RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000064571.2

CBLN4-201, Transcript of cerebellin 4 precursor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CBLN4, Length 3,024 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLN4-201ENST00000064571 MIER1Q8N108 512 aa23.1■■□□□ 1.29
CBLN4-201ENST00000064571 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.07■■□□□ 1.28
CBLN4-201ENST00000064571 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
CBLN4-201ENST00000064571 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.04■■□□□ 1.28
CBLN4-201ENST00000064571 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.03■■□□□ 1.28
CBLN4-201ENST00000064571 ITGAEP38570 1179 aa23.02■■□□□ 1.28
CBLN4-201ENST00000064571 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.01■■□□□ 1.27
CBLN4-201ENST00000064571 ERCC6Q03468 1493 aa22.96■■□□□ 1.27
CBLN4-201ENST00000064571 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.96■■□□□ 1.27
CBLN4-201ENST00000064571 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.91■■□□□ 1.26
CBLN4-201ENST00000064571 ARID3CA6NKF2 412 aa22.91■■□□□ 1.26
CBLN4-201ENST00000064571 FBLN2P98095 1184 aa22.91■■□□□ 1.26
CBLN4-201ENST00000064571 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.87■■□□□ 1.25
CBLN4-201ENST00000064571 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
CBLN4-201ENST00000064571 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
CBLN4-201ENST00000064571 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
CBLN4-201ENST00000064571 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.72■■□□□ 1.23
CBLN4-201ENST00000064571 WDR97A6NE52 1622 aa22.69■■□□□ 1.22
CBLN4-201ENST00000064571 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
CBLN4-201ENST00000064571 CUL7Q14999 1698 aa22.66■■□□□ 1.22
CBLN4-201ENST00000064571 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.63■■□□□ 1.21
CBLN4-201ENST00000064571 GRIN2BQ13224 1484 aa22.62■■□□□ 1.21
CBLN4-201ENST00000064571 IFT140Q96RY7 1462 aa22.61■■□□□ 1.21
CBLN4-201ENST00000064571 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
CBLN4-201ENST00000064571 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
CBLN4-201ENST00000064571 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.59■■□□□ 1.21
CBLN4-201ENST00000064571 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.59■■□□□ 1.21
CBLN4-201ENST00000064571 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.58■■□□□ 1.2
CBLN4-201ENST00000064571 WDR62O43379 1518 aa22.58■■□□□ 1.2
CBLN4-201ENST00000064571 BCANQ96GW7 911 aa22.56■■□□□ 1.2
CBLN4-201ENST00000064571 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.55■■□□□ 1.2
CBLN4-201ENST00000064571 TIAM1Q13009 1591 aa22.53■■□□□ 1.2
CBLN4-201ENST00000064571 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.52■■□□□ 1.2
CBLN4-201ENST00000064571 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.51■■□□□ 1.19
CBLN4-201ENST00000064571 FMN1Q68DA7 1419 aa22.5■■□□□ 1.19
CBLN4-201ENST00000064571 PBRM1Q86U86 1689 aa22.5■■□□□ 1.19
CBLN4-201ENST00000064571 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.48■■□□□ 1.19
CBLN4-201ENST00000064571 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.47■■□□□ 1.19
CBLN4-201ENST00000064571 ADAMTS12P58397 1594 aa22.46■■□□□ 1.19
CBLN4-201ENST00000064571 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.46■■□□□ 1.19
CBLN4-201ENST00000064571 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
CBLN4-201ENST00000064571 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
CBLN4-201ENST00000064571 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
CBLN4-201ENST00000064571 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.41■■□□□ 1.18
CBLN4-201ENST00000064571 KCNH8Q96L42 1107 aa22.41■■□□□ 1.18
CBLN4-201ENST00000064571 IQGAP2Q13576 1575 aa22.39■■□□□ 1.17
CBLN4-201ENST00000064571 GRIN2AQ12879 1464 aa22.38■■□□□ 1.17
CBLN4-201ENST00000064571 JPH4Q96JJ6 628 aa22.38■■□□□ 1.17
CBLN4-201ENST00000064571 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.37■■□□□ 1.17
