RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295718.6

PTPRN-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN, Length 3,784 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-201ENST00000295718 MRS2Q9HD23 443 aa19.93■□□□□ 0.78
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PTPRN-201ENST00000295718 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP19.82■□□□□ 0.76
PTPRN-201ENST00000295718 CCDC136Q96JN2 1154 aa19.82■□□□□ 0.76
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PTPRN-201ENST00000295718 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
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PTPRN-201ENST00000295718 WDR97A6NE52 1622 aa19.43■□□□□ 0.7
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PTPRN-201ENST00000295718 MPHOSPH9Q99550 1183 aa19.32■□□□□ 0.68
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PTPRN-201ENST00000295718 SLC4A3P48751 1232 aa19.23■□□□□ 0.67
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PTPRN-201ENST00000295718 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa19.2■□□□□ 0.66
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PTPRN-201ENST00000295718 ZBED9Q6R2W3 1325 aa19.18■□□□□ 0.66
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PTPRN-201ENST00000295718 PDE4AP27815 886 aa19.08■□□□□ 0.64
PTPRN-201ENST00000295718 FGD6Q6ZV73 1430 aa19.07■□□□□ 0.64
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP19.06■□□□□ 0.64
PTPRN-201ENST00000295718 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP19.06■□□□□ 0.64
PTPRN-201ENST00000295718 TSPY4P0CV99 314 aa19.05■□□□□ 0.64
PTPRN-201ENST00000295718 TSPY10P0CW01 314 aa19.05■□□□□ 0.64
PTPRN-201ENST00000295718 UACAQ9BZF9 1416 aa19.04■□□□□ 0.64
PTPRN-201ENST00000295718 ERICH3Q5RHP9 1530 aa19.04■□□□□ 0.64
PTPRN-201ENST00000295718 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa19.03■□□□□ 0.64
PTPRN-201ENST00000295718 NEUROD2Q15784 382 aa19.03■□□□□ 0.64
PTPRN-201ENST00000295718 CNTLNQ9NXG0 1405 aa19.02■□□□□ 0.63
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