RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000222329.8

ERF-201, Transcript of ETS2 repressor factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ERF, Length 2,698 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERF-201ENST00000222329 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP33.54■■■□□ 2.96
ERF-201ENST00000222329 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP33.53■■■□□ 2.96
ERF-201ENST00000222329 TIAM1Q13009 1591 aa33.51■■■□□ 2.96
ERF-201ENST00000222329 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP33.49■■■□□ 2.95
ERF-201ENST00000222329 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP33.49■■■□□ 2.95
ERF-201ENST00000222329 MIER1Q8N108 512 aa33.48■■■□□ 2.95
ERF-201ENST00000222329 PHLDB1Q86UU1 1377 aa33.45■■■□□ 2.95
ERF-201ENST00000222329 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa33.44■■■□□ 2.94
ERF-201ENST00000222329 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.42■■■□□ 2.94
ERF-201ENST00000222329 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP33.41■■■□□ 2.94
ERF-201ENST00000222329 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.4■■■□□ 2.94
ERF-201ENST00000222329 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa33.35■■■□□ 2.93
ERF-201ENST00000222329 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP33.35■■■□□ 2.93
ERF-201ENST00000222329 CLSPNQ9HAW4 1339 aa33.34■■■□□ 2.93
ERF-201ENST00000222329 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.33■■■□□ 2.93
ERF-201ENST00000222329 MAP3K1Q13233 1512 aa33.3■■■□□ 2.92
ERF-201ENST00000222329 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.28■■■□□ 2.92
ERF-201ENST00000222329 CUL7Q14999 1698 aa33.28■■■□□ 2.92
ERF-201ENST00000222329 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.26■■■□□ 2.91
ERF-201ENST00000222329 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa33.25■■■□□ 2.91
ERF-201ENST00000222329 WDR97A6NE52 1622 aa33.21■■■□□ 2.91
ERF-201ENST00000222329 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa33.21■■■□□ 2.91
ERF-201ENST00000222329 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa33.18■■■□□ 2.9
ERF-201ENST00000222329 CFAP43Q8NDM7 1665 aa33.17■■■□□ 2.9
ERF-201ENST00000222329 SETD5Q9C0A6 1442 aa33.16■■■□□ 2.9
ERF-201ENST00000222329 EFCAB5A4FU69 1503 aa33.16■■■□□ 2.9
ERF-201ENST00000222329 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.16■■■□□ 2.9
ERF-201ENST00000222329 FYCO1Q9BQS8 1478 aa33.15■■■□□ 2.9
ERF-201ENST00000222329 SIN3AQ96ST3 1273 aa33.12■■■□□ 2.89
ERF-201ENST00000222329 FMN1Q68DA7 1419 aa33.09■■■□□ 2.89
ERF-201ENST00000222329 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.08■■■□□ 2.897e-7■■■■■ 33.9
ERF-201ENST00000222329 MAPKBP1O60336 1514 aa33.06■■■□□ 2.88
ERF-201ENST00000222329 MTUS2Q5JR59 1369 aa33.06■■■□□ 2.88
ERF-201ENST00000222329 ARID3CA6NKF2 412 aa33.04■■■□□ 2.88
ERF-201ENST00000222329 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.03■■■□□ 2.88
ERF-201ENST00000222329 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP32.99■■■□□ 2.87
ERF-201ENST00000222329 SAMD9Q5K651 1589 aa32.92■■■□□ 2.86
ERF-201ENST00000222329 FGD6Q6ZV73 1430 aa32.92■■■□□ 2.86
ERF-201ENST00000222329 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa32.91■■■□□ 2.86
ERF-201ENST00000222329 GRIN2BQ13224 1484 aa32.85■■■□□ 2.85
ERF-201ENST00000222329 PTPRKQ15262 1439 aa32.84■■■□□ 2.85
ERF-201ENST00000222329 NCOA2Q15596 1464 aa32.82■■■□□ 2.84
ERF-201ENST00000222329 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.81■■■□□ 2.84
ERF-201ENST00000222329 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.81■■■□□ 2.84
ERF-201ENST00000222329 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP32.8■■■□□ 2.84
ERF-201ENST00000222329 PBRM1Q86U86 1689 aa32.8■■■□□ 2.84
ERF-201ENST00000222329 CHIC2Q9UKJ5 165 aa32.77■■■□□ 2.84
