RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264938.7

SLC9A3-201, Transcript of solute carrier family 9 member A3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC9A3, Length 2,584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3-201ENST00000264938 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa32.91■■■□□ 2.86
SLC9A3-201ENST00000264938 MSH5O43196 834 aa32.87■■■□□ 2.85
SLC9A3-201ENST00000264938 SETD5Q9C0A6 1442 aa32.84■■■□□ 2.85
SLC9A3-201ENST00000264938 CCER2I3L3R5 266 aa32.79■■■□□ 2.84
SLC9A3-201ENST00000264938 ANP32CO43423 234 aa32.74■■■□□ 2.83
SLC9A3-201ENST00000264938 KIF27Q86VH2 1401 aa32.73■■■□□ 2.83
SLC9A3-201ENST00000264938 CUX1P39880 1505 aa32.7■■■□□ 2.82
SLC9A3-201ENST00000264938 TIAM1Q13009 1591 aa32.66■■■□□ 2.82
SLC9A3-201ENST00000264938 PHLDB1Q86UU1 1377 aa32.66■■■□□ 2.82
SLC9A3-201ENST00000264938 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP32.65■■■□□ 2.82
SLC9A3-201ENST00000264938 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa32.6■■■□□ 2.81
SLC9A3-201ENST00000264938 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa32.58■■■□□ 2.81
SLC9A3-201ENST00000264938 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP32.55■■■□□ 2.8
SLC9A3-201ENST00000264938 MAP3K1Q13233 1512 aa32.55■■■□□ 2.8
SLC9A3-201ENST00000264938 FANCIQ9NVI1 1328 aa32.54■■■□□ 2.8
SLC9A3-201ENST00000264938 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP32.45■■■□□ 2.79
SLC9A3-201ENST00000264938 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP32.43■■■□□ 2.78
SLC9A3-201ENST00000264938 IGF1RP08069 1367 aa32.38■■■□□ 2.77
SLC9A3-201ENST00000264938 ERICH6Q7L0X2 663 aa32.38■■■□□ 2.77
SLC9A3-201ENST00000264938 TONSLQ96HA7 1378 aa32.34■■■□□ 2.77
SLC9A3-201ENST00000264938 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP32.32■■■□□ 2.76
SLC9A3-201ENST00000264938 P3H3Q8IVL6 736 aa32.31■■■□□ 2.76
SLC9A3-201ENST00000264938 CFAP43Q8NDM7 1665 aa32.28■■■□□ 2.76
SLC9A3-201ENST00000264938 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP32.26■■■□□ 2.75
SLC9A3-201ENST00000264938 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa32.25■■■□□ 2.75
SLC9A3-201ENST00000264938 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.23■■■□□ 2.75
SLC9A3-201ENST00000264938 CFTRP13569 1480 aa32.19■■■□□ 2.74
SLC9A3-201ENST00000264938 PPP4R2Q9NY27 417 aa32.17■■■□□ 2.74
SLC9A3-201ENST00000264938 CCDC18Q5T9S5 1454 aa32.14■■■□□ 2.74
SLC9A3-201ENST00000264938 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP32.13■■■□□ 2.73
SLC9A3-201ENST00000264938 CCDC184Q52MB2 194 aa32.13■■■□□ 2.73
SLC9A3-201ENST00000264938 ERICH6BQ5W0A0 696 aa32.12■■■□□ 2.73
SLC9A3-201ENST00000264938 WASHC2AQ641Q2 1341 aa32.11■■■□□ 2.73
SLC9A3-201ENST00000264938 NCAPD3P42695 1498 aa32.1■■■□□ 2.73
SLC9A3-201ENST00000264938 HMGXB3Q12766 1538 aa32.1■■■□□ 2.73
SLC9A3-201ENST00000264938 KDM5BQ9UGL1 1544 aa32.1■■■□□ 2.73
SLC9A3-201ENST00000264938 DEKP35659 375 aaKnown RBP32.1■■■□□ 2.73
SLC9A3-201ENST00000264938 FHOD3Q2V2M9 1422 aa32.09■■■□□ 2.73
SLC9A3-201ENST00000264938 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa32.09■■■□□ 2.73
SLC9A3-201ENST00000264938 PTPRKQ15262 1439 aa32.08■■■□□ 2.73
SLC9A3-201ENST00000264938 UACAQ9BZF9 1416 aa32.08■■■□□ 2.73
SLC9A3-201ENST00000264938 FGD6Q6ZV73 1430 aa32.04■■■□□ 2.72
SLC9A3-201ENST00000264938 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP32.04■■■□□ 2.72
SLC9A3-201ENST00000264938 MYT1LQ9UL68 1186 aa32.01■■■□□ 2.72
SLC9A3-201ENST00000264938 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP32.01■■■□□ 2.71
SLC9A3-201ENST00000264938 HFM1A2PYH4 1435 aa32.01■■■□□ 2.71
SLC9A3-201ENST00000264938 FYCO1Q9BQS8 1478 aa31.99■■■□□ 2.71
SLC9A3-201ENST00000264938 PTPN23Q9H3S7 1636 aa31.99■■■□□ 2.71
SLC9A3-201ENST00000264938 FGD5Q6ZNL6 1462 aa31.97■■■□□ 2.71
SLC9A3-201ENST00000264938 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa31.96■■■□□ 2.71