CBLN4-201ENST00000064571 BCL11AQ9H165 835 aa22.35■■□□□ 1.17
CBLN4-201ENST00000064571 ANP32EQ9BTT0 268 aa22.34■■□□□ 1.17
CBLN4-201ENST00000064571 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
CBLN4-201ENST00000064571 SAMD9Q5K651 1589 aa22.34■■□□□ 1.17
CBLN4-201ENST00000064571 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.33■■□□□ 1.16
CBLN4-201ENST00000064571 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
CBLN4-201ENST00000064571 MAP3K1Q13233 1512 aa22.3■■□□□ 1.16
CBLN4-201ENST00000064571 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.3■■□□□ 1.16
CBLN4-201ENST00000064571 SYNJ2O15056 1496 aa22.27■■□□□ 1.16
CBLN4-201ENST00000064571 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.26■■□□□ 1.15
CBLN4-201ENST00000064571 DISP1Q96F81 1524 aa22.24■■□□□ 1.15
CBLN4-201ENST00000064571 NCOA2Q15596 1464 aa22.24■■□□□ 1.15
CBLN4-201ENST00000064571 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
CBLN4-201ENST00000064571 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.24■■□□□ 1.15
CBLN4-201ENST00000064571 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.23■■□□□ 1.15
CBLN4-201ENST00000064571 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.22■■□□□ 1.15
CBLN4-201ENST00000064571 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.22■■□□□ 1.15
CBLN4-201ENST00000064571 CEP170Q5SW79 1584 aa22.21■■□□□ 1.15
CBLN4-201ENST00000064571 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
CBLN4-201ENST00000064571 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.15
CBLN4-201ENST00000064571 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.2■■□□□ 1.14
CBLN4-201ENST00000064571 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.2■■□□□ 1.14
CBLN4-201ENST00000064571 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.2■■□□□ 1.14
CBLN4-201ENST00000064571 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
CBLN4-201ENST00000064571 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.17■■□□□ 1.14
CBLN4-201ENST00000064571 FKBP8Q14318 412 aa22.17■■□□□ 1.14
CBLN4-201ENST00000064571 PTPRKQ15262 1439 aa22.16■■□□□ 1.14
CBLN4-201ENST00000064571 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.13■■□□□ 1.13
CBLN4-201ENST00000064571 KIAA0556O60303 1618 aa22.12■■□□□ 1.13
CBLN4-201ENST00000064571 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
CBLN4-201ENST00000064571 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
CBLN4-201ENST00000064571 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.1■■□□□ 1.13
CBLN4-201ENST00000064571 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CBLN4-201ENST00000064571 TRIM52Q96A61 297 aa22.09■■□□□ 1.13
CBLN4-201ENST00000064571 NUP160Q12769 1436 aa22.08■■□□□ 1.13
CBLN4-201ENST00000064571 HECW1Q76N89 1606 aa22.08■■□□□ 1.12
CBLN4-201ENST00000064571 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.07■■□□□ 1.12
CBLN4-201ENST00000064571 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
CBLN4-201ENST00000064571 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.05■■□□□ 1.12
CBLN4-201ENST00000064571 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
CBLN4-201ENST00000064571 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.02■■□□□ 1.12
CBLN4-201ENST00000064571 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.11
CBLN4-201ENST00000064571 FOXD1Q16676 465 aa22■■□□□ 1.11
CBLN4-201ENST00000064571 PTPRGP23470 1445 aa22■■□□□ 1.11
CBLN4-201ENST00000064571 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
CBLN4-201ENST00000064571 CLSPNQ9HAW4 1339 aa21.99■■□□□ 1.11
CBLN4-201ENST00000064571 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa21.97■■□□□ 1.11
CBLN4-201ENST00000064571 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
CBLN4-201ENST00000064571 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.95■■□□□ 1.1
CBLN4-201ENST00000064571 MAPKBP1O60336 1514 aa21.94■■□□□ 1.1
CBLN4-201ENST00000064571 NAIPQ13075 1403 aa21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.3 ms