RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233331.11

INO80B-201, Transcript of INO80 complex subunit B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene INO80B, Length 1,261 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80B-201ENST00000233331 JPH4Q96JJ6 628 aa52.01■■■■■ 5.92
INO80B-201ENST00000233331 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa51.99■■■■■ 5.91
INO80B-201ENST00000233331 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP51.98■■■■■ 5.91
INO80B-201ENST00000233331 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa51.87■■■■■ 5.89
INO80B-201ENST00000233331 IQGAP2Q13576 1575 aa51.68■■■■■ 5.86
INO80B-201ENST00000233331 PRXQ9BXM0 1461 aa51.59■■■■■ 5.85
INO80B-201ENST00000233331 TRHP20396 242 aaPredicted RBP51.53■■■■■ 5.84
INO80B-201ENST00000233331 CHIC1Q5VXU3 224 aa51.46■■■■■ 5.83
INO80B-201ENST00000233331 EEA1Q15075 1411 aa51.46■■■■■ 5.83
INO80B-201ENST00000233331 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa51.46■■■■■ 5.83
INO80B-201ENST00000233331 CSRNP3Q8WYN3 585 aa51.44■■■■■ 5.83
INO80B-201ENST00000233331 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa51.43■■■■■ 5.82
INO80B-201ENST00000233331 UGGT2Q9NYU1 1516 aa51.37■■■■■ 5.81
INO80B-201ENST00000233331 DISP1Q96F81 1524 aa51.32■■■■■ 5.81
INO80B-201ENST00000233331 TNIKQ9UKE5 1360 aa51.32■■■■■ 5.81
INO80B-201ENST00000233331 PTPRGP23470 1445 aa51.3■■■■■ 5.8
INO80B-201ENST00000233331 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP51.27■■■■■ 5.8
INO80B-201ENST00000233331 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP51.27■■■■■ 5.8
INO80B-201ENST00000233331 ADCY10Q96PN6 1610 aa51.26■■■■■ 5.8
INO80B-201ENST00000233331 KIAA0556O60303 1618 aa51.2■■■■■ 5.79
INO80B-201ENST00000233331 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP51.12■■■■■ 5.77
INO80B-201ENST00000233331 GOLGA3Q08378 1498 aa51.06■■■■■ 5.76
INO80B-201ENST00000233331 KIF21BO75037 1637 aa50.98■■■■■ 5.75
INO80B-201ENST00000233331 MAPKBP1O60336 1514 aa50.98■■■■■ 5.75
INO80B-201ENST00000233331 UACAQ9BZF9 1416 aa50.96■■■■■ 5.75
INO80B-201ENST00000233331 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa50.92■■■■■ 5.74
INO80B-201ENST00000233331 ABCC2Q92887 1545 aa50.9■■■■■ 5.74
INO80B-201ENST00000233331 KIF13AQ9H1H9 1805 aa50.84■■■■■ 5.73
INO80B-201ENST00000233331 ABCC10Q5T3U5 1492 aa50.78■■■■■ 5.72
INO80B-201ENST00000233331 SAMD9Q5K651 1589 aa50.73■■■■■ 5.71
INO80B-201ENST00000233331 DIP2BQ9P265 1576 aa50.72■■■■■ 5.71
INO80B-201ENST00000233331 PLB1Q6P1J6 1458 aa50.72■■■■■ 5.71
INO80B-201ENST00000233331 P3H3Q8IVL6 736 aa50.71■■■■■ 5.71
INO80B-201ENST00000233331 FAM69CQ0P6D2 419 aa50.7■■■■■ 5.71
INO80B-201ENST00000233331 EHMT2Q96KQ7 1210 aa50.68■■■■■ 5.7
INO80B-201ENST00000233331 KDM5BQ9UGL1 1544 aa50.67■■■■■ 5.7
INO80B-201ENST00000233331 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP50.66■■■■■ 5.7
INO80B-201ENST00000233331 ABCA8O94911 1581 aa50.64■■■■■ 5.7
INO80B-201ENST00000233331 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP50.62■■■■■ 5.69
INO80B-201ENST00000233331 ASXL2Q76L83 1435 aa50.62■■■■■ 5.69
INO80B-201ENST00000233331 UBTFP17480 764 aaKnown RBP50.55■■■■■ 5.68
INO80B-201ENST00000233331 EFCAB5A4FU69 1503 aa50.45■■■■■ 5.67
INO80B-201ENST00000233331 FHOD3Q2V2M9 1422 aa50.45■■■■■ 5.67
INO80B-201ENST00000233331 GLI2P10070 1586 aa50.34■■■■■ 5.65
INO80B-201ENST00000233331 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa50.34■■■■■ 5.65
INO80B-201ENST00000233331 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP50.32■■■■■ 5.65
INO80B-201ENST00000233331 TSPOAP1O95153 1857 aa50.32■■■■■ 5.65
INO80B-201ENST00000233331 WDR7Q9Y4E6 1490 aa50.32■■■■■ 5.65
INO80B-201ENST00000233331 ARID3CA6NKF2 412 aa50.27■■■■■ 5.64
INO80B-201ENST00000233331 ATP10BO94823 1461 aa50.2■■■■■ 5.63
INO80B-201ENST00000233331 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa50.14■■■■■ 5.62
