RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000155840.9

KCNQ1-201, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 3,245 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-201ENST00000155840 CUX2O14529 1486 aa24.54■■□□□ 1.52
KCNQ1-201ENST00000155840 ANP32EQ9BTT0 268 aa24.54■■□□□ 1.52
KCNQ1-201ENST00000155840 CUX1P39880 1505 aa24.52■■□□□ 1.52
KCNQ1-201ENST00000155840 TOP2BQ02880 1626 aa24.52■■□□□ 1.52
KCNQ1-201ENST00000155840 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
KCNQ1-201ENST00000155840 WDR97A6NE52 1622 aa24.5■■□□□ 1.51
KCNQ1-201ENST00000155840 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP24.49■■□□□ 1.515e-6■■□□□ 13.7
KCNQ1-201ENST00000155840 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.48■■□□□ 1.51
KCNQ1-201ENST00000155840 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
KCNQ1-201ENST00000155840 POLR3GLQ9BT43 218 aa24.43■■□□□ 1.5
KCNQ1-201ENST00000155840 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.43■■□□□ 1.5
KCNQ1-201ENST00000155840 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.42■■□□□ 1.5
KCNQ1-201ENST00000155840 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
KCNQ1-201ENST00000155840 IGF1RP08069 1367 aa24.42■■□□□ 1.5
KCNQ1-201ENST00000155840 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.4■■□□□ 1.5
KCNQ1-201ENST00000155840 MAPKBP1O60336 1514 aa24.4■■□□□ 1.5
KCNQ1-201ENST00000155840 FOXD1Q16676 465 aa24.39■■□□□ 1.49
KCNQ1-201ENST00000155840 TONSLQ96HA7 1378 aa24.38■■□□□ 1.49
KCNQ1-201ENST00000155840 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.38■■□□□ 1.49
KCNQ1-201ENST00000155840 FAM9BQ8IZU0 186 aa24.34■■□□□ 1.49
KCNQ1-201ENST00000155840 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.31■■□□□ 1.48
KCNQ1-201ENST00000155840 CCDC184Q52MB2 194 aa24.28■■□□□ 1.48
KCNQ1-201ENST00000155840 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.25■■□□□ 1.47
KCNQ1-201ENST00000155840 ERICH6Q7L0X2 663 aa24.22■■□□□ 1.47
KCNQ1-201ENST00000155840 BCL11AQ9H165 835 aa24.22■■□□□ 1.47
KCNQ1-201ENST00000155840 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
KCNQ1-201ENST00000155840 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.2■■□□□ 1.46
KCNQ1-201ENST00000155840 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.2■■□□□ 1.46
KCNQ1-201ENST00000155840 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.19■■□□□ 1.46
KCNQ1-201ENST00000155840 MSH5O43196 834 aa24.19■■□□□ 1.46
KCNQ1-201ENST00000155840 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa24.17■■□□□ 1.46
KCNQ1-201ENST00000155840 TIAM1Q13009 1591 aa24.16■■□□□ 1.46
KCNQ1-201ENST00000155840 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.16■■□□□ 1.46
KCNQ1-201ENST00000155840 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
KCNQ1-201ENST00000155840 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
KCNQ1-201ENST00000155840 CFTRP13569 1480 aa24.11■■□□□ 1.45
KCNQ1-201ENST00000155840 CCER2I3L3R5 266 aa24.08■■□□□ 1.45
KCNQ1-201ENST00000155840 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
KCNQ1-201ENST00000155840 MRS2Q9HD23 443 aa24.06■■□□□ 1.44
KCNQ1-201ENST00000155840 NCAPD3P42695 1498 aa24.06■■□□□ 1.44
KCNQ1-201ENST00000155840 PTPRKQ15262 1439 aa24.05■■□□□ 1.44
KCNQ1-201ENST00000155840 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
KCNQ1-201ENST00000155840 WASHC2AQ641Q2 1341 aa24.04■■□□□ 1.44
KCNQ1-201ENST00000155840 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
KCNQ1-201ENST00000155840 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.03■■□□□ 1.44
KCNQ1-201ENST00000155840 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.02■■□□□ 1.44
KCNQ1-201ENST00000155840 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
KCNQ1-201ENST00000155840 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.01■■□□□ 1.43
KCNQ1-201ENST00000155840 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24■■□□□ 1.43
