RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000239461.10

PRRX1-201, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRX1, Length 4,284 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-201ENST00000239461 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
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PRRX1-201ENST00000239461 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
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PRRX1-201ENST00000239461 FHAD1B1AJZ9 1412 aa16.22■□□□□ 0.19
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PRRX1-201ENST00000239461 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa15.75■□□□□ 0.11
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PRRX1-201ENST00000239461 PTPRGP23470 1445 aa15.43■□□□□ 0.06
PRRX1-201ENST00000239461 MYO5CQ9NQX4 1742 aa15.43■□□□□ 0.06
PRRX1-201ENST00000239461 ADGBQ8N7X0 1667 aa15.43■□□□□ 0.06
PRRX1-201ENST00000239461 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
PRRX1-201ENST00000239461 CCNB3Q8WWL7 1395 aa15.42■□□□□ 0.06
PRRX1-201ENST00000239461 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa15.42■□□□□ 0.06
PRRX1-201ENST00000239461 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa15.42■□□□□ 0.06
PRRX1-201ENST00000239461 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa15.42■□□□□ 0.06
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