RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272542.7

SLC20A1-201, Transcript of solute carrier family 20 member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC20A1, Length 3,381 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC20A1-201ENST00000272542 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.43■■□□□ 1.34
SLC20A1-201ENST00000272542 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.42■■□□□ 1.341e-7■■■■□ 20.8
SLC20A1-201ENST00000272542 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
SLC20A1-201ENST00000272542 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.4■■□□□ 1.34
SLC20A1-201ENST00000272542 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
SLC20A1-201ENST00000272542 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
SLC20A1-201ENST00000272542 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.34■■□□□ 1.33
SLC20A1-201ENST00000272542 TIAM1Q13009 1591 aa23.33■■□□□ 1.33
SLC20A1-201ENST00000272542 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
SLC20A1-201ENST00000272542 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.32■■□□□ 1.32
SLC20A1-201ENST00000272542 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.25■■□□□ 1.31
SLC20A1-201ENST00000272542 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
SLC20A1-201ENST00000272542 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.24■■□□□ 1.31
SLC20A1-201ENST00000272542 CUL7Q14999 1698 aa23.23■■□□□ 1.31
SLC20A1-201ENST00000272542 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
SLC20A1-201ENST00000272542 WDR97A6NE52 1622 aa23.23■■□□□ 1.31
SLC20A1-201ENST00000272542 FBLN2P98095 1184 aa23.21■■□□□ 1.31
SLC20A1-201ENST00000272542 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
SLC20A1-201ENST00000272542 NEUROD1Q13562 356 aa23.2■■□□□ 1.3
SLC20A1-201ENST00000272542 MIER1Q8N108 512 aa23.19■■□□□ 1.3
SLC20A1-201ENST00000272542 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.18■■□□□ 1.3
SLC20A1-201ENST00000272542 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.18■■□□□ 1.3
SLC20A1-201ENST00000272542 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.18■■□□□ 1.3
SLC20A1-201ENST00000272542 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
SLC20A1-201ENST00000272542 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.16■■□□□ 1.3
SLC20A1-201ENST00000272542 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.15■■□□□ 1.3
SLC20A1-201ENST00000272542 FMN1Q68DA7 1419 aa23.14■■□□□ 1.29
SLC20A1-201ENST00000272542 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.12■■□□□ 1.29
SLC20A1-201ENST00000272542 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.11■■□□□ 1.29
SLC20A1-201ENST00000272542 MAP3K1Q13233 1512 aa23.11■■□□□ 1.29
SLC20A1-201ENST00000272542 ERCC6Q03468 1493 aa23.11■■□□□ 1.29
SLC20A1-201ENST00000272542 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.1■■□□□ 1.29
SLC20A1-201ENST00000272542 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.08■■□□□ 1.29
SLC20A1-201ENST00000272542 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.08■■□□□ 1.29
SLC20A1-201ENST00000272542 CLSPNQ9HAW4 1339 aa23.03■■□□□ 1.28
SLC20A1-201ENST00000272542 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.03■■□□□ 1.28
SLC20A1-201ENST00000272542 GRIN2BQ13224 1484 aa23.02■■□□□ 1.28
SLC20A1-201ENST00000272542 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
SLC20A1-201ENST00000272542 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
SLC20A1-201ENST00000272542 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
SLC20A1-201ENST00000272542 PTPRKQ15262 1439 aa22.99■■□□□ 1.27
SLC20A1-201ENST00000272542 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.99■■□□□ 1.27
SLC20A1-201ENST00000272542 SAMD9Q5K651 1589 aa22.99■■□□□ 1.27
SLC20A1-201ENST00000272542 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.98■■□□□ 1.27
SLC20A1-201ENST00000272542 PBRM1Q86U86 1689 aa22.98■■□□□ 1.27
SLC20A1-201ENST00000272542 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.96■■□□□ 1.27
SLC20A1-201ENST00000272542 NCOA2Q15596 1464 aa22.96■■□□□ 1.27
