RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293308.11

KRT8-201, Transcript of keratin 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene KRT8, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT8-201ENST00000293308 SYNJ2O15056 1496 aa26.37■■□□□ 1.81
KRT8-201ENST00000293308 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
KRT8-201ENST00000293308 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.34■■□□□ 1.81
KRT8-201ENST00000293308 CHD1O14646 1710 aa26.3■■□□□ 1.8
KRT8-201ENST00000293308 CLIP1P30622 1438 aa26.28■■□□□ 1.8
KRT8-201ENST00000293308 GRIN2AQ12879 1464 aa26.26■■□□□ 1.79
KRT8-201ENST00000293308 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.26■■□□□ 1.79
KRT8-201ENST00000293308 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.26■■□□□ 1.79
KRT8-201ENST00000293308 PRXQ9BXM0 1461 aa26.25■■□□□ 1.79
KRT8-201ENST00000293308 OSCARQ8IYS5 282 aa26.13■■□□□ 1.77
KRT8-201ENST00000293308 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
KRT8-201ENST00000293308 CEP170Q5SW79 1584 aa26.1■■□□□ 1.77
KRT8-201ENST00000293308 NUP160Q12769 1436 aa26.09■■□□□ 1.77
KRT8-201ENST00000293308 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.76
KRT8-201ENST00000293308 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
KRT8-201ENST00000293308 APLP2Q06481 763 aa26■■□□□ 1.75
KRT8-201ENST00000293308 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
KRT8-201ENST00000293308 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.99■■□□□ 1.75
KRT8-201ENST00000293308 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.99■■□□□ 1.75
KRT8-201ENST00000293308 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.98■■□□□ 1.75
KRT8-201ENST00000293308 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
KRT8-201ENST00000293308 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
KRT8-201ENST00000293308 IQGAP2Q13576 1575 aa25.94■■□□□ 1.74
KRT8-201ENST00000293308 ARAP1Q96P48 1450 aa25.87■■□□□ 1.73
KRT8-201ENST00000293308 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
KRT8-201ENST00000293308 JPH4Q96JJ6 628 aa25.85■■□□□ 1.73
KRT8-201ENST00000293308 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.84■■□□□ 1.73
KRT8-201ENST00000293308 SHROOM2Q13796 1616 aa25.83■■□□□ 1.73
KRT8-201ENST00000293308 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.72
KRT8-201ENST00000293308 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
KRT8-201ENST00000293308 NEUROD1Q13562 356 aa25.78■■□□□ 1.72
KRT8-201ENST00000293308 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
KRT8-201ENST00000293308 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.78■■□□□ 1.72
KRT8-201ENST00000293308 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.74■■□□□ 1.71
KRT8-201ENST00000293308 ARHGEF11O15085 1522 aa25.71■■□□□ 1.71
KRT8-201ENST00000293308 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
KRT8-201ENST00000293308 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.69■■□□□ 1.7
KRT8-201ENST00000293308 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.69■■□□□ 1.7
KRT8-201ENST00000293308 DISP1Q96F81 1524 aa25.69■■□□□ 1.7
KRT8-201ENST00000293308 KIAA0556O60303 1618 aa25.68■■□□□ 1.7
KRT8-201ENST00000293308 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.67■■□□□ 1.7
KRT8-201ENST00000293308 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.66■■□□□ 1.7
KRT8-201ENST00000293308 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.66■■□□□ 1.7
KRT8-201ENST00000293308 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.66■■□□□ 1.7
KRT8-201ENST00000293308 SAMD9Q5K651 1589 aa25.66■■□□□ 1.7
KRT8-201ENST00000293308 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.65■■□□□ 1.7
KRT8-201ENST00000293308 P3H3Q8IVL6 736 aa25.63■■□□□ 1.69
KRT8-201ENST00000293308 MAP3K1Q13233 1512 aa25.62■■□□□ 1.69
KRT8-201ENST00000293308 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
KRT8-201ENST00000293308 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
