1564 aa43.22■■■■■ 4.51
CHCHD4-201ENST00000295767 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP43.19■■■■■ 4.51
CHCHD4-201ENST00000295767 NCOA2Q15596 1464 aa43.16■■■■■ 4.5
CHCHD4-201ENST00000295767 FAM69CQ0P6D2 419 aa43.15■■■■■ 4.5
CHCHD4-201ENST00000295767 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa43.14■■■■■ 4.5
CHCHD4-201ENST00000295767 MYO5CQ9NQX4 1742 aa43.09■■■■■ 4.49
CHCHD4-201ENST00000295767 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa43.08■■■■■ 4.49
CHCHD4-201ENST00000295767 TRHP20396 242 aaPredicted RBP43.05■■■■■ 4.48
CHCHD4-201ENST00000295767 TSPOAP1O95153 1857 aa43.04■■■■■ 4.48
CHCHD4-201ENST00000295767 CD109Q6YHK3 1445 aa43.01■■■■■ 4.48
CHCHD4-201ENST00000295767 PREX2Q70Z35 1606 aa43.01■■■■■ 4.48
CHCHD4-201ENST00000295767 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa43■■■■■ 4.47
CHCHD4-201ENST00000295767 ITSN2Q9NZM3 1697 aa43■■■■■ 4.47
CHCHD4-201ENST00000295767 CCNB3Q8WWL7 1395 aa42.98■■■■■ 4.47
CHCHD4-201ENST00000295767 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP42.97■■■■■ 4.47
CHCHD4-201ENST00000295767 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP42.97■■■■■ 4.47
CHCHD4-201ENST00000295767 PHLDB1Q86UU1 1377 aa42.93■■■■■ 4.46
CHCHD4-201ENST00000295767 PLCH2O75038 1416 aa42.93■■■■■ 4.46
CHCHD4-201ENST00000295767 ARAP3Q8WWN8 1544 aa42.9■■■■■ 4.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.9 ms