SLC20A1-201ENST00000272542 MAPKBP1O60336 1514 aa22.95■■□□□ 1.26
SLC20A1-201ENST00000272542 IFT140Q96RY7 1462 aa22.94■■□□□ 1.26
SLC20A1-201ENST00000272542 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SLC20A1-201ENST00000272542 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.93■■□□□ 1.26
SLC20A1-201ENST00000272542 ADAMTS12P58397 1594 aa22.93■■□□□ 1.26
SLC20A1-201ENST00000272542 IQGAP2Q13576 1575 aa22.92■■□□□ 1.26
SLC20A1-201ENST00000272542 WDR62O43379 1518 aa22.89■■□□□ 1.25
SLC20A1-201ENST00000272542 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.86■■□□□ 1.25
SLC20A1-201ENST00000272542 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.86■■□□□ 1.25
SLC20A1-201ENST00000272542 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
SLC20A1-201ENST00000272542 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
SLC20A1-201ENST00000272542 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
SLC20A1-201ENST00000272542 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.24
SLC20A1-201ENST00000272542 TRIM52Q96A61 297 aa22.81■■□□□ 1.24
SLC20A1-201ENST00000272542 GRIN2AQ12879 1464 aa22.81■■□□□ 1.24
SLC20A1-201ENST00000272542 FOXD1Q16676 465 aa22.79■■□□□ 1.24
SLC20A1-201ENST00000272542 JPH4Q96JJ6 628 aa22.78■■□□□ 1.24
SLC20A1-201ENST00000272542 DISP1Q96F81 1524 aa22.78■■□□□ 1.24
SLC20A1-201ENST00000272542 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.77■■□□□ 1.24
SLC20A1-201ENST00000272542 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.23
SLC20A1-201ENST00000272542 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
SLC20A1-201ENST00000272542 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.76■■□□□ 1.23
SLC20A1-201ENST00000272542 NAIPQ13075 1403 aa22.74■■□□□ 1.23
SLC20A1-201ENST00000272542 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.74■■□□□ 1.23
SLC20A1-201ENST00000272542 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
SLC20A1-201ENST00000272542 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.73■■□□□ 1.23
SLC20A1-201ENST00000272542 KCNH8Q96L42 1107 aa22.73■■□□□ 1.23
SLC20A1-201ENST00000272542 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
SLC20A1-201ENST00000272542 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.72■■□□□ 1.23
SLC20A1-201ENST00000272542 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.72■■□□□ 1.23
SLC20A1-201ENST00000272542 HFM1A2PYH4 1435 aa22.7■■□□□ 1.22
SLC20A1-201ENST00000272542 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.69■■□□□ 1.22
SLC20A1-201ENST00000272542 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
SLC20A1-201ENST00000272542 HECW1Q76N89 1606 aa22.69■■□□□ 1.22
SLC20A1-201ENST00000272542 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
SLC20A1-201ENST00000272542 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
SLC20A1-201ENST00000272542 CEP170Q5SW79 1584 aa22.66■■□□□ 1.22
SLC20A1-201ENST00000272542 KIAA0556O60303 1618 aa22.65■■□□□ 1.22
SLC20A1-201ENST00000272542 SYNJ2O15056 1496 aa22.64■■□□□ 1.22
SLC20A1-201ENST00000272542 TONSLQ96HA7 1378 aa22.64■■□□□ 1.21
SLC20A1-201ENST00000272542 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
SLC20A1-201ENST00000272542 ARHGEF11O15085 1522 aa22.62■■□□□ 1.21
SLC20A1-201ENST00000272542 UACAQ9BZF9 1416 aa22.61■■□□□ 1.21
SLC20A1-201ENST00000272542 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
SLC20A1-201ENST00000272542 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
SLC20A1-201ENST00000272542 KDM6BO15054 1643 aa22.59■■□□□ 1.21
SLC20A1-201ENST00000272542 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.57■■□□□ 1.2
SLC20A1-201ENST00000272542 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.52■■□□□ 1.2
SLC20A1-201ENST00000272542 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.51■■□□□ 1.19
SLC20A1-201ENST00000272542 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.5■■□□□ 1.19
SLC20A1-201ENST00000272542 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
SLC20A1-201ENST00000272542 ABCC5O15440 1437 aa22.49■■□□□ 1.19
SLC20A1-201ENST00000272542 NUP160Q12769 1436 aa22.49■■□□□ 1.19
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