RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000257604.9

TRAFD1-201, Transcript of TRAF-type zinc finger domain containing 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 2 BASIC

Gene TRAFD1, Length 3,178 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAFD1-201ENST00000257604 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
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TRAFD1-201ENST00000257604 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.63■■□□□ 1.057e-7■■■■□ 20.9
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TRAFD1-201ENST00000257604 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.57■■□□□ 1.04
TRAFD1-201ENST00000257604 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.56■■□□□ 1.04
TRAFD1-201ENST00000257604 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.56■■□□□ 1.04
TRAFD1-201ENST00000257604 ERCC6Q03468 1493 aa21.53■■□□□ 1.04
TRAFD1-201ENST00000257604 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.52■■□□□ 1.04
TRAFD1-201ENST00000257604 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.52■■□□□ 1.04
TRAFD1-201ENST00000257604 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
TRAFD1-201ENST00000257604 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
TRAFD1-201ENST00000257604 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.44■■□□□ 1.02
TRAFD1-201ENST00000257604 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.43■■□□□ 1.02
TRAFD1-201ENST00000257604 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.42■■□□□ 1.02
TRAFD1-201ENST00000257604 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.42■■□□□ 1.02
TRAFD1-201ENST00000257604 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
TRAFD1-201ENST00000257604 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
TRAFD1-201ENST00000257604 SIN3AQ96ST3 1273 aa21.35■■□□□ 1.01
TRAFD1-201ENST00000257604 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.34■■□□□ 1.01
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TRAFD1-201ENST00000257604 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
TRAFD1-201ENST00000257604 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.33■■□□□ 1
TRAFD1-201ENST00000257604 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.32■■□□□ 1
TRAFD1-201ENST00000257604 TIAM1Q13009 1591 aa21.31■■□□□ 1
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TRAFD1-201ENST00000257604 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
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TRAFD1-201ENST00000257604 MIER1Q8N108 512 aa21.27■■□□□ 1
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TRAFD1-201ENST00000257604 CUL7Q14999 1698 aa21.23■□□□□ 0.99
TRAFD1-201ENST00000257604 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
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TRAFD1-201ENST00000257604 GRIN2BQ13224 1484 aa21.19■□□□□ 0.98
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TRAFD1-201ENST00000257604 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.16■□□□□ 0.98
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TRAFD1-201ENST00000257604 WDR97A6NE52 1622 aa21.12■□□□□ 0.97
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TRAFD1-201ENST00000257604 IFT140Q96RY7 1462 aa21.11■□□□□ 0.97
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TRAFD1-201ENST00000257604 SAMD9Q5K651 1589 aa20.93■□□□□ 0.94
TRAFD1-201ENST00000257604 PLB1Q6P1J6 1458 aa20.91■□□□□ 0.94
TRAFD1-201ENST00000257604 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa20.91■□□□□ 0.94
TRAFD1-201ENST00000257604 TONSLQ96HA7 1378 aa20.9■□□□□ 0.94
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TRAFD1-201ENST00000257604 HFM1A2PYH4 1435 aa20.74■□□□□ 0.91
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