RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000238936.8

MFSD13A-201, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 13A, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene MFSD13A, Length 2,852 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD13A-201ENST00000238936 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.97■■□□□ 1.27
MFSD13A-201ENST00000238936 ITGAEP38570 1179 aa22.93■■□□□ 1.26
MFSD13A-201ENST00000238936 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.93■■□□□ 1.26
MFSD13A-201ENST00000238936 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.83■■□□□ 1.25
MFSD13A-201ENST00000238936 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
MFSD13A-201ENST00000238936 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.81■■□□□ 1.24
MFSD13A-201ENST00000238936 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.76■■□□□ 1.23
MFSD13A-201ENST00000238936 WDR97A6NE52 1622 aa22.72■■□□□ 1.23
MFSD13A-201ENST00000238936 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.69■■□□□ 1.22
MFSD13A-201ENST00000238936 CUL7Q14999 1698 aa22.68■■□□□ 1.22
MFSD13A-201ENST00000238936 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
MFSD13A-201ENST00000238936 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
MFSD13A-201ENST00000238936 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
MFSD13A-201ENST00000238936 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.65■■□□□ 1.22
MFSD13A-201ENST00000238936 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.64■■□□□ 1.22
MFSD13A-201ENST00000238936 TIAM1Q13009 1591 aa22.64■■□□□ 1.21
MFSD13A-201ENST00000238936 ARID3CA6NKF2 412 aa22.64■■□□□ 1.21
MFSD13A-201ENST00000238936 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
MFSD13A-201ENST00000238936 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.63■■□□□ 1.21
MFSD13A-201ENST00000238936 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.62■■□□□ 1.21
MFSD13A-201ENST00000238936 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
MFSD13A-201ENST00000238936 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
MFSD13A-201ENST00000238936 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.6■■□□□ 1.21
MFSD13A-201ENST00000238936 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.59■■□□□ 1.21
MFSD13A-201ENST00000238936 ERCC6Q03468 1493 aa22.57■■□□□ 1.2
MFSD13A-201ENST00000238936 MIER1Q8N108 512 aa22.56■■□□□ 1.2
MFSD13A-201ENST00000238936 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
MFSD13A-201ENST00000238936 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.51■■□□□ 1.19
MFSD13A-201ENST00000238936 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.5■■□□□ 1.19
MFSD13A-201ENST00000238936 FBLN2P98095 1184 aa22.48■■□□□ 1.19
MFSD13A-201ENST00000238936 FMN1Q68DA7 1419 aa22.47■■□□□ 1.19
MFSD13A-201ENST00000238936 PBRM1Q86U86 1689 aa22.47■■□□□ 1.19
MFSD13A-201ENST00000238936 MAP3K1Q13233 1512 aa22.47■■□□□ 1.19
MFSD13A-201ENST00000238936 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.46■■□□□ 1.19
MFSD13A-201ENST00000238936 GRIN2BQ13224 1484 aa22.45■■□□□ 1.18
MFSD13A-201ENST00000238936 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.43■■□□□ 1.18
MFSD13A-201ENST00000238936 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.43■■□□□ 1.18
MFSD13A-201ENST00000238936 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.42■■□□□ 1.18
MFSD13A-201ENST00000238936 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.42■■□□□ 1.18
MFSD13A-201ENST00000238936 IFT140Q96RY7 1462 aa22.42■■□□□ 1.18
MFSD13A-201ENST00000238936 WDR62O43379 1518 aa22.41■■□□□ 1.18
MFSD13A-201ENST00000238936 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.39■■□□□ 1.18
MFSD13A-201ENST00000238936 SAMD9Q5K651 1589 aa22.39■■□□□ 1.18
MFSD13A-201ENST00000238936 ADAMTS12P58397 1594 aa22.39■■□□□ 1.17
MFSD13A-201ENST00000238936 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
MFSD13A-201ENST00000238936 IQGAP2Q13576 1575 aa22.33■■□□□ 1.16
MFSD13A-201ENST00000238936 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
MFSD13A-201ENST00000238936 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.29■■□□□ 1.16
