RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295463.3

ALPI-201, Transcript of alkaline phosphatase, intestinal, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ALPI, Length 2,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPI-201ENST00000295463 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.83■■□□□ 1.41
ALPI-201ENST00000295463 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.83■■□□□ 1.41
ALPI-201ENST00000295463 APLP2Q06481 763 aa23.82■■□□□ 1.4
ALPI-201ENST00000295463 CUL7Q14999 1698 aa23.82■■□□□ 1.4
ALPI-201ENST00000295463 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
ALPI-201ENST00000295463 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.79■■□□□ 1.4
ALPI-201ENST00000295463 ERCC6Q03468 1493 aa23.75■■□□□ 1.39
ALPI-201ENST00000295463 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.73■■□□□ 1.39
ALPI-201ENST00000295463 PBRM1Q86U86 1689 aa23.71■■□□□ 1.39
ALPI-201ENST00000295463 P3H3Q8IVL6 736 aa23.71■■□□□ 1.39
ALPI-201ENST00000295463 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.69■■□□□ 1.38
ALPI-201ENST00000295463 WDR62O43379 1518 aa23.67■■□□□ 1.38
ALPI-201ENST00000295463 ANP32EQ9BTT0 268 aa23.63■■□□□ 1.37
ALPI-201ENST00000295463 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
ALPI-201ENST00000295463 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
ALPI-201ENST00000295463 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
ALPI-201ENST00000295463 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.6■■□□□ 1.37
ALPI-201ENST00000295463 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
ALPI-201ENST00000295463 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
ALPI-201ENST00000295463 IFT140Q96RY7 1462 aa23.55■■□□□ 1.36
ALPI-201ENST00000295463 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
ALPI-201ENST00000295463 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
ALPI-201ENST00000295463 MIER1Q8N108 512 aa23.53■■□□□ 1.36
ALPI-201ENST00000295463 ADAMTS12P58397 1594 aa23.53■■□□□ 1.36
ALPI-201ENST00000295463 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
ALPI-201ENST00000295463 GRIN2BQ13224 1484 aa23.49■■□□□ 1.35
ALPI-201ENST00000295463 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.49■■□□□ 1.35
ALPI-201ENST00000295463 TIAM1Q13009 1591 aa23.47■■□□□ 1.35
ALPI-201ENST00000295463 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.47■■□□□ 1.35
ALPI-201ENST00000295463 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.42■■□□□ 1.34
ALPI-201ENST00000295463 SAMD9Q5K651 1589 aa23.4■■□□□ 1.34
ALPI-201ENST00000295463 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.39■■□□□ 1.34
ALPI-201ENST00000295463 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa23.38■■□□□ 1.33
ALPI-201ENST00000295463 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
ALPI-201ENST00000295463 IQGAP2Q13576 1575 aa23.36■■□□□ 1.33
ALPI-201ENST00000295463 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.34■■□□□ 1.33
ALPI-201ENST00000295463 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.33■■□□□ 1.33
ALPI-201ENST00000295463 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.31■■□□□ 1.32
ALPI-201ENST00000295463 FMN1Q68DA7 1419 aa23.31■■□□□ 1.32
ALPI-201ENST00000295463 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.31■■□□□ 1.32
ALPI-201ENST00000295463 MAP3K1Q13233 1512 aa23.3■■□□□ 1.32
ALPI-201ENST00000295463 FBLN2P98095 1184 aa23.28■■□□□ 1.32
ALPI-201ENST00000295463 CLSPNQ9HAW4 1339 aa23.28■■□□□ 1.32
ALPI-201ENST00000295463 ITGAEP38570 1179 aa23.28■■□□□ 1.32
ALPI-201ENST00000295463 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
ALPI-201ENST00000295463 GRIN2AQ12879 1464 aa23.27■■□□□ 1.32
ALPI-201ENST00000295463 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.25■■□□□ 1.31
ALPI-201ENST00000295463 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.23■■□□□ 1.31
ALPI-201ENST00000295463 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
