RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259467.8

PDCL-201, Transcript of phosducin like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDCL, Length 2,813 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL-201ENST00000259467 PBRM1Q86U86 1689 aa15.07■□□□□ 0
PDCL-201ENST00000259467 ARAP1Q96P48 1450 aa15.06■□□□□ 0
PDCL-201ENST00000259467 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
PDCL-201ENST00000259467 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
PDCL-201ENST00000259467 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
PDCL-201ENST00000259467 ADAMTS12P58397 1594 aa14.98□□□□□ -0.01
PDCL-201ENST00000259467 FHAD1B1AJZ9 1412 aa14.98□□□□□ -0.01
PDCL-201ENST00000259467 CUL7Q14999 1698 aa14.95□□□□□ -0.02
PDCL-201ENST00000259467 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa14.95□□□□□ -0.02
PDCL-201ENST00000259467 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
PDCL-201ENST00000259467 SYNJ2O15056 1496 aa14.93□□□□□ -0.02
PDCL-201ENST00000259467 P3H3Q8IVL6 736 aa14.93□□□□□ -0.02
PDCL-201ENST00000259467 GRIN2AQ12879 1464 aa14.92□□□□□ -0.02
PDCL-201ENST00000259467 MAP3K1Q13233 1512 aa14.9□□□□□ -0.02
PDCL-201ENST00000259467 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
PDCL-201ENST00000259467 CHD1O14646 1710 aa14.9□□□□□ -0.02
PDCL-201ENST00000259467 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
PDCL-201ENST00000259467 CEP170Q5SW79 1584 aa14.86□□□□□ -0.03
PDCL-201ENST00000259467 APLP2Q06481 763 aa14.85□□□□□ -0.03
PDCL-201ENST00000259467 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
PDCL-201ENST00000259467 TIAM1Q13009 1591 aa14.8□□□□□ -0.04
PDCL-201ENST00000259467 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa14.8□□□□□ -0.04
PDCL-201ENST00000259467 NUP160Q12769 1436 aa14.8□□□□□ -0.04
PDCL-201ENST00000259467 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
PDCL-201ENST00000259467 CFAP43Q8NDM7 1665 aa14.79□□□□□ -0.04
PDCL-201ENST00000259467 JPH4Q96JJ6 628 aa14.78□□□□□ -0.04
PDCL-201ENST00000259467 OSCARQ8IYS5 282 aa14.77□□□□□ -0.04
PDCL-201ENST00000259467 EFCAB5A4FU69 1503 aa14.76□□□□□ -0.05
PDCL-201ENST00000259467 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa14.76□□□□□ -0.05
PDCL-201ENST00000259467 CLSPNQ9HAW4 1339 aa14.76□□□□□ -0.05
PDCL-201ENST00000259467 FHOD3Q2V2M9 1422 aa14.76□□□□□ -0.05
PDCL-201ENST00000259467 IQGAP2Q13576 1575 aa14.75□□□□□ -0.05
PDCL-201ENST00000259467 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PDCL-201ENST00000259467 ARID3CA6NKF2 412 aa14.73□□□□□ -0.05
PDCL-201ENST00000259467 MYT1Q01538 1121 aa14.72□□□□□ -0.05
PDCL-201ENST00000259467 ERCC6L2Q5T890 1561 aa14.72□□□□□ -0.05
PDCL-201ENST00000259467 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
PDCL-201ENST00000259467 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
PDCL-201ENST00000259467 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa14.7□□□□□ -0.06
PDCL-201ENST00000259467 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PDCL-201ENST00000259467 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PDCL-201ENST00000259467 CCNB3Q8WWL7 1395 aa14.69□□□□□ -0.06
PDCL-201ENST00000259467 DISP1Q96F81 1524 aa14.68□□□□□ -0.06
PDCL-201ENST00000259467 SAMD9Q5K651 1589 aa14.67□□□□□ -0.06
PDCL-201ENST00000259467 FYCO1Q9BQS8 1478 aa14.67□□□□□ -0.06
PDCL-201ENST00000259467 CLASP1Q7Z460 1538 aa14.67□□□□□ -0.06
PDCL-201ENST00000259467 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PDCL-201ENST00000259467 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
PDCL-201ENST00000259467 UGGT2Q9NYU1 1516 aa14.64□□□□□ -0.07
PDCL-201ENST00000259467 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa14.64□□□□□ -0.07
