RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000092629.3

Soga3-201, Transcript of Protein SOGA3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Soga3, Length 4,105 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3-201ENSMUST00000092629 Rad21Q61550 635 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
Soga3-201ENSMUST00000092629 Ythdc1E9Q5K9 736 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
Soga3-201ENSMUST00000092629 Ofd1Q80Z25 1017 aa21.27■■□□□ 1
Soga3-201ENSMUST00000092629 Ipo9Q91YE6 1041 aa21.27■■□□□ 1
Soga3-201ENSMUST00000092629 Spryd3E9Q9B3 442 aa21.27■□□□□ 0.99
Soga3-201ENSMUST00000092629 Pak3Q61036 559 aa21.26■□□□□ 0.99
Soga3-201ENSMUST00000092629 Znf710Q3U288 666 aa21.25■□□□□ 0.99
Soga3-201ENSMUST00000092629 Rtn4Q99P72 1162 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
Soga3-201ENSMUST00000092629 ChgaP26339 463 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
Soga3-201ENSMUST00000092629 Wwc2Q6NXJ0 1187 aa21.22■□□□□ 0.99
Soga3-201ENSMUST00000092629 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa21.21■□□□□ 0.99
Soga3-201ENSMUST00000092629 Lmod3E9QA62 571 aa21.21■□□□□ 0.99
Soga3-201ENSMUST00000092629 Tcerg1Q8CGF7 1100 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
Soga3-201ENSMUST00000092629 Sin3aQ60520 1274 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
Soga3-201ENSMUST00000092629 B4galnt3Q6L8S8 986 aa21.15■□□□□ 0.98
Soga3-201ENSMUST00000092629 Dbr1Q923B1 550 aa21.15■□□□□ 0.98
Soga3-201ENSMUST00000092629 AU015836B2RUM3 263 aa21.14■□□□□ 0.98
Soga3-201ENSMUST00000092629 Vsig10D3YX43 558 aa21.12■□□□□ 0.97
Soga3-201ENSMUST00000092629 Trim30dE9PWL0 497 aa21.12■□□□□ 0.97
Soga3-201ENSMUST00000092629 Hspa5P20029 655 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
Soga3-201ENSMUST00000092629 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa21.11■□□□□ 0.97
Soga3-201ENSMUST00000092629 Ccer2J3QPU5 274 aa21.1■□□□□ 0.97
Soga3-201ENSMUST00000092629 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
Soga3-201ENSMUST00000092629 Hsp90ab1P11499 724 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
Soga3-201ENSMUST00000092629 Chic2Q9D9G3 165 aa21.06■□□□□ 0.96
Soga3-201ENSMUST00000092629 Fgd1P52734 960 aa21.05■□□□□ 0.96
Soga3-201ENSMUST00000092629 Gm13697A2AK42 830 aa21.03■□□□□ 0.96
Soga3-201ENSMUST00000092629 Dnttip2Q8R2M2 758 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
Soga3-201ENSMUST00000092629 Trim44Q9QXA7 346 aa21.02■□□□□ 0.96
Soga3-201ENSMUST00000092629 Polr3glQ8R0C0 218 aa21.02■□□□□ 0.96
Soga3-201ENSMUST00000092629 BlmO88700 1416 aa21■□□□□ 0.95
Soga3-201ENSMUST00000092629 DekQ7TNV0 380 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
Soga3-201ENSMUST00000092629 Arid4bA2CG63 1314 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
Soga3-201ENSMUST00000092629 Ipo4Q8VI75 1082 aa20.97■□□□□ 0.95
Soga3-201ENSMUST00000092629 Apbb1Q9QXJ1 710 aa20.95■□□□□ 0.94
Soga3-201ENSMUST00000092629 Znf692Q3U381 531 aa20.95■□□□□ 0.94
Soga3-201ENSMUST00000092629 Prdm10Q3UTQ7 1184 aa20.94■□□□□ 0.94
Soga3-201ENSMUST00000092629 Exoc6Q8R313 802 aa20.94■□□□□ 0.94
Soga3-201ENSMUST00000092629 Ppm1gQ61074 542 aa20.93■□□□□ 0.94
Soga3-201ENSMUST00000092629 IbspQ61711 324 aa20.93■□□□□ 0.94
Soga3-201ENSMUST00000092629 Golga3P55937 1487 aa20.91■□□□□ 0.94
Soga3-201ENSMUST00000092629 Dnai1Q8C0M8 701 aa20.91■□□□□ 0.94
Soga3-201ENSMUST00000092629 Htatsf1Q8BGC0 757 aa20.89■□□□□ 0.93
Soga3-201ENSMUST00000092629 Os9Q8K2C7 672 aa20.87■□□□□ 0.93
Soga3-201ENSMUST00000092629 Rangap1P46061 589 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
Soga3-201ENSMUST00000092629 Setd5Q5XJV7 1441 aa20.85■□□□□ 0.93
Soga3-201ENSMUST00000092629 Plcb2A3KGF7 1181 aa20.85■□□□□ 0.93
