RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243344.7

TTC21B-201, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 21B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC21B, Length 5,482 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21B-201ENST00000243344 TIAM1Q13009 1591 aa9.12□□□□□ -0.95
TTC21B-201ENST00000243344 CFAP43Q8NDM7 1665 aa9.12□□□□□ -0.95
TTC21B-201ENST00000243344 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa9.12□□□□□ -0.95
TTC21B-201ENST00000243344 WDR97A6NE52 1622 aa9.12□□□□□ -0.95
TTC21B-201ENST00000243344 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
TTC21B-201ENST00000243344 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
TTC21B-201ENST00000243344 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa9.11□□□□□ -0.95
TTC21B-201ENST00000243344 WDR62O43379 1518 aa9.11□□□□□ -0.95
TTC21B-201ENST00000243344 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa9.1□□□□□ -0.95
TTC21B-201ENST00000243344 ITGAEP38570 1179 aa9.1□□□□□ -0.95
TTC21B-201ENST00000243344 MIER1Q8N108 512 aa9.1□□□□□ -0.95
TTC21B-201ENST00000243344 P3H3Q8IVL6 736 aa9.09□□□□□ -0.95
TTC21B-201ENST00000243344 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
TTC21B-201ENST00000243344 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
TTC21B-201ENST00000243344 ERCC6Q03468 1493 aa9.07□□□□□ -0.96
TTC21B-201ENST00000243344 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa9.07□□□□□ -0.96
TTC21B-201ENST00000243344 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa9.06□□□□□ -0.96
TTC21B-201ENST00000243344 CCNB3Q8WWL7 1395 aa9.06□□□□□ -0.96
TTC21B-201ENST00000243344 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa9.05□□□□□ -0.96
TTC21B-201ENST00000243344 MAPKBP1O60336 1514 aa9.05□□□□□ -0.96
TTC21B-201ENST00000243344 CUL7Q14999 1698 aa9.05□□□□□ -0.96
TTC21B-201ENST00000243344 FHOD3Q2V2M9 1422 aa9.05□□□□□ -0.96
TTC21B-201ENST00000243344 PHLDB1Q86UU1 1377 aa9.05□□□□□ -0.96
TTC21B-201ENST00000243344 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa9.03□□□□□ -0.96
TTC21B-201ENST00000243344 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
TTC21B-201ENST00000243344 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
TTC21B-201ENST00000243344 IFT140Q96RY7 1462 aa9.02□□□□□ -0.97
TTC21B-201ENST00000243344 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa9.02□□□□□ -0.97
TTC21B-201ENST00000243344 MAP3K1Q13233 1512 aa9.01□□□□□ -0.97
TTC21B-201ENST00000243344 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
TTC21B-201ENST00000243344 PBRM1Q86U86 1689 aa9□□□□□ -0.97
TTC21B-201ENST00000243344 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
TTC21B-201ENST00000243344 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa8.97□□□□□ -0.97
TTC21B-201ENST00000243344 FYCO1Q9BQS8 1478 aa8.97□□□□□ -0.97
TTC21B-201ENST00000243344 SAMD9Q5K651 1589 aa8.97□□□□□ -0.97
TTC21B-201ENST00000243344 EFCAB5A4FU69 1503 aa8.97□□□□□ -0.97
TTC21B-201ENST00000243344 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
TTC21B-201ENST00000243344 FHAD1B1AJZ9 1412 aa8.95□□□□□ -0.98
TTC21B-201ENST00000243344 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa8.95□□□□□ -0.98
TTC21B-201ENST00000243344 SETD5Q9C0A6 1442 aa8.95□□□□□ -0.98
TTC21B-201ENST00000243344 CLSPNQ9HAW4 1339 aa8.95□□□□□ -0.98
TTC21B-201ENST00000243344 GAPVD1Q14C86 1478 aa8.94□□□□□ -0.98
TTC21B-201ENST00000243344 SIN3AQ96ST3 1273 aa8.94□□□□□ -0.98
TTC21B-201ENST00000243344 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa8.93□□□□□ -0.98
TTC21B-201ENST00000243344 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP8.92□□□□□ -0.986e-8■■■□□ 19.1
TTC21B-201ENST00000243344 GRIN2BQ13224 1484 aa8.91□□□□□ -0.98
TTC21B-201ENST00000243344 PTPRKQ15262 1439 aa8.91□□□□□ -0.98