SLC9A3-201ENST00000264938 FAM9BQ8IZU0 186 aa31.95■■■□□ 2.7
SLC9A3-201ENST00000264938 NAIPQ13075 1403 aa31.93■■■□□ 2.7
SLC9A3-201ENST00000264938 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP31.9■■■□□ 2.7
SLC9A3-201ENST00000264938 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP31.89■■■□□ 2.7
SLC9A3-201ENST00000264938 NBR1Q14596 966 aa31.88■■■□□ 2.69
SLC9A3-201ENST00000264938 NCOA2Q15596 1464 aa31.87■■■□□ 2.69
SLC9A3-201ENST00000264938 CNTLNQ9NXG0 1405 aa31.87■■■□□ 2.69
SLC9A3-201ENST00000264938 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP31.87■■■□□ 2.69
SLC9A3-201ENST00000264938 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP31.86■■■□□ 2.69
SLC9A3-201ENST00000264938 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP31.84■■■□□ 2.69
SLC9A3-201ENST00000264938 PRDM2Q13029 1718 aa31.84■■■□□ 2.69
SLC9A3-201ENST00000264938 ZBED9Q6R2W3 1325 aa31.84■■■□□ 2.69
SLC9A3-201ENST00000264938 MRS2Q9HD23 443 aa31.83■■■□□ 2.69
SLC9A3-201ENST00000264938 MTUS2Q5JR59 1369 aa31.81■■■□□ 2.68
SLC9A3-201ENST00000264938 EFCAB5A4FU69 1503 aa31.78■■■□□ 2.68
SLC9A3-201ENST00000264938 FMN1Q68DA7 1419 aa31.77■■■□□ 2.68
SLC9A3-201ENST00000264938 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP31.75■■■□□ 2.67
SLC9A3-201ENST00000264938 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa31.74■■■□□ 2.67
SLC9A3-201ENST00000264938 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.73■■■□□ 2.67
SLC9A3-201ENST00000264938 CCDC7Q96M83 1385 aa31.73■■■□□ 2.67
SLC9A3-201ENST00000264938 NCOA1Q15788 1441 aa31.7■■■□□ 2.66
SLC9A3-201ENST00000264938 MYOM3Q5VTT5 1437 aa31.7■■■□□ 2.66
SLC9A3-201ENST00000264938 CHIC2Q9UKJ5 165 aa31.68■■■□□ 2.66
SLC9A3-201ENST00000264938 L3MBTL2Q969R5 705 aa31.67■■■□□ 2.66
SLC9A3-201ENST00000264938 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.66■■■□□ 2.66
SLC9A3-201ENST00000264938 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa31.66■■■□□ 2.66
SLC9A3-201ENST00000264938 AKNAQ7Z591 1439 aa31.65■■■□□ 2.66
SLC9A3-201ENST00000264938 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.61■■■□□ 2.65
SLC9A3-201ENST00000264938 FOXD1Q16676 465 aa31.6■■■□□ 2.65
SLC9A3-201ENST00000264938 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP31.6■■■□□ 2.65
SLC9A3-201ENST00000264938 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa31.59■■■□□ 2.65
SLC9A3-201ENST00000264938 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP31.58■■■□□ 2.65
SLC9A3-201ENST00000264938 KDM6BO15054 1643 aa31.58■■■□□ 2.65
SLC9A3-201ENST00000264938 NBPF8Q3BBV2 869 aa31.56■■■□□ 2.64
SLC9A3-201ENST00000264938 HECW1Q76N89 1606 aa31.56■■■□□ 2.64
SLC9A3-201ENST00000264938 MPHOSPH9Q99550 1183 aa31.55■■■□□ 2.64
SLC9A3-201ENST00000264938 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP31.55■■■□□ 2.64
SLC9A3-201ENST00000264938 KIF7Q2M1P5 1343 aa31.55■■■□□ 2.64
SLC9A3-201ENST00000264938 CCDC136Q96JN2 1154 aa31.55■■■□□ 2.64
SLC9A3-201ENST00000264938 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP31.54■■■□□ 2.64
SLC9A3-201ENST00000264938 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP31.53■■■□□ 2.64
SLC9A3-201ENST00000264938 RNF123Q5XPI4 1314 aa31.49■■■□□ 2.63
SLC9A3-201ENST00000264938 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa31.49■■■□□ 2.63
SLC9A3-201ENST00000264938 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP31.49■■■□□ 2.63
SLC9A3-201ENST00000264938 GCC2Q8IWJ2 1684 aa31.49■■■□□ 2.63
SLC9A3-201ENST00000264938 NUDCQ9Y266 331 aa31.49■■■□□ 2.63
SLC9A3-201ENST00000264938 GRIN2BQ13224 1484 aa31.48■■■□□ 2.63
SLC9A3-201ENST00000264938 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP31.48■■■□□ 2.63
SLC9A3-201ENST00000264938 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.47■■■□□ 2.63
SLC9A3-201ENST00000264938 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP31.47■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms