RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000257468.11

UBQLN1-201, Transcript of ubiquilin 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene UBQLN1, Length 2,299 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN1-201ENST00000257468 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
UBQLN1-201ENST00000257468 CUL7Q14999 1698 aa24.53■■□□□ 1.52
UBQLN1-201ENST00000257468 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
UBQLN1-201ENST00000257468 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.53■■□□□ 1.52
UBQLN1-201ENST00000257468 MAP3K1Q13233 1512 aa24.52■■□□□ 1.52
UBQLN1-201ENST00000257468 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.5■■□□□ 1.51
UBQLN1-201ENST00000257468 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
UBQLN1-201ENST00000257468 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.49■■□□□ 1.51
UBQLN1-201ENST00000257468 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
UBQLN1-201ENST00000257468 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.48■■□□□ 1.51
UBQLN1-201ENST00000257468 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.46■■□□□ 1.51
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UBQLN1-201ENST00000257468 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.44■■□□□ 1.5
UBQLN1-201ENST00000257468 CLSPNQ9HAW4 1339 aa24.42■■□□□ 1.5
UBQLN1-201ENST00000257468 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.42■■□□□ 1.5
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UBQLN1-201ENST00000257468 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.4■■□□□ 1.5
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UBQLN1-201ENST00000257468 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
UBQLN1-201ENST00000257468 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.36■■□□□ 1.49
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UBQLN1-201ENST00000257468 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.34■■□□□ 1.49
UBQLN1-201ENST00000257468 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.34■■□□□ 1.49
UBQLN1-201ENST00000257468 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
UBQLN1-201ENST00000257468 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.3■■□□□ 1.486e-7■■■□□ 18.2
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UBQLN1-201ENST00000257468 WDR62O43379 1518 aa24.27■■□□□ 1.48
UBQLN1-201ENST00000257468 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.27■■□□□ 1.48
UBQLN1-201ENST00000257468 FMN1Q68DA7 1419 aa24.26■■□□□ 1.47
UBQLN1-201ENST00000257468 SAMD9Q5K651 1589 aa24.26■■□□□ 1.47
UBQLN1-201ENST00000257468 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.23■■□□□ 1.47
UBQLN1-201ENST00000257468 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
UBQLN1-201ENST00000257468 MAPKBP1O60336 1514 aa24.22■■□□□ 1.47
UBQLN1-201ENST00000257468 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.22■■□□□ 1.47
UBQLN1-201ENST00000257468 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
UBQLN1-201ENST00000257468 PBRM1Q86U86 1689 aa24.18■■□□□ 1.46
UBQLN1-201ENST00000257468 IFT140Q96RY7 1462 aa24.14■■□□□ 1.45
UBQLN1-201ENST00000257468 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.13■■□□□ 1.45
UBQLN1-201ENST00000257468 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
UBQLN1-201ENST00000257468 GRIN2BQ13224 1484 aa24.13■■□□□ 1.45
UBQLN1-201ENST00000257468 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.11■■□□□ 1.45
UBQLN1-201ENST00000257468 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa24.1■■□□□ 1.45
UBQLN1-201ENST00000257468 ERCC6Q03468 1493 aa24.08■■□□□ 1.45
UBQLN1-201ENST00000257468 ADAMTS12P58397 1594 aa24.08■■□□□ 1.44
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UBQLN1-201ENST00000257468 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.05■■□□□ 1.44
UBQLN1-201ENST00000257468 NCOA2Q15596 1464 aa24.04■■□□□ 1.44
UBQLN1-201ENST00000257468 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
UBQLN1-201ENST00000257468 IQGAP2Q13576 1575 aa24.03■■□□□ 1.44
UBQLN1-201ENST00000257468 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.01■■□□□ 1.43
UBQLN1-201ENST00000257468 PTPRKQ15262 1439 aa24■■□□□ 1.43
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UBQLN1-201ENST00000257468 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.98■■□□□ 1.43
UBQLN1-201ENST00000257468 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.97■■□□□ 1.43
UBQLN1-201ENST00000257468 HECW1Q76N89 1606 aa23.93■■□□□ 1.42
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UBQLN1-201ENST00000257468 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.92■■□□□ 1.42
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UBQLN1-201ENST00000257468 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.92■■□□□ 1.42
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UBQLN1-201ENST00000257468 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.9■■□□□ 1.42
UBQLN1-201ENST00000257468 ARHGEF11O15085 1522 aa23.89■■□□□ 1.42
UBQLN1-201ENST00000257468 HFM1A2PYH4 1435 aa23.88■■□□□ 1.41
UBQLN1-201ENST00000257468 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
UBQLN1-201ENST00000257468 NAIPQ13075 1403 aa23.84■■□□□ 1.41
UBQLN1-201ENST00000257468 UACAQ9BZF9 1416 aa23.8■■□□□ 1.4
UBQLN1-201ENST00000257468 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
UBQLN1-201ENST00000257468 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.79■■□□□ 1.4
UBQLN1-201ENST00000257468 DISP1Q96F81 1524 aa23.78■■□□□ 1.4
UBQLN1-201ENST00000257468 KIAA0556O60303 1618 aa23.78■■□□□ 1.4
UBQLN1-201ENST00000257468 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.78■■□□□ 1.4
UBQLN1-201ENST00000257468 GRIN2AQ12879 1464 aa23.78■■□□□ 1.4
UBQLN1-201ENST00000257468 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.77■■□□□ 1.4
UBQLN1-201ENST00000257468 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
UBQLN1-201ENST00000257468 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
UBQLN1-201ENST00000257468 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.75■■□□□ 1.39
UBQLN1-201ENST00000257468 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
UBQLN1-201ENST00000257468 TONSLQ96HA7 1378 aa23.7■■□□□ 1.38
UBQLN1-201ENST00000257468 KDM6BO15054 1643 aa23.69■■□□□ 1.38
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UBQLN1-201ENST00000257468 GCC2Q8IWJ2 1684 aa23.68■■□□□ 1.38
UBQLN1-201ENST00000257468 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
UBQLN1-201ENST00000257468 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.67■■□□□ 1.38
UBQLN1-201ENST00000257468 MIA2Q96PC5 1412 aa23.66■■□□□ 1.38
UBQLN1-201ENST00000257468 KCNH8Q96L42 1107 aa23.66■■□□□ 1.38
UBQLN1-201ENST00000257468 CEP170Q5SW79 1584 aa23.66■■□□□ 1.38
UBQLN1-201ENST00000257468 FBLN2P98095 1184 aa23.64■■□□□ 1.38
UBQLN1-201ENST00000257468 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
UBQLN1-201ENST00000257468 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
UBQLN1-201ENST00000257468 TRIM52Q96A61 297 aa23.61■■□□□ 1.37
UBQLN1-201ENST00000257468 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
UBQLN1-201ENST00000257468 NUP160Q12769 1436 aa23.58■■□□□ 1.37
UBQLN1-201ENST00000257468 AKNAQ7Z591 1439 aa23.58■■□□□ 1.37
UBQLN1-201ENST00000257468 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.57■■□□□ 1.36
UBQLN1-201ENST00000257468 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.57■■□□□ 1.36
UBQLN1-201ENST00000257468 DAPK1P53355 1430 aa23.55■■□□□ 1.36
UBQLN1-201ENST00000257468 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
UBQLN1-201ENST00000257468 ABCC5O15440 1437 aa23.52■■□□□ 1.36
UBQLN1-201ENST00000257468 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
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