RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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UBE2B-201ENST00000265339 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.94■■■□□ 2.7
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UBE2B-201ENST00000265339 CEP170Q5SW79 1584 aa31.85■■■□□ 2.69
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UBE2B-201ENST00000265339 SAMD9Q5K651 1589 aa31.67■■■□□ 2.66
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UBE2B-201ENST00000265339 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.74■■■□□ 2.51
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UBE2B-201ENST00000265339 PHLDB1Q86UU1 1377 aa30.69■■■□□ 2.5
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UBE2B-201ENST00000265339 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP30.38■■■□□ 2.45
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UBE2B-201ENST00000265339 TTC37Q6PGP7 1564 aa30.38■■■□□ 2.45
UBE2B-201ENST00000265339 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP30.38■■■□□ 2.459e-7■■■□□ 17.5
UBE2B-201ENST00000265339 MIA2Q96PC5 1412 aa30.37■■■□□ 2.45
UBE2B-201ENST00000265339 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP30.36■■■□□ 2.45
UBE2B-201ENST00000265339 KCNH8Q96L42 1107 aa30.35■■■□□ 2.45
UBE2B-201ENST00000265339 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP30.34■■■□□ 2.45
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