ERF-201ENST00000222329 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP32.74■■■□□ 2.832e-7■■■■■ 26.8
ERF-201ENST00000222329 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa32.73■■■□□ 2.83
ERF-201ENST00000222329 MYOM3Q5VTT5 1437 aa32.72■■■□□ 2.83
ERF-201ENST00000222329 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa32.71■■■□□ 2.83
ERF-201ENST00000222329 IQGAP2Q13576 1575 aa32.69■■■□□ 2.82
ERF-201ENST00000222329 ADAMTS12P58397 1594 aa32.68■■■□□ 2.82
ERF-201ENST00000222329 CCDC18Q5T9S5 1454 aa32.67■■■□□ 2.82
ERF-201ENST00000222329 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP32.65■■■□□ 2.82
ERF-201ENST00000222329 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP32.64■■■□□ 2.82
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ERF-201ENST00000222329 KCNH8Q96L42 1107 aa32.64■■■□□ 2.81
ERF-201ENST00000222329 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa32.61■■■□□ 2.81
ERF-201ENST00000222329 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP32.6■■■□□ 2.81
ERF-201ENST00000222329 HFM1A2PYH4 1435 aa32.59■■■□□ 2.81
ERF-201ENST00000222329 NAIPQ13075 1403 aa32.58■■■□□ 2.81
ERF-201ENST00000222329 FBLN2P98095 1184 aa32.58■■■□□ 2.81
ERF-201ENST00000222329 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP32.58■■■□□ 2.81
ERF-201ENST00000222329 PTPN23Q9H3S7 1636 aa32.56■■■□□ 2.8
ERF-201ENST00000222329 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.56■■■□□ 2.8
ERF-201ENST00000222329 UGGT2Q9NYU1 1516 aa32.56■■■□□ 2.8
ERF-201ENST00000222329 IFT140Q96RY7 1462 aa32.56■■■□□ 2.8
ERF-201ENST00000222329 HECW1Q76N89 1606 aa32.51■■■□□ 2.8
ERF-201ENST00000222329 ERCC6Q03468 1493 aa32.51■■■□□ 2.8
ERF-201ENST00000222329 TONSLQ96HA7 1378 aa32.51■■■□□ 2.8
ERF-201ENST00000222329 TRIM52Q96A61 297 aa32.51■■■□□ 2.8
ERF-201ENST00000222329 UACAQ9BZF9 1416 aa32.5■■■□□ 2.79
ERF-201ENST00000222329 WDR62O43379 1518 aa32.47■■■□□ 2.79
ERF-201ENST00000222329 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa32.46■■■□□ 2.79
ERF-201ENST00000222329 ARHGEF11O15085 1522 aa32.46■■■□□ 2.79
ERF-201ENST00000222329 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP32.44■■■□□ 2.78
ERF-201ENST00000222329 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP32.41■■■□□ 2.78
ERF-201ENST00000222329 DISP1Q96F81 1524 aa32.4■■■□□ 2.78
ERF-201ENST00000222329 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa32.39■■■□□ 2.78
ERF-201ENST00000222329 FOXD1Q16676 465 aa32.39■■■□□ 2.78
ERF-201ENST00000222329 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP32.39■■■□□ 2.78
ERF-201ENST00000222329 GRIN2AQ12879 1464 aa32.38■■■□□ 2.77
ERF-201ENST00000222329 KDM6BO15054 1643 aa32.34■■■□□ 2.77
ERF-201ENST00000222329 KIAA0556O60303 1618 aa32.32■■■□□ 2.76
ERF-201ENST00000222329 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP32.32■■■□□ 2.76
ERF-201ENST00000222329 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP32.29■■■□□ 2.76
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ERF-201ENST00000222329 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP32.23■■■□□ 2.75
ERF-201ENST00000222329 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP32.23■■■□□ 2.75
ERF-201ENST00000222329 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP32.22■■■□□ 2.75
ERF-201ENST00000222329 PLB1Q6P1J6 1458 aa32.21■■■□□ 2.75
ERF-201ENST00000222329 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP32.2■■■□□ 2.75
ERF-201ENST00000222329 JPH4Q96JJ6 628 aa32.19■■■□□ 2.74
ERF-201ENST00000222329 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa32.18■■■□□ 2.74
ERF-201ENST00000222329 CEP170Q5SW79 1584 aa32.18■■■□□ 2.74
ERF-201ENST00000222329 DAPK1P53355 1430 aa32.14■■■□□ 2.74
ERF-201ENST00000222329 GCC2Q8IWJ2 1684 aa32.14■■■□□ 2.74
ERF-201ENST00000222329 ABCC5O15440 1437 aa32.13■■■□□ 2.73
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