RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.32■■■■■ 4.37
CAPNS1-201ENST00000246533 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.32■■■■■ 4.37
CAPNS1-201ENST00000246533 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.32■■■■■ 4.37
CAPNS1-201ENST00000246533 JPH4Q96JJ6 628 aa42.2■■■■■ 4.35
CAPNS1-201ENST00000246533 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.2■■■■■ 4.35
CAPNS1-201ENST00000246533 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa42.2■■■■■ 4.35
CAPNS1-201ENST00000246533 EHMT2Q96KQ7 1210 aa42.16■■■■■ 4.34
CAPNS1-201ENST00000246533 SHROOM2Q13796 1616 aa42.16■■■■■ 4.34
CAPNS1-201ENST00000246533 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.07■■■■■ 4.33
CAPNS1-201ENST00000246533 ARAP1Q96P48 1450 aa42.07■■■■■ 4.33
CAPNS1-201ENST00000246533 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.07■■■■■ 4.32
CAPNS1-201ENST00000246533 IQGAP2Q13576 1575 aa42.01■■■■■ 4.32
CAPNS1-201ENST00000246533 KIF21BO75037 1637 aa41.96■■■■■ 4.31
CAPNS1-201ENST00000246533 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.95■■■■■ 4.31
CAPNS1-201ENST00000246533 PCGF6Q9BYE7 350 aa41.9■■■■■ 4.3
CAPNS1-201ENST00000246533 DISP1Q96F81 1524 aa41.79■■■■■ 4.28
CAPNS1-201ENST00000246533 UGGT2Q9NYU1 1516 aa41.79■■■■■ 4.28
CAPNS1-201ENST00000246533 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.77■■■■■ 4.28
CAPNS1-201ENST00000246533 UBTFP17480 764 aaKnown RBP41.77■■■■■ 4.28
CAPNS1-201ENST00000246533 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP41.77■■■■■ 4.28
CAPNS1-201ENST00000246533 GOLGA3Q08378 1498 aa41.77■■■■■ 4.28
CAPNS1-201ENST00000246533 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa41.68■■■■■ 4.26
CAPNS1-201ENST00000246533 KIAA0556O60303 1618 aa41.63■■■■■ 4.26
CAPNS1-201ENST00000246533 P3H3Q8IVL6 736 aa41.63■■■■■ 4.25
CAPNS1-201ENST00000246533 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.59■■■■■ 4.25
CAPNS1-201ENST00000246533 PTPRGP23470 1445 aa41.58■■■■■ 4.25
CAPNS1-201ENST00000246533 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa41.5■■■■■ 4.23
CAPNS1-201ENST00000246533 SAMD9Q5K651 1589 aa41.45■■■■■ 4.23
CAPNS1-201ENST00000246533 ADCY10Q96PN6 1610 aa41.39■■■■■ 4.22
CAPNS1-201ENST00000246533 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP41.36■■■■■ 4.21
CAPNS1-201ENST00000246533 FHOD3Q2V2M9 1422 aa41.36■■■■■ 4.21
CAPNS1-201ENST00000246533 PLB1Q6P1J6 1458 aa41.31■■■■■ 4.2
CAPNS1-201ENST00000246533 UACAQ9BZF9 1416 aa41.29■■■■■ 4.2
CAPNS1-201ENST00000246533 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa41.27■■■■■ 4.2
CAPNS1-201ENST00000246533 EFCAB5A4FU69 1503 aa41.24■■■■■ 4.19
CAPNS1-201ENST00000246533 ABCC2Q92887 1545 aa41.18■■■■■ 4.18
CAPNS1-201ENST00000246533 ABCA8O94911 1581 aa41.16■■■■■ 4.18
CAPNS1-201ENST00000246533 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa41.16■■■■■ 4.18
CAPNS1-201ENST00000246533 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP41.13■■■■■ 4.17
CAPNS1-201ENST00000246533 ARID3CA6NKF2 412 aa41.12■■■■■ 4.17
CAPNS1-201ENST00000246533 CLIP1P30622 1438 aa41.09■■■■■ 4.17
CAPNS1-201ENST00000246533 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP41.07■■■■■ 4.17
CAPNS1-201ENST00000246533 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.06■■■■■ 4.16
CAPNS1-201ENST00000246533 KDM5BQ9UGL1 1544 aa41.02■■■■■ 4.16
CAPNS1-201ENST00000246533 CEP162Q5TB80 1403 aa41.01■■■■■ 4.16
CAPNS1-201ENST00000246533 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa41■■■■■ 4.15
CAPNS1-201ENST00000246533 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP40.98■■■■■ 4.15
CAPNS1-201ENST00000246533 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP40.97■■■■■ 4.15
CAPNS1-201ENST00000246533 MAPKBP1O60336 1514 aa40.94■■■■■ 4.14
CAPNS1-201ENST00000246533 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP40.92■■■■■ 4.14