Soga3-201ENSMUST00000092629 Sart3Q9JLI8 962 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
Soga3-201ENSMUST00000092629 Chmp5Q9D7S9 219 aa20.78■□□□□ 0.92
Soga3-201ENSMUST00000092629 Nlrp6Q91WS2 869 aa20.76■□□□□ 0.91
Soga3-201ENSMUST00000092629 Pdcl3Q8BVF2 240 aa20.76■□□□□ 0.91
Soga3-201ENSMUST00000092629 Iqcf3Q9D498 203 aa20.75■□□□□ 0.91
Soga3-201ENSMUST00000092629 Smg6P61406 1418 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
Soga3-201ENSMUST00000092629 Baz1aO88379 1555 aa20.73■□□□□ 0.91
Soga3-201ENSMUST00000092629 Washc2Q6PGL7 1334 aa20.73■□□□□ 0.91
Soga3-201ENSMUST00000092629 Rgl3Q3UYI5 709 aa20.7■□□□□ 0.9
Soga3-201ENSMUST00000092629 Armcx1Q9CX83 456 aa20.69■□□□□ 0.9
Soga3-201ENSMUST00000092629 Kcnh8P59111 1102 aa20.69■□□□□ 0.9
Soga3-201ENSMUST00000092629 ScribQ80U72 1612 aa20.68■□□□□ 0.9
Soga3-201ENSMUST00000092629 Tnnt2P50752 301 aa20.68■□□□□ 0.9
Soga3-201ENSMUST00000092629 Cep162Q6ZQ06 1403 aa20.64■□□□□ 0.9
Soga3-201ENSMUST00000092629 Trim26Q99PN3 545 aa20.63■□□□□ 0.89
Soga3-201ENSMUST00000092629 Eea1Q8BL66 1411 aa20.63■□□□□ 0.89
Soga3-201ENSMUST00000092629 Gm6268A2A3U9 297 aa20.63■□□□□ 0.89
Soga3-201ENSMUST00000092629 PtmaP26350 111 aa20.61■□□□□ 0.89
Soga3-201ENSMUST00000092629 EspnQ9ET47 871 aa20.61■□□□□ 0.89
Soga3-201ENSMUST00000092629 Neurod2Q62414 383 aa20.6■□□□□ 0.89
Soga3-201ENSMUST00000092629 Grwd1Q810D6 446 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
Soga3-201ENSMUST00000092629 Gm13695A2AK44 830 aa20.58■□□□□ 0.88
Soga3-201ENSMUST00000092629 Erich6bQ9D4S6 220 aa20.58■□□□□ 0.88
Soga3-201ENSMUST00000092629 Liat1Q810M6 228 aa20.58■□□□□ 0.88
Soga3-201ENSMUST00000092629 Rrp12Q6P5B0 1295 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
Soga3-201ENSMUST00000092629 SlkO54988 1233 aa20.56■□□□□ 0.88
Soga3-201ENSMUST00000092629 Baz1bQ9Z277 1479 aa20.55■□□□□ 0.88
Soga3-201ENSMUST00000092629 Arhgap27A2AB59 869 aa20.55■□□□□ 0.88
Soga3-201ENSMUST00000092629 Rpap1Q80TE0 1409 aa20.54■□□□□ 0.88
Soga3-201ENSMUST00000092629 Mre11Q61216 706 aa20.53■□□□□ 0.88
Soga3-201ENSMUST00000092629 Eif2s2Q99L45 331 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
Soga3-201ENSMUST00000092629 CatipB9EKE5 520 aa20.51■□□□□ 0.87
Soga3-201ENSMUST00000092629 Gtf2a1Q99PM3 378 aa20.5■□□□□ 0.87
Soga3-201ENSMUST00000092629 Slc4a2P13808 1237 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
Soga3-201ENSMUST00000092629 Ipo8Q7TMY7 1010 aa20.49■□□□□ 0.87
Soga3-201ENSMUST00000092629 Card11Q8CIS0 1159 aa20.48■□□□□ 0.87
Soga3-201ENSMUST00000092629 Rrp9Q91WM3 475 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
Soga3-201ENSMUST00000092629 Rwdd1Q9CQK7 243 aa20.46■□□□□ 0.87
Soga3-201ENSMUST00000092629 NudcO35685 332 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
Soga3-201ENSMUST00000092629 CntlnA2AM05 1397 aa20.44■□□□□ 0.86
Soga3-201ENSMUST00000092629 Ttll13A4Q9F6 804 aa20.44■□□□□ 0.86
Soga3-201ENSMUST00000092629 Cwc22Q8C5N3 908 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
Soga3-201ENSMUST00000092629 Erich6D3Z6S9 713 aa20.41■□□□□ 0.86
Soga3-201ENSMUST00000092629 DmtnQ9WV69 405 aa20.41■□□□□ 0.86
Soga3-201ENSMUST00000092629 AampJ3QN89 436 aa20.4■□□□□ 0.86
Soga3-201ENSMUST00000092629 Zfp777B9EKF4 885 aa20.39■□□□□ 0.85
Soga3-201ENSMUST00000092629 Mak16Q8BGS0 296 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
Soga3-201ENSMUST00000092629 Fbxo2Q80UW2 297 aa20.38■□□□□ 0.85
Soga3-201ENSMUST00000092629 Zscan21Q07231 555 aa20.38■□□□□ 0.85
Soga3-201ENSMUST00000092629 Znf316Q6PGE4 1016 aa20.37■□□□□ 0.85
Soga3-201ENSMUST00000092629 Egfem1Q8C088 590 aa20.36■□□□□ 0.85
Soga3-201ENSMUST00000092629 Mbd3Q9Z2D8 285 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
Soga3-201ENSMUST00000092629 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 38.2 ms