KRT8-201ENST00000293308 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.57■■□□□ 1.68
KRT8-201ENST00000293308 PTPRGP23470 1445 aa25.54■■□□□ 1.68
KRT8-201ENST00000293308 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa25.53■■□□□ 1.68
KRT8-201ENST00000293308 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.5■■□□□ 1.67
KRT8-201ENST00000293308 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.47■■□□□ 1.67
KRT8-201ENST00000293308 TIAM1Q13009 1591 aa25.44■■□□□ 1.66
KRT8-201ENST00000293308 FMN1Q68DA7 1419 aa25.43■■□□□ 1.66
KRT8-201ENST00000293308 MIER1Q8N108 512 aa25.43■■□□□ 1.66
KRT8-201ENST00000293308 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.38■■□□□ 1.65
KRT8-201ENST00000293308 UACAQ9BZF9 1416 aa25.37■■□□□ 1.65
KRT8-201ENST00000293308 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.34■■□□□ 1.65
KRT8-201ENST00000293308 ABCA8O94911 1581 aa25.33■■□□□ 1.65
KRT8-201ENST00000293308 ABCC2Q92887 1545 aa25.33■■□□□ 1.65
KRT8-201ENST00000293308 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.32■■□□□ 1.64
KRT8-201ENST00000293308 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.31■■□□□ 1.64
KRT8-201ENST00000293308 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.31■■□□□ 1.64
KRT8-201ENST00000293308 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
KRT8-201ENST00000293308 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa25.29■■□□□ 1.64
KRT8-201ENST00000293308 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
KRT8-201ENST00000293308 HECW1Q76N89 1606 aa25.27■■□□□ 1.64
KRT8-201ENST00000293308 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.26■■□□□ 1.63
KRT8-201ENST00000293308 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.25■■□□□ 1.63
KRT8-201ENST00000293308 ARID3CA6NKF2 412 aa25.23■■□□□ 1.63
KRT8-201ENST00000293308 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
KRT8-201ENST00000293308 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP25.23■■□□□ 1.63
KRT8-201ENST00000293308 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.2■■□□□ 1.63
KRT8-201ENST00000293308 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
KRT8-201ENST00000293308 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.19■■□□□ 1.62
KRT8-201ENST00000293308 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.18■■□□□ 1.62
KRT8-201ENST00000293308 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.17■■□□□ 1.62
KRT8-201ENST00000293308 MAPKBP1O60336 1514 aa25.17■■□□□ 1.62
KRT8-201ENST00000293308 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
KRT8-201ENST00000293308 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
KRT8-201ENST00000293308 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.15■■□□□ 1.62
KRT8-201ENST00000293308 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.14■■□□□ 1.62
KRT8-201ENST00000293308 ATP10BO94823 1461 aa25.13■■□□□ 1.61
KRT8-201ENST00000293308 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
KRT8-201ENST00000293308 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.11■■□□□ 1.61
KRT8-201ENST00000293308 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25.08■■□□□ 1.61
KRT8-201ENST00000293308 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
KRT8-201ENST00000293308 ITGAEP38570 1179 aa25.03■■□□□ 1.6
KRT8-201ENST00000293308 ASXL2Q76L83 1435 aa25.03■■□□□ 1.6
KRT8-201ENST00000293308 PLEKHD1A6NEE1 506 aa25.01■■□□□ 1.59
KRT8-201ENST00000293308 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.99■■□□□ 1.59
KRT8-201ENST00000293308 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.95■■□□□ 1.58
KRT8-201ENST00000293308 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
KRT8-201ENST00000293308 KCNH8Q96L42 1107 aa24.93■■□□□ 1.58
KRT8-201ENST00000293308 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
KRT8-201ENST00000293308 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.91■■□□□ 1.58
KRT8-201ENST00000293308 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.1 ms