KCNQ1-201ENST00000155840 NBR1Q14596 966 aa23.99■■□□□ 1.43
KCNQ1-201ENST00000155840 L3MBTL2Q969R5 705 aa23.98■■□□□ 1.43
KCNQ1-201ENST00000155840 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.97■■□□□ 1.43
KCNQ1-201ENST00000155840 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP23.96■■□□□ 1.43
KCNQ1-201ENST00000155840 NESP48681 1621 aa23.94■■□□□ 1.42
KCNQ1-201ENST00000155840 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.94■■□□□ 1.42
KCNQ1-201ENST00000155840 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
KCNQ1-201ENST00000155840 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.88■■□□□ 1.41
KCNQ1-201ENST00000155840 MPHOSPH9Q99550 1183 aa23.86■■□□□ 1.41
KCNQ1-201ENST00000155840 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
KCNQ1-201ENST00000155840 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.85■■□□□ 1.41
KCNQ1-201ENST00000155840 NBPF8Q3BBV2 869 aa23.84■■□□□ 1.41
KCNQ1-201ENST00000155840 HMGXB3Q12766 1538 aa23.81■■□□□ 1.4
KCNQ1-201ENST00000155840 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
KCNQ1-201ENST00000155840 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
KCNQ1-201ENST00000155840 NAIPQ13075 1403 aa23.8■■□□□ 1.4
KCNQ1-201ENST00000155840 UACAQ9BZF9 1416 aa23.78■■□□□ 1.4
KCNQ1-201ENST00000155840 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa23.78■■□□□ 1.4
KCNQ1-201ENST00000155840 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
KCNQ1-201ENST00000155840 PPP4R2Q9NY27 417 aa23.77■■□□□ 1.4
KCNQ1-201ENST00000155840 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.77■■□□□ 1.4
KCNQ1-201ENST00000155840 NCOA2Q15596 1464 aa23.76■■□□□ 1.39
KCNQ1-201ENST00000155840 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
KCNQ1-201ENST00000155840 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
KCNQ1-201ENST00000155840 HFM1A2PYH4 1435 aa23.7■■□□□ 1.39
KCNQ1-201ENST00000155840 FMN1Q68DA7 1419 aa23.7■■□□□ 1.39
KCNQ1-201ENST00000155840 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.69■■□□□ 1.38
KCNQ1-201ENST00000155840 CCDC136Q96JN2 1154 aa23.68■■□□□ 1.38
KCNQ1-201ENST00000155840 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.68■■□□□ 1.38
KCNQ1-201ENST00000155840 FBLN2P98095 1184 aa23.67■■□□□ 1.38
KCNQ1-201ENST00000155840 AKNAQ7Z591 1439 aa23.67■■□□□ 1.38
KCNQ1-201ENST00000155840 KIF7Q2M1P5 1343 aa23.67■■□□□ 1.38
KCNQ1-201ENST00000155840 MAP3K1Q13233 1512 aa23.66■■□□□ 1.38
KCNQ1-201ENST00000155840 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.64■■□□□ 1.37
KCNQ1-201ENST00000155840 CCDC7Q96M83 1385 aa23.62■■□□□ 1.37
KCNQ1-201ENST00000155840 TOPBP1Q92547 1522 aa23.61■■□□□ 1.37
KCNQ1-201ENST00000155840 DEKP35659 375 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
KCNQ1-201ENST00000155840 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.59■■□□□ 1.37
KCNQ1-201ENST00000155840 SKAP1Q86WV1 359 aa23.58■■□□□ 1.37
KCNQ1-201ENST00000155840 TMC1Q8TDI8 760 aa23.58■■□□□ 1.37
KCNQ1-201ENST00000155840 KDM6BO15054 1643 aa23.58■■□□□ 1.37
KCNQ1-201ENST00000155840 FANCIQ9NVI1 1328 aa23.57■■□□□ 1.36
KCNQ1-201ENST00000155840 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.57■■□□□ 1.36
KCNQ1-201ENST00000155840 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
KCNQ1-201ENST00000155840 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.55■■□□□ 1.36
KCNQ1-201ENST00000155840 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.51■■□□□ 1.35
KCNQ1-201ENST00000155840 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
KCNQ1-201ENST00000155840 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.51■■□□□ 1.35
KCNQ1-201ENST00000155840 PKD2Q13563 968 aa23.5■■□□□ 1.35
KCNQ1-201ENST00000155840 ZBED9Q6R2W3 1325 aa23.5■■□□□ 1.35
KCNQ1-201ENST00000155840 RGL3Q3MIN7 710 aa23.5■■□□□ 1.35
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