RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243056.4

HOXC13-201, Transcript of homeobox C13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC13, Length 2,423 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13-201ENST00000243056 ANP32EQ9BTT0 268 aa29.86■■■□□ 2.37
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HOXC13-201ENST00000243056 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.81■■■□□ 2.36
HOXC13-201ENST00000243056 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
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HOXC13-201ENST00000243056 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.48■■■□□ 2.31
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HOXC13-201ENST00000243056 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa29.37■■■□□ 2.29
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HOXC13-201ENST00000243056 MIER1Q8N108 512 aa29.3■■■□□ 2.28
HOXC13-201ENST00000243056 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.3■■■□□ 2.28
HOXC13-201ENST00000243056 GRIN2AQ12879 1464 aa29.29■■■□□ 2.28
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HOXC13-201ENST00000243056 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29.24■■■□□ 2.27
HOXC13-201ENST00000243056 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP29.19■■■□□ 2.26
HOXC13-201ENST00000243056 CEP170Q5SW79 1584 aa29.15■■■□□ 2.26
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HOXC13-201ENST00000243056 APLP2Q06481 763 aa29.06■■■□□ 2.24
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HOXC13-201ENST00000243056 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
HOXC13-201ENST00000243056 CHD1O14646 1710 aa29.04■■■□□ 2.24
HOXC13-201ENST00000243056 JPH4Q96JJ6 628 aa29.03■■■□□ 2.24
HOXC13-201ENST00000243056 NUP160Q12769 1436 aa29.03■■■□□ 2.24
HOXC13-201ENST00000243056 ARID3CA6NKF2 412 aa29.01■■■□□ 2.23
HOXC13-201ENST00000243056 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.97■■■□□ 2.23
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HOXC13-201ENST00000243056 UGGT2Q9NYU1 1516 aa28.91■■■□□ 2.22
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HOXC13-201ENST00000243056 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
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HOXC13-201ENST00000243056 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.74■■■□□ 2.19
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HOXC13-201ENST00000243056 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.62■■■□□ 2.17
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HOXC13-201ENST00000243056 MTUS2Q5JR59 1369 aa28.55■■■□□ 2.16
HOXC13-201ENST00000243056 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28.53■■■□□ 2.16
HOXC13-201ENST00000243056 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa28.52■■■□□ 2.16
HOXC13-201ENST00000243056 PHLDB1Q86UU1 1377 aa28.52■■■□□ 2.16
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HOXC13-201ENST00000243056 CCDC18Q5T9S5 1454 aa28.4■■■□□ 2.14
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HOXC13-201ENST00000243056 NCOA2Q15596 1464 aa28.34■■■□□ 2.13
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HOXC13-201ENST00000243056 KCNH8Q96L42 1107 aa28.21■■■□□ 2.11
HOXC13-201ENST00000243056 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
HOXC13-201ENST00000243056 FGD6Q6ZV73 1430 aa28.19■■■□□ 2.1
HOXC13-201ENST00000243056 ABCC2Q92887 1545 aa28.19■■■□□ 2.1
HOXC13-201ENST00000243056 DEKP35659 375 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
HOXC13-201ENST00000243056 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
HOXC13-201ENST00000243056 KIF14Q15058 1648 aa28.17■■■□□ 2.1
HOXC13-201ENST00000243056 MYOM3Q5VTT5 1437 aa28.17■■■□□ 2.1
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