MFSD13A-201ENST00000238936 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.29■■□□□ 1.16
MFSD13A-201ENST00000238936 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.26■■□□□ 1.15
MFSD13A-201ENST00000238936 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.26■■□□□ 1.15
MFSD13A-201ENST00000238936 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
MFSD13A-201ENST00000238936 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
MFSD13A-201ENST00000238936 NCOA2Q15596 1464 aa22.24■■□□□ 1.15
MFSD13A-201ENST00000238936 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.24■■□□□ 1.15
MFSD13A-201ENST00000238936 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.23■■□□□ 1.15
MFSD13A-201ENST00000238936 GRIN2AQ12879 1464 aa22.23■■□□□ 1.15
MFSD13A-201ENST00000238936 PTPRKQ15262 1439 aa22.22■■□□□ 1.15
MFSD13A-201ENST00000238936 MAPKBP1O60336 1514 aa22.2■■□□□ 1.14
MFSD13A-201ENST00000238936 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.19■■□□□ 1.14
MFSD13A-201ENST00000238936 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
MFSD13A-201ENST00000238936 DISP1Q96F81 1524 aa22.16■■□□□ 1.14
MFSD13A-201ENST00000238936 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.16■■□□□ 1.14
MFSD13A-201ENST00000238936 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.15■■□□□ 1.14
MFSD13A-201ENST00000238936 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.14■■□□□ 1.13
MFSD13A-201ENST00000238936 JPH4Q96JJ6 628 aa22.12■■□□□ 1.13
MFSD13A-201ENST00000238936 SYNJ2O15056 1496 aa22.1■■□□□ 1.13
MFSD13A-201ENST00000238936 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
MFSD13A-201ENST00000238936 HECW1Q76N89 1606 aa22.1■■□□□ 1.13
MFSD13A-201ENST00000238936 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.09■■□□□ 1.13
MFSD13A-201ENST00000238936 CEP170Q5SW79 1584 aa22.09■■□□□ 1.13
MFSD13A-201ENST00000238936 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
MFSD13A-201ENST00000238936 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
MFSD13A-201ENST00000238936 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
MFSD13A-201ENST00000238936 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.08■■□□□ 1.13
MFSD13A-201ENST00000238936 KIAA0556O60303 1618 aa22.08■■□□□ 1.12
MFSD13A-201ENST00000238936 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.07■■□□□ 1.12
MFSD13A-201ENST00000238936 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
MFSD13A-201ENST00000238936 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.04■■□□□ 1.12
MFSD13A-201ENST00000238936 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
MFSD13A-201ENST00000238936 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.03■■□□□ 1.12
MFSD13A-201ENST00000238936 ARHGEF11O15085 1522 aa21.99■■□□□ 1.11
MFSD13A-201ENST00000238936 NAIPQ13075 1403 aa21.98■■□□□ 1.11
MFSD13A-201ENST00000238936 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
MFSD13A-201ENST00000238936 TRIM52Q96A61 297 aa21.97■■□□□ 1.11
MFSD13A-201ENST00000238936 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
MFSD13A-201ENST00000238936 HFM1A2PYH4 1435 aa21.97■■□□□ 1.11
MFSD13A-201ENST00000238936 FOXD1Q16676 465 aa21.95■■□□□ 1.1
MFSD13A-201ENST00000238936 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
MFSD13A-201ENST00000238936 NUP160Q12769 1436 aa21.95■■□□□ 1.1
MFSD13A-201ENST00000238936 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa21.94■■□□□ 1.1
MFSD13A-201ENST00000238936 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa21.93■■□□□ 1.1
MFSD13A-201ENST00000238936 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa21.92■■□□□ 1.1
MFSD13A-201ENST00000238936 KDM6BO15054 1643 aa21.92■■□□□ 1.1
MFSD13A-201ENST00000238936 BCL11AQ9H165 835 aa21.92■■□□□ 1.1
MFSD13A-201ENST00000238936 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
MFSD13A-201ENST00000238936 UACAQ9BZF9 1416 aa21.86■■□□□ 1.09
MFSD13A-201ENST00000238936 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
MFSD13A-201ENST00000238936 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
MFSD13A-201ENST00000238936 MIA2Q96PC5 1412 aa21.84■■□□□ 1.09
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