RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293308.11

KRT8-201, Transcript of keratin 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene KRT8, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT8-201ENST00000293308 SYNJ2O15056 1496 aa26.37■■□□□ 1.81
KRT8-201ENST00000293308 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
KRT8-201ENST00000293308 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.34■■□□□ 1.81
KRT8-201ENST00000293308 CHD1O14646 1710 aa26.3■■□□□ 1.8
KRT8-201ENST00000293308 CLIP1P30622 1438 aa26.28■■□□□ 1.8
KRT8-201ENST00000293308 GRIN2AQ12879 1464 aa26.26■■□□□ 1.79
KRT8-201ENST00000293308 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.26■■□□□ 1.79
KRT8-201ENST00000293308 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.26■■□□□ 1.79
KRT8-201ENST00000293308 PRXQ9BXM0 1461 aa26.25■■□□□ 1.79
KRT8-201ENST00000293308 OSCARQ8IYS5 282 aa26.13■■□□□ 1.77
KRT8-201ENST00000293308 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
KRT8-201ENST00000293308 CEP170Q5SW79 1584 aa26.1■■□□□ 1.77
KRT8-201ENST00000293308 NUP160Q12769 1436 aa26.09■■□□□ 1.77
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KRT8-201ENST00000293308 APLP2Q06481 763 aa26■■□□□ 1.75
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KRT8-201ENST00000293308 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.99■■□□□ 1.75
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KRT8-201ENST00000293308 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.84■■□□□ 1.73
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KRT8-201ENST00000293308 SAMD9Q5K651 1589 aa25.66■■□□□ 1.7
KRT8-201ENST00000293308 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.65■■□□□ 1.7
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KRT8-201ENST00000293308 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.32■■□□□ 1.64
KRT8-201ENST00000293308 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.31■■□□□ 1.64
KRT8-201ENST00000293308 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.31■■□□□ 1.64
KRT8-201ENST00000293308 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
KRT8-201ENST00000293308 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa25.29■■□□□ 1.64
KRT8-201ENST00000293308 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
KRT8-201ENST00000293308 HECW1Q76N89 1606 aa25.27■■□□□ 1.64
KRT8-201ENST00000293308 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.26■■□□□ 1.63
KRT8-201ENST00000293308 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.25■■□□□ 1.63
KRT8-201ENST00000293308 ARID3CA6NKF2 412 aa25.23■■□□□ 1.63
KRT8-201ENST00000293308 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
KRT8-201ENST00000293308 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP25.23■■□□□ 1.63
KRT8-201ENST00000293308 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.2■■□□□ 1.63
KRT8-201ENST00000293308 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
KRT8-201ENST00000293308 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.19■■□□□ 1.62
KRT8-201ENST00000293308 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.18■■□□□ 1.62
KRT8-201ENST00000293308 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.17■■□□□ 1.62
KRT8-201ENST00000293308 MAPKBP1O60336 1514 aa25.17■■□□□ 1.62
KRT8-201ENST00000293308 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
KRT8-201ENST00000293308 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
KRT8-201ENST00000293308 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.15■■□□□ 1.62
KRT8-201ENST00000293308 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.14■■□□□ 1.62
KRT8-201ENST00000293308 ATP10BO94823 1461 aa25.13■■□□□ 1.61
KRT8-201ENST00000293308 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
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KRT8-201ENST00000293308 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25.08■■□□□ 1.61
KRT8-201ENST00000293308 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
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KRT8-201ENST00000293308 ASXL2Q76L83 1435 aa25.03■■□□□ 1.6
KRT8-201ENST00000293308 PLEKHD1A6NEE1 506 aa25.01■■□□□ 1.59
KRT8-201ENST00000293308 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.99■■□□□ 1.59
KRT8-201ENST00000293308 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.95■■□□□ 1.58
KRT8-201ENST00000293308 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
KRT8-201ENST00000293308 KCNH8Q96L42 1107 aa24.93■■□□□ 1.58
KRT8-201ENST00000293308 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
KRT8-201ENST00000293308 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.91■■□□□ 1.58
KRT8-201ENST00000293308 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.9■■□□□ 1.58
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