RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000223423.8

PTGS1-201, Transcript of prostaglandin-endoperoxide synthase 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTGS1, Length 2,328 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1-201ENST00000223423 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa19.05■□□□□ 0.64
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PTGS1-201ENST00000223423 IFT140Q96RY7 1462 aa18.97■□□□□ 0.63
PTGS1-201ENST00000223423 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
PTGS1-201ENST00000223423 P3H3Q8IVL6 736 aa18.94■□□□□ 0.62
PTGS1-201ENST00000223423 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa18.92■□□□□ 0.62
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PTGS1-201ENST00000223423 FHAD1B1AJZ9 1412 aa18.89■□□□□ 0.61
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PTGS1-201ENST00000223423 MAP3K1Q13233 1512 aa18.89■□□□□ 0.61
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PTGS1-201ENST00000223423 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa18.79■□□□□ 0.6
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PTGS1-201ENST00000223423 CFAP43Q8NDM7 1665 aa18.78■□□□□ 0.6
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PTGS1-201ENST00000223423 GRIN2BQ13224 1484 aa18.78■□□□□ 0.6
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PTGS1-201ENST00000223423 MTUS2Q5JR59 1369 aa18.57■□□□□ 0.56
PTGS1-201ENST00000223423 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa18.56■□□□□ 0.56
PTGS1-201ENST00000223423 CLSPNQ9HAW4 1339 aa18.56■□□□□ 0.56
PTGS1-201ENST00000223423 CEP170Q5SW79 1584 aa18.54■□□□□ 0.56
PTGS1-201ENST00000223423 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa18.54■□□□□ 0.56
PTGS1-201ENST00000223423 FGD6Q6ZV73 1430 aa18.51■□□□□ 0.55
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PTGS1-201ENST00000223423 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa18.5■□□□□ 0.55
PTGS1-201ENST00000223423 DISP1Q96F81 1524 aa18.5■□□□□ 0.55
PTGS1-201ENST00000223423 SETD5Q9C0A6 1442 aa18.5■□□□□ 0.55
PTGS1-201ENST00000223423 NCOA2Q15596 1464 aa18.5■□□□□ 0.55
PTGS1-201ENST00000223423 CCDC18Q5T9S5 1454 aa18.5■□□□□ 0.55
PTGS1-201ENST00000223423 HECW1Q76N89 1606 aa18.49■□□□□ 0.55
PTGS1-201ENST00000223423 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa18.49■□□□□ 0.55
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PTGS1-201ENST00000223423 KIAA0556O60303 1618 aa18.48■□□□□ 0.55
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PTGS1-201ENST00000223423 ARHGEF11O15085 1522 aa18.44■□□□□ 0.54
PTGS1-201ENST00000223423 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
PTGS1-201ENST00000223423 ARID3CA6NKF2 412 aa18.41■□□□□ 0.54
PTGS1-201ENST00000223423 OSCARQ8IYS5 282 aa18.41■□□□□ 0.54
PTGS1-201ENST00000223423 NUP160Q12769 1436 aa18.4■□□□□ 0.54
PTGS1-201ENST00000223423 MAPKBP1O60336 1514 aa18.4■□□□□ 0.54
PTGS1-201ENST00000223423 PTPRKQ15262 1439 aa18.39■□□□□ 0.54
PTGS1-201ENST00000223423 ERCC6L2Q5T890 1561 aa18.37■□□□□ 0.53
PTGS1-201ENST00000223423 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
PTGS1-201ENST00000223423 JPH4Q96JJ6 628 aa18.35■□□□□ 0.53
PTGS1-201ENST00000223423 PTPN23Q9H3S7 1636 aa18.35■□□□□ 0.53
PTGS1-201ENST00000223423 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa18.34■□□□□ 0.53
PTGS1-201ENST00000223423 CLASP1Q7Z460 1538 aa18.33■□□□□ 0.52
PTGS1-201ENST00000223423 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
PTGS1-201ENST00000223423 HFM1A2PYH4 1435 aa18.31■□□□□ 0.52
PTGS1-201ENST00000223423 PLB1Q6P1J6 1458 aa18.29■□□□□ 0.52
PTGS1-201ENST00000223423 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa18.29■□□□□ 0.52
PTGS1-201ENST00000223423 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
PTGS1-201ENST00000223423 MIA2Q96PC5 1412 aa18.27■□□□□ 0.52
PTGS1-201ENST00000223423 NAIPQ13075 1403 aa18.27■□□□□ 0.51
PTGS1-201ENST00000223423 SIN3AQ96ST3 1273 aa18.24■□□□□ 0.51
PTGS1-201ENST00000223423 SHROOM2Q13796 1616 aa18.23■□□□□ 0.51
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PTGS1-201ENST00000223423 CHIC2Q9UKJ5 165 aa18.21■□□□□ 0.51
PTGS1-201ENST00000223423 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
PTGS1-201ENST00000223423 UACAQ9BZF9 1416 aa18.2■□□□□ 0.5
PTGS1-201ENST00000223423 NEUROD1Q13562 356 aa18.2■□□□□ 0.5
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PTGS1-201ENST00000223423 ABCA8O94911 1581 aa18.17■□□□□ 0.5
PTGS1-201ENST00000223423 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
PTGS1-201ENST00000223423 AKNAQ7Z591 1439 aa18.15■□□□□ 0.5
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PTGS1-201ENST00000223423 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa18.13■□□□□ 0.49
PTGS1-201ENST00000223423 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa18.13■□□□□ 0.49
PTGS1-201ENST00000223423 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa18.13■□□□□ 0.49
PTGS1-201ENST00000223423 DAPK1P53355 1430 aa18.13■□□□□ 0.49
PTGS1-201ENST00000223423 MIER1Q8N108 512 aa18.13■□□□□ 0.49
PTGS1-201ENST00000223423 KIF14Q15058 1648 aa18.12■□□□□ 0.49
PTGS1-201ENST00000223423 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa18.12■□□□□ 0.49
PTGS1-201ENST00000223423 ATP10BO94823 1461 aa18.12■□□□□ 0.49
PTGS1-201ENST00000223423 ABCC5O15440 1437 aa18.12■□□□□ 0.49
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