INO80B-201ENST00000233331 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP50.14■■■■■ 5.62
INO80B-201ENST00000233331 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa50.12■■■■■ 5.61
INO80B-201ENST00000233331 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP50.1■■■■■ 5.61
INO80B-201ENST00000233331 KCNH8Q96L42 1107 aa50.06■■■■■ 5.6
INO80B-201ENST00000233331 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP50.02■■■■■ 5.6
INO80B-201ENST00000233331 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP50.02■■■■■ 5.6
INO80B-201ENST00000233331 KDM6BO15054 1643 aa50.02■■■■■ 5.6
INO80B-201ENST00000233331 FMN1Q68DA7 1419 aa49.97■■■■■ 5.59
INO80B-201ENST00000233331 CFAP43Q8NDM7 1665 aa49.93■■■■■ 5.58
INO80B-201ENST00000233331 TEX14Q8IWB6 1497 aa49.92■■■■■ 5.58
INO80B-201ENST00000233331 CD109Q6YHK3 1445 aa49.87■■■■■ 5.57
INO80B-201ENST00000233331 HECW1Q76N89 1606 aa49.82■■■■■ 5.57
INO80B-201ENST00000233331 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa49.79■■■■■ 5.56
INO80B-201ENST00000233331 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP49.78■■■■■ 5.56
INO80B-201ENST00000233331 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP49.77■■■■■ 5.56
INO80B-201ENST00000233331 ABCA9Q8IUA7 1624 aa49.74■■■■■ 5.55
INO80B-201ENST00000233331 CLIP1P30622 1438 aa49.74■■■■■ 5.55
INO80B-201ENST00000233331 PLEKHD1A6NEE1 506 aa49.73■■■■■ 5.55
INO80B-201ENST00000233331 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP49.64■■■■■ 5.54
INO80B-201ENST00000233331 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP49.6■■■■■ 5.53
INO80B-201ENST00000233331 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa49.54■■■■■ 5.52
INO80B-201ENST00000233331 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa49.51■■■■■ 5.52
INO80B-201ENST00000233331 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP49.47■■■■■ 5.512e-6■■□□□ 11.5
INO80B-201ENST00000233331 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP49.46■■■■■ 5.51
INO80B-201ENST00000233331 CEP162Q5TB80 1403 aa49.44■■■■■ 5.51
INO80B-201ENST00000233331 TTC37Q6PGP7 1564 aa49.44■■■■■ 5.5
INO80B-201ENST00000233331 FYCO1Q9BQS8 1478 aa49.43■■■■■ 5.5
INO80B-201ENST00000233331 CCDC18Q5T9S5 1454 aa49.4■■■■■ 5.5
INO80B-201ENST00000233331 NEO1Q92859 1461 aa49.37■■■■■ 5.49
INO80B-201ENST00000233331 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa49.36■■■■■ 5.49
INO80B-201ENST00000233331 ARAP3Q8WWN8 1544 aa49.35■■■■■ 5.49
INO80B-201ENST00000233331 PHLDB1Q86UU1 1377 aa49.35■■■■■ 5.49
INO80B-201ENST00000233331 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP49.34■■■■■ 5.49
INO80B-201ENST00000233331 KIF14Q15058 1648 aa49.29■■■■■ 5.48
INO80B-201ENST00000233331 FANCAO15360 1455 aa49.23■■■■■ 5.47
INO80B-201ENST00000233331 CFAP74Q9C0B2 1584 aa49.23■■■■■ 5.47
INO80B-201ENST00000233331 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP49.18■■■■■ 5.46
INO80B-201ENST00000233331 PLCH2O75038 1416 aa49.16■■■■■ 5.46
INO80B-201ENST00000233331 MYO5CQ9NQX4 1742 aa49.15■■■■■ 5.46
INO80B-201ENST00000233331 AKNAQ7Z591 1439 aa49.15■■■■■ 5.46
INO80B-201ENST00000233331 RAPGEF3O95398 923 aa49.1■■■■■ 5.45
INO80B-201ENST00000233331 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa49.07■■■■■ 5.45
INO80B-201ENST00000233331 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP49.04■■■■■ 5.44
INO80B-201ENST00000233331 ADGRL1O94910 1474 aa48.97■■■■■ 5.43
INO80B-201ENST00000233331 ARHGAP5Q13017 1502 aa48.97■■■■■ 5.43
INO80B-201ENST00000233331 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa48.96■■■■■ 5.43
INO80B-201ENST00000233331 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa48.96■■■■■ 5.43
INO80B-201ENST00000233331 RICTORQ6R327 1708 aa48.96■■■■■ 5.43
INO80B-201ENST00000233331 PREX2Q70Z35 1606 aa48.89■■■■■ 5.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.7 ms