ALPI-201ENST00000295463 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
ALPI-201ENST00000295463 ARID3CA6NKF2 412 aa23.18■■□□□ 1.3
ALPI-201ENST00000295463 SYNJ2O15056 1496 aa23.17■■□□□ 1.3
ALPI-201ENST00000295463 CEP170Q5SW79 1584 aa23.17■■□□□ 1.3
ALPI-201ENST00000295463 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.15■■□□□ 1.3
ALPI-201ENST00000295463 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.15■■□□□ 1.3
ALPI-201ENST00000295463 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.14■■□□□ 1.29
ALPI-201ENST00000295463 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
ALPI-201ENST00000295463 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
ALPI-201ENST00000295463 KIAA0556O60303 1618 aa23.12■■□□□ 1.29
ALPI-201ENST00000295463 HECW1Q76N89 1606 aa23.1■■□□□ 1.29
ALPI-201ENST00000295463 DISP1Q96F81 1524 aa23.1■■□□□ 1.29
ALPI-201ENST00000295463 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
ALPI-201ENST00000295463 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.05■■□□□ 1.28
ALPI-201ENST00000295463 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
ALPI-201ENST00000295463 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
ALPI-201ENST00000295463 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.01■■□□□ 1.27
ALPI-201ENST00000295463 NCOA2Q15596 1464 aa23.01■■□□□ 1.27
ALPI-201ENST00000295463 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.01■■□□□ 1.27
ALPI-201ENST00000295463 CHD1O14646 1710 aa22.99■■□□□ 1.27
ALPI-201ENST00000295463 NUP160Q12769 1436 aa22.99■■□□□ 1.27
ALPI-201ENST00000295463 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.97■■□□□ 1.27
ALPI-201ENST00000295463 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
ALPI-201ENST00000295463 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.95■■□□□ 1.26
ALPI-201ENST00000295463 JPH4Q96JJ6 628 aa22.94■■□□□ 1.26
ALPI-201ENST00000295463 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.93■■□□□ 1.26
ALPI-201ENST00000295463 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
ALPI-201ENST00000295463 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.9■■□□□ 1.26
ALPI-201ENST00000295463 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.9■■□□□ 1.26
ALPI-201ENST00000295463 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.87■■□□□ 1.25
ALPI-201ENST00000295463 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.85■■□□□ 1.25
ALPI-201ENST00000295463 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.85■■□□□ 1.25
ALPI-201ENST00000295463 ARHGEF11O15085 1522 aa22.84■■□□□ 1.25
ALPI-201ENST00000295463 BCANQ96GW7 911 aa22.82■■□□□ 1.24
ALPI-201ENST00000295463 PTPRKQ15262 1439 aa22.79■■□□□ 1.24
ALPI-201ENST00000295463 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
ALPI-201ENST00000295463 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.78■■□□□ 1.24
ALPI-201ENST00000295463 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
ALPI-201ENST00000295463 MAPKBP1O60336 1514 aa22.72■■□□□ 1.23
ALPI-201ENST00000295463 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.72■■□□□ 1.23
ALPI-201ENST00000295463 KIF14Q15058 1648 aa22.71■■□□□ 1.23
ALPI-201ENST00000295463 ABCA8O94911 1581 aa22.7■■□□□ 1.22
ALPI-201ENST00000295463 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
ALPI-201ENST00000295463 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.69■■□□□ 1.22
ALPI-201ENST00000295463 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
ALPI-201ENST00000295463 FKBP8Q14318 412 aa22.67■■□□□ 1.22
ALPI-201ENST00000295463 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
ALPI-201ENST00000295463 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.65■■□□□ 1.22
ALPI-201ENST00000295463 PTPRGP23470 1445 aa22.65■■□□□ 1.22
ALPI-201ENST00000295463 SHROOM2Q13796 1616 aa22.65■■□□□ 1.22
ALPI-201ENST00000295463 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
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