RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293826.4

TNFSF12-TNFSF13-201, Transcript of TNFSF12-TNFSF13 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFSF12-TNFSF13, Length 1,816 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa38.27■■■■□ 3.72
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CHD1O14646 1710 aa38.26■■■■□ 3.72
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CEP170Q5SW79 1584 aa38.18■■■■□ 3.7
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CLIP1P30622 1438 aa38.14■■■■□ 3.7
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NUP160Q12769 1436 aa38.09■■■■□ 3.69
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 IQGAP2Q13576 1575 aa38.05■■■■□ 3.68
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa38.02■■■■□ 3.68
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa37.99■■■■□ 3.67
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 P3H3Q8IVL6 736 aa37.93■■■■□ 3.66
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ARAP1Q96P48 1450 aa37.91■■■■□ 3.66
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SAMD9Q5K651 1589 aa37.84■■■■□ 3.65
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 UGGT2Q9NYU1 1516 aa37.83■■■■□ 3.65
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 EFCAB5A4FU69 1503 aa37.81■■■■□ 3.64
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FHOD3Q2V2M9 1422 aa37.81■■■■□ 3.64
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 JPH4Q96JJ6 628 aa37.79■■■■□ 3.64
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.77■■■■□ 3.64
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DISP1Q96F81 1524 aa37.74■■■■□ 3.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 VPS8Q8N3P4 1428 aa37.7■■■■□ 3.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KIAA0556O60303 1618 aa37.69■■■■□ 3.62
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OSCARQ8IYS5 282 aa37.66■■■■□ 3.62
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SHROOM2Q13796 1616 aa37.65■■■■□ 3.62
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP37.62■■■■□ 3.61
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP37.59■■■■□ 3.61
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.58■■■■□ 3.61
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa37.53■■■■□ 3.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP37.49■■■■□ 3.59
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FMN1Q68DA7 1419 aa37.46■■■■□ 3.59
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP37.45■■■■□ 3.59
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP37.39■■■■□ 3.58
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa37.36■■■■□ 3.57
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FYCO1Q9BQS8 1478 aa37.32■■■■□ 3.57
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PLB1Q6P1J6 1458 aa37.3■■■■□ 3.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PTPRGP23470 1445 aa37.29■■■■□ 3.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa37.28■■■■□ 3.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa37.24■■■■□ 3.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 APLP2Q06481 763 aa37.23■■■■□ 3.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ARID3CA6NKF2 412 aa37.22■■■■□ 3.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HECW1Q76N89 1606 aa37.18■■■■□ 3.54
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ABCA8O94911 1581 aa37.17■■■■□ 3.54
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP37.17■■■■□ 3.54
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TIAM1Q13009 1591 aa37.16■■■■□ 3.54
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP37.16■■■■□ 3.54
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CFAP43Q8NDM7 1665 aa37.12■■■■□ 3.53
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP37.11■■■■□ 3.53
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ARHGEF11O15085 1522 aa37.1■■■■□ 3.53
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP37.09■■■■□ 3.53
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 UACAQ9BZF9 1416 aa37.06■■■■□ 3.52
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MAP3K1Q13233 1512 aa37.06■■■■□ 3.52
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CCDC18Q5T9S5 1454 aa37.01■■■■□ 3.51
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.99■■■■□ 3.51
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.99■■■■□ 3.51
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa36.99■■■■□ 3.51
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PCGF6Q9BYE7 350 aa36.97■■■■□ 3.51
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ABCC2Q92887 1545 aa36.97■■■■□ 3.51
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa36.96■■■■□ 3.51
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP36.95■■■■□ 3.51
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP36.94■■■■□ 3.5
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP36.94■■■■□ 3.5
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ATP10BO94823 1461 aa36.93■■■■□ 3.5
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ADCY10Q96PN6 1610 aa36.9■■■■□ 3.5
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MTUS2Q5JR59 1369 aa36.86■■■■□ 3.49
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa36.79■■■■□ 3.48
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.78■■■■□ 3.48
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP36.78■■■■□ 3.48
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KDM5BQ9UGL1 1544 aa36.75■■■■□ 3.47
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP36.7■■■■□ 3.47
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PLEKHD1A6NEE1 506 aa36.66■■■■□ 3.46
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NCOA2Q15596 1464 aa36.66■■■■□ 3.46
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ASXL2Q76L83 1435 aa36.47■■■■□ 3.43
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP36.46■■■■□ 3.43
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 WDR7Q9Y4E6 1490 aa36.44■■■■□ 3.42
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ABCC10Q5T3U5 1492 aa36.43■■■■□ 3.42
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CCNB3Q8WWL7 1395 aa36.4■■■■□ 3.42
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FGD6Q6ZV73 1430 aa36.4■■■■□ 3.42
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP36.38■■■■□ 3.41
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TTC37Q6PGP7 1564 aa36.38■■■■□ 3.41
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.37■■■■□ 3.41
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP36.35■■■■□ 3.41
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa36.34■■■■□ 3.41
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP36.31■■■■□ 3.4
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PTPN23Q9H3S7 1636 aa36.28■■■■□ 3.4
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MAPKBP1O60336 1514 aa36.27■■■■□ 3.4
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ITSN2Q9NZM3 1697 aa36.27■■■■□ 3.4
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP36.24■■■■□ 3.39
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MIA2Q96PC5 1412 aa36.23■■■■□ 3.39
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ITGAEP38570 1179 aa36.22■■■■□ 3.39
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP36.22■■■■□ 3.39
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa36.22■■■■□ 3.39
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PREX2Q70Z35 1606 aa36.2■■■■□ 3.39
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MYO5CQ9NQX4 1742 aa36.19■■■■□ 3.38
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP36.18■■■■□ 3.38
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