RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262605.8

TTPAL-201, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPAL, Length 6,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-201ENST00000262605 CUX1P39880 1505 aa14.67□□□□□ -0.06
TTPAL-201ENST00000262605 FHAD1B1AJZ9 1412 aa14.66□□□□□ -0.06
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TTPAL-201ENST00000262605 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
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TTPAL-201ENST00000262605 IGF1RP08069 1367 aa14.64□□□□□ -0.07
TTPAL-201ENST00000262605 PEG3Q9GZU2 1588 aa14.63□□□□□ -0.07
TTPAL-201ENST00000262605 TOP2BQ02880 1626 aa14.63□□□□□ -0.07
TTPAL-201ENST00000262605 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TTPAL-201ENST00000262605 TONSLQ96HA7 1378 aa14.62□□□□□ -0.07
TTPAL-201ENST00000262605 CCNB3Q8WWL7 1395 aa14.6□□□□□ -0.07
TTPAL-201ENST00000262605 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.07
TTPAL-201ENST00000262605 GAPVD1Q14C86 1478 aa14.59□□□□□ -0.07
TTPAL-201ENST00000262605 NEFLP07196 543 aa14.59□□□□□ -0.07
TTPAL-201ENST00000262605 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
TTPAL-201ENST00000262605 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
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TTPAL-201ENST00000262605 TSPY10P0CW01 314 aa14.57□□□□□ -0.08
TTPAL-201ENST00000262605 TOPBP1Q92547 1522 aa14.54□□□□□ -0.08
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TTPAL-201ENST00000262605 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
TTPAL-201ENST00000262605 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa14.49□□□□□ -0.09
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TTPAL-201ENST00000262605 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa14.39□□□□□ -0.11
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TTPAL-201ENST00000262605 PHLDB1Q86UU1 1377 aa14.27□□□□□ -0.12
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TTPAL-201ENST00000262605 FAM9BQ8IZU0 186 aa14.23□□□□□ -0.13
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TTPAL-201ENST00000262605 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
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TTPAL-201ENST00000262605 ERICH6Q7L0X2 663 aa14.19□□□□□ -0.14
TTPAL-201ENST00000262605 EFCAB5A4FU69 1503 aa14.18□□□□□ -0.14
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TTPAL-201ENST00000262605 FGD6Q6ZV73 1430 aa14.17□□□□□ -0.14
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TTPAL-201ENST00000262605 CARD11Q9BXL7 1154 aa14.17□□□□□ -0.14
TTPAL-201ENST00000262605 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP14.16□□□□□ -0.14
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TTPAL-201ENST00000262605 DCAF11Q8TEB1 546 aa14.16□□□□□ -0.14
TTPAL-201ENST00000262605 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP14.16□□□□□ -0.14
TTPAL-201ENST00000262605 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa14.16□□□□□ -0.14
TTPAL-201ENST00000262605 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa14.16□□□□□ -0.14
TTPAL-201ENST00000262605 NUP155O75694 1391 aa14.16□□□□□ -0.14
TTPAL-201ENST00000262605 TIAM1Q13009 1591 aa14.15□□□□□ -0.14
TTPAL-201ENST00000262605 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa14.15□□□□□ -0.14
TTPAL-201ENST00000262605 MYOM3Q5VTT5 1437 aa14.14□□□□□ -0.15
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TTPAL-201ENST00000262605 GGT6Q6P531 493 aa14.12□□□□□ -0.15
TTPAL-201ENST00000262605 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP14.12□□□□□ -0.15
TTPAL-201ENST00000262605 MRS2Q9HD23 443 aa14.12□□□□□ -0.15
TTPAL-201ENST00000262605 CYB5RLQ6IPT4 315 aa14.11□□□□□ -0.15
TTPAL-201ENST00000262605 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
TTPAL-201ENST00000262605 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
TTPAL-201ENST00000262605 TRHP20396 242 aaPredicted RBP14.08□□□□□ -0.15
TTPAL-201ENST00000262605 HECW1Q76N89 1606 aa14.08□□□□□ -0.16
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