CAPNS1-201ENST00000246533 ASXL2Q76L83 1435 aa40.9■■■■■ 4.14
CAPNS1-201ENST00000246533 ATP10BO94823 1461 aa40.9■■■■■ 4.14
CAPNS1-201ENST00000246533 FMN1Q68DA7 1419 aa40.89■■■■■ 4.14
CAPNS1-201ENST00000246533 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP40.87■■■■■ 4.13
CAPNS1-201ENST00000246533 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP40.79■■■■■ 4.12
CAPNS1-201ENST00000246533 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP40.79■■■■■ 4.12
CAPNS1-201ENST00000246533 KIF13AQ9H1H9 1805 aa40.78■■■■■ 4.12
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM69CQ0P6D2 419 aa40.78■■■■■ 4.12
CAPNS1-201ENST00000246533 ABCC10Q5T3U5 1492 aa40.78■■■■■ 4.12
CAPNS1-201ENST00000246533 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP40.73■■■■■ 4.11
CAPNS1-201ENST00000246533 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP40.73■■■■■ 4.11
CAPNS1-201ENST00000246533 DIP2BQ9P265 1576 aa40.73■■■■■ 4.11
CAPNS1-201ENST00000246533 KCNH8Q96L42 1107 aa40.69■■■■■ 4.1
CAPNS1-201ENST00000246533 WDR7Q9Y4E6 1490 aa40.68■■■■■ 4.1
CAPNS1-201ENST00000246533 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa40.68■■■■■ 4.1
CAPNS1-201ENST00000246533 HECW1Q76N89 1606 aa40.66■■■■■ 4.1
CAPNS1-201ENST00000246533 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa40.66■■■■■ 4.1
CAPNS1-201ENST00000246533 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP40.65■■■■■ 4.1
CAPNS1-201ENST00000246533 FYCO1Q9BQS8 1478 aa40.54■■■■■ 4.08
CAPNS1-201ENST00000246533 PLEKHD1A6NEE1 506 aa40.52■■■■■ 4.08
CAPNS1-201ENST00000246533 TSPOAP1O95153 1857 aa40.5■■■■■ 4.07
CAPNS1-201ENST00000246533 GLI2P10070 1586 aa40.48■■■■■ 4.07
CAPNS1-201ENST00000246533 VPS8Q8N3P4 1428 aa40.44■■■■■ 4.06
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC18Q5T9S5 1454 aa40.37■■■■■ 4.05
CAPNS1-201ENST00000246533 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa40.37■■■■■ 4.05
CAPNS1-201ENST00000246533 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa40.37■■■■■ 4.05
CAPNS1-201ENST00000246533 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP40.34■■■■■ 4.05
CAPNS1-201ENST00000246533 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP40.34■■■■■ 4.05
CAPNS1-201ENST00000246533 CD109Q6YHK3 1445 aa40.32■■■■■ 4.04
CAPNS1-201ENST00000246533 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP40.28■■■■■ 4.04
CAPNS1-201ENST00000246533 ABCA9Q8IUA7 1624 aa40.28■■■■■ 4.04
CAPNS1-201ENST00000246533 KIF14Q15058 1648 aa40.26■■■■■ 4.04
CAPNS1-201ENST00000246533 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP40.26■■■■■ 4.046e-24■■□□□ 13
CAPNS1-201ENST00000246533 CFAP43Q8NDM7 1665 aa40.26■■■■■ 4.04
CAPNS1-201ENST00000246533 TTC37Q6PGP7 1564 aa40.22■■■■■ 4.03
CAPNS1-201ENST00000246533 TIAM1Q13009 1591 aa40.12■■■■■ 4.01
CAPNS1-201ENST00000246533 MTUS2Q5JR59 1369 aa40.11■■■■■ 4.01
CAPNS1-201ENST00000246533 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP40.08■■■■■ 4.01
CAPNS1-201ENST00000246533 TEX14Q8IWB6 1497 aa40.06■■■■■ 4
CAPNS1-201ENST00000246533 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP40.06■■■■■ 4
CAPNS1-201ENST00000246533 PLCH2O75038 1416 aa39.98■■■■□ 3.99
CAPNS1-201ENST00000246533 KDM6BO15054 1643 aa39.97■■■■□ 3.99
CAPNS1-201ENST00000246533 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa39.96■■■■□ 3.99
CAPNS1-201ENST00000246533 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa39.96■■■■□ 3.99
CAPNS1-201ENST00000246533 MYO5CQ9NQX4 1742 aa39.94■■■■□ 3.98
CAPNS1-201ENST00000246533 MAP3K1Q13233 1512 aa39.94■■■■□ 3.98
CAPNS1-201ENST00000246533 FANCAO15360 1455 aa39.93■■■■□ 3.98
CAPNS1-201ENST00000246533 APLP2Q06481 763 aa39.92■■■■□ 3.98
CAPNS1-201ENST00000246533 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa39.89■■■■□ 3.98
CAPNS1-201ENST00000246533 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa39.88■■■■□ 3.97
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