PDCL-201ENST00000259467 KIAA0556O60303 1618 aa14.61□□□□□ -0.07
PDCL-201ENST00000259467 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa14.6□□□□□ -0.07
PDCL-201ENST00000259467 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PDCL-201ENST00000259467 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.07
PDCL-201ENST00000259467 PHLDB1Q86UU1 1377 aa14.58□□□□□ -0.08
PDCL-201ENST00000259467 SHROOM2Q13796 1616 aa14.58□□□□□ -0.08
PDCL-201ENST00000259467 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa14.58□□□□□ -0.08
PDCL-201ENST00000259467 PLB1Q6P1J6 1458 aa14.57□□□□□ -0.08
PDCL-201ENST00000259467 FMN1Q68DA7 1419 aa14.57□□□□□ -0.08
PDCL-201ENST00000259467 PTPRGP23470 1445 aa14.55□□□□□ -0.08
PDCL-201ENST00000259467 MAPKBP1O60336 1514 aa14.54□□□□□ -0.08
PDCL-201ENST00000259467 CYB5RLQ6IPT4 315 aa14.53□□□□□ -0.08
PDCL-201ENST00000259467 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
PDCL-201ENST00000259467 ARHGEF11O15085 1522 aa14.51□□□□□ -0.09
PDCL-201ENST00000259467 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa14.5□□□□□ -0.09
PDCL-201ENST00000259467 SETD5Q9C0A6 1442 aa14.5□□□□□ -0.09
PDCL-201ENST00000259467 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
PDCL-201ENST00000259467 NEUROD1Q13562 356 aa14.47□□□□□ -0.09
PDCL-201ENST00000259467 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa14.46□□□□□ -0.1
PDCL-201ENST00000259467 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa14.46□□□□□ -0.1
PDCL-201ENST00000259467 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa14.46□□□□□ -0.1
PDCL-201ENST00000259467 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
PDCL-201ENST00000259467 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
PDCL-201ENST00000259467 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa14.44□□□□□ -0.1
PDCL-201ENST00000259467 FGD6Q6ZV73 1430 aa14.44□□□□□ -0.1
PDCL-201ENST00000259467 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa14.43□□□□□ -0.1
PDCL-201ENST00000259467 UACAQ9BZF9 1416 aa14.42□□□□□ -0.1
PDCL-201ENST00000259467 ABCA8O94911 1581 aa14.41□□□□□ -0.1
PDCL-201ENST00000259467 CCDC18Q5T9S5 1454 aa14.41□□□□□ -0.1
PDCL-201ENST00000259467 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP14.41□□□□□ -0.1
PDCL-201ENST00000259467 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa14.41□□□□□ -0.1
PDCL-201ENST00000259467 HECW1Q76N89 1606 aa14.4□□□□□ -0.1
PDCL-201ENST00000259467 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa14.39□□□□□ -0.11
PDCL-201ENST00000259467 NCOA2Q15596 1464 aa14.39□□□□□ -0.11
PDCL-201ENST00000259467 ATP10BO94823 1461 aa14.38□□□□□ -0.11
PDCL-201ENST00000259467 MIER1Q8N108 512 aa14.37□□□□□ -0.11
PDCL-201ENST00000259467 MYOM3Q5VTT5 1437 aa14.37□□□□□ -0.11
PDCL-201ENST00000259467 KCNH8Q96L42 1107 aa14.37□□□□□ -0.11
PDCL-201ENST00000259467 ADCY10Q96PN6 1610 aa14.37□□□□□ -0.11
PDCL-201ENST00000259467 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP14.36□□□□□ -0.11
PDCL-201ENST00000259467 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa14.36□□□□□ -0.11
PDCL-201ENST00000259467 PTPN23Q9H3S7 1636 aa14.36□□□□□ -0.11
PDCL-201ENST00000259467 HFM1A2PYH4 1435 aa14.36□□□□□ -0.11
PDCL-201ENST00000259467 ABCC2Q92887 1545 aa14.35□□□□□ -0.11
PDCL-201ENST00000259467 MTUS2Q5JR59 1369 aa14.35□□□□□ -0.11
PDCL-201ENST00000259467 PTPRKQ15262 1439 aa14.34□□□□□ -0.11
PDCL-201ENST00000259467 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa14.34□□□□□ -0.11
PDCL-201ENST00000259467 ITGAEP38570 1179 aa14.33□□□□□ -0.11
PDCL-201ENST00000259467 GCC2Q8IWJ2 1684 aa14.32□□□□□ -0.12
PDCL-201ENST00000259467 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 230 ms