TTC21B-201ENST00000243344 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
TTC21B-201ENST00000243344 KCNH8Q96L42 1107 aa8.9□□□□□ -0.98
TTC21B-201ENST00000243344 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.99
TTC21B-201ENST00000243344 ADAMTS12P58397 1594 aa8.89□□□□□ -0.99
TTC21B-201ENST00000243344 PTPN23Q9H3S7 1636 aa8.89□□□□□ -0.99
TTC21B-201ENST00000243344 FGD6Q6ZV73 1430 aa8.88□□□□□ -0.99
TTC21B-201ENST00000243344 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
TTC21B-201ENST00000243344 KDM6BO15054 1643 aa8.87□□□□□ -0.99
TTC21B-201ENST00000243344 NCOA2Q15596 1464 aa8.87□□□□□ -0.99
TTC21B-201ENST00000243344 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
TTC21B-201ENST00000243344 FMN1Q68DA7 1419 aa8.87□□□□□ -0.99
TTC21B-201ENST00000243344 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
TTC21B-201ENST00000243344 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
TTC21B-201ENST00000243344 ARID3CA6NKF2 412 aa8.85□□□□□ -0.99
TTC21B-201ENST00000243344 UGGT2Q9NYU1 1516 aa8.85□□□□□ -0.99
TTC21B-201ENST00000243344 CCDC18Q5T9S5 1454 aa8.85□□□□□ -0.99
TTC21B-201ENST00000243344 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa8.85□□□□□ -0.99
TTC21B-201ENST00000243344 IQGAP2Q13576 1575 aa8.84□□□□□ -0.99
TTC21B-201ENST00000243344 MTUS2Q5JR59 1369 aa8.84□□□□□ -0.99
TTC21B-201ENST00000243344 HECW1Q76N89 1606 aa8.84□□□□□ -0.99
TTC21B-201ENST00000243344 ARHGEF11O15085 1522 aa8.84□□□□□ -1
TTC21B-201ENST00000243344 GCC2Q8IWJ2 1684 aa8.83□□□□□ -1
TTC21B-201ENST00000243344 MYOM3Q5VTT5 1437 aa8.82□□□□□ -1
TTC21B-201ENST00000243344 SYNJ2O15056 1496 aa8.81□□□□□ -1
TTC21B-201ENST00000243344 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP8.81□□□□□ -1
TTC21B-201ENST00000243344 KDM5BQ9UGL1 1544 aa8.8□□□□□ -1
TTC21B-201ENST00000243344 HFM1A2PYH4 1435 aa8.8□□□□□ -1
TTC21B-201ENST00000243344 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
TTC21B-201ENST00000243344 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
TTC21B-201ENST00000243344 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
TTC21B-201ENST00000243344 NAIPQ13075 1403 aa8.79□□□□□ -1
TTC21B-201ENST00000243344 CHIC2Q9UKJ5 165 aa8.79□□□□□ -1
TTC21B-201ENST00000243344 GRIN2AQ12879 1464 aa8.79□□□□□ -1
TTC21B-201ENST00000243344 KIAA0556O60303 1618 aa8.78□□□□□ -1
TTC21B-201ENST00000243344 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa8.78□□□□□ -1
TTC21B-201ENST00000243344 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
TTC21B-201ENST00000243344 UACAQ9BZF9 1416 aa8.77□□□□□ -1.01
TTC21B-201ENST00000243344 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
TTC21B-201ENST00000243344 PLPPR3Q6T4P5 718 aa8.76□□□□□ -1.01
TTC21B-201ENST00000243344 DISP1Q96F81 1524 aa8.76□□□□□ -1.01
TTC21B-201ENST00000243344 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
TTC21B-201ENST00000243344 CEP170Q5SW79 1584 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC21B-201ENST00000243344 NUP160Q12769 1436 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC21B-201ENST00000243344 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC21B-201ENST00000243344 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC21B-201ENST00000243344 FOXD1Q16676 465 aa8.74□□□□□ -1.01
TTC21B-201ENST00000243344 TONSLQ96HA7 1378 aa8.73□□□□□ -1.01
TTC21B-201ENST00000243344 KIF14Q15058 1648 aa8.72□□□□□ -1.01
TTC21B-201ENST00000243344 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
TTC21B-201ENST00000243344 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
TTC21B-201ENST00000243344 CHD1O14646 1710 aa8.72□□□□□ -1.01
TTC21B-201ENST00000243344 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.01
TTC21B-201ENST00000243344 KCNA4P22459 653 aa8.71□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms