RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001872.4

Hoxd13-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd13, Length 2,483 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Stra8P70278 393 aa27,96■■■□□ 2,07
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 TnnQ80Z71 1560 aa27,96■■■□□ 2,07
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa27,93■■■□□ 2,06
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 PtprkP35822 1457 aa27,9■■■□□ 2,06
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Setd5Q5XJV7 1441 aa27,9■■■□□ 2,06
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 NclP09405 707 aaKnown RBP27,87■■■□□ 2,05
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 NrkQ9R0G8 1455 aa27,85■■■□□ 2,05
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Fam135aQ6NS59 1506 aa27,85■■■□□ 2,05
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Nolc1E9Q5C9 702 aaKnown RBP27,83■■■□□ 2,05
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP27,83■■■□□ 2,04
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Unc13aQ4KUS2 1712 aa27,81■■■□□ 2,04
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Tiam1Q60610 1591 aa27,8■■■□□ 2,04
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Calr4Q3TQS0 420 aa27,8■■■□□ 2,04
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Lamc3Q9R0B6 1581 aa27,73■■■□□ 2,03
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 UacaQ8CGB3 1411 aa27,72■■■□□ 2,03
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa27,71■■■□□ 2,03
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Rtl5Q5DTT4 599 aa27,69■■■□□ 2,02
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Naip1Q9QWK5 1403 aa27,69■■■□□ 2,02
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 BlmO88700 1416 aa27,69■■■□□ 2,02
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm13697A2AK42 830 aa27,68■■■□□ 2,02
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Fam50aQ9WV03 339 aaKnown RBP27,67■■■□□ 2,02
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ubl4bQ9CQ84 188 aa27,66■■■□□ 2,02
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP27,66■■■□□ 2,02
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Map3k1P53349 1493 aa27,63■■■□□ 2,01
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Hspa5P20029 655 aaKnown RBP27,61■■■□□ 2,01
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Shroom4Q1W617 1475 aa27,59■■■□□ 2,01
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Supt16hQ920B9 1047 aa27,58■■■□□ 2,01
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Slx4Q6P1D7 1565 aa27,54■■■□□ 2
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Erich3F6QRE9 1637 aa27,53■■■□□ 2
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Il27Q8K3I6 234 aa27,52■■■□□ 2
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ankrd36D3Z4K0 1415 aa27,52■■■□□ 2
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Smg6P61406 1418 aaKnown RBP27,51■■□□□ 1,99
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ankrd26Q811D2 1581 aa27,49■■□□□ 1,99
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Kif15Q6P9L6 1387 aa27,48■■□□□ 1,99
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Slc24a1Q91WD8 1130 aa27,47■■□□□ 1,99
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP27,47■■□□□ 1,99
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 3425401B19RikD3Z1D3 1412 aa27,47■■□□□ 1,99
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Pcf11G3X9Z4 1553 aa27,46■■□□□ 1,99
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 PrkcshO08795 521 aa27,46■■□□□ 1,99
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Camsap1A2AHC3 1581 aa27,45■■□□□ 1,99
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP27,45■■□□□ 1,99
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Washc2Q6PGL7 1334 aa27,45■■□□□ 1,99
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Fhad1A6PWD2 1420 aa27,43■■□□□ 1,98
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Sin3aQ60520 1274 aaKnown RBP27,43■■□□□ 1,98
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ccer2J3QPU5 274 aa27,42■■□□□ 1,98
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ppp4r2Q0VGB7 417 aa27,41■■□□□ 1,98
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Lmod2Q3UHZ5 550 aa27,41■■□□□ 1,98
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa27,39■■□□□ 1,98
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Wdr43Q6ZQL4 677 aaKnown RBP27,37■■□□□ 1,97
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Mia2Q91ZV0 1396 aa27,36■■□□□ 1,97
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Camsap2Q8C1B1 1461 aa27,36■■□□□ 1,97
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ncoa2Q61026 1462 aa27,35■■□□□ 1,97
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Vps8Q0P5W1 1427 aa27,32■■□□□ 1,96
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Lmo7E9PYF4 1699 aaKnown RBP27,28■■□□□ 1,96
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 CntlnA2AM05 1397 aa27,28■■□□□ 1,96
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP27,28■■□□□ 1,96
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Cux2P70298 1426 aa27,27■■□□□ 1,96
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Mrc2Q64449 1479 aa27,26■■□□□ 1,95
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Naip5Q9R016 1403 aa27,25■■□□□ 1,95
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Fyco1Q8VDC1 1437 aa27,24■■□□□ 1,95
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Efcab5A0JP43 1406 aa27,23■■□□□ 1,95
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Grin2bQ01097 1482 aa27,23■■□□□ 1,95
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Naip2Q9QUK4 1447 aa27,21■■□□□ 1,95
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Crocc2F6XLV1 1638 aa27,21■■□□□ 1,95
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Pak3Q61036 559 aa27,19■■□□□ 1,94
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Liat1Q810M6 228 aa27,16■■□□□ 1,94
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Cux1P53564 1515 aa27,14■■□□□ 1,94
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Mrs2Q5NCE8 434 aa27,11■■□□□ 1,93
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Peg3Q3URU2 1571 aa27,1■■□□□ 1,93
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 P3h3Q8CG70 732 aa27,09■■□□□ 1,93
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Slc4a2P13808 1237 aaKnown RBP27,08■■□□□ 1,93
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm7298A0A0N4SVU1 1476 aa27,08■■□□□ 1,93
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Cul7Q8VE73 1689 aa27,07■■□□□ 1,92
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ube2uB1AUC4 352 aa27,07■■□□□ 1,92
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Pprc1Q6NZN1 1644 aa27,07■■□□□ 1,92
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Dennd4bQ3U1Y4 1499 aa27,06■■□□□ 1,92
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Egfem1Q8C088 590 aa27,05■■□□□ 1,92
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Carmil1Q6EDY6 1374 aa27,03■■□□□ 1,92
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP27,03■■□□□ 1,92
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 A2mQ6GQT1 1474 aa27,03■■□□□ 1,92
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm1043A0A140LJC2 1431 aa27,01■■□□□ 1,91
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Wwc2Q6NXJ0 1187 aa26,99■■□□□ 1,91
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP26,99■■□□□ 1,91
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Chic2Q9D9G3 165 aa26,97■■□□□ 1,91
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm13695A2AK44 830 aa26,95■■□□□ 1,91
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Aebp1Q640N1 1128 aa26,95■■□□□ 1,9
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Exoc6Q8R313 802 aa26,94■■□□□ 1,9
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ncoa1P70365 1447 aa26,94■■□□□ 1,9
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 NrdcQ8BHG1 1161 aa26,93■■□□□ 1,9
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ccdc27Q3V036 639 aa26,91■■□□□ 1,9
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Kif21aQ9QXL2 1672 aa26,9■■□□□ 1,9
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa26,9■■□□□ 1,9
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Upf2A2AT37 1269 aaKnown RBP26,9■■□□□ 1,9
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa26,89■■□□□ 1,9
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Fhod3Q76LL6 1578 aa26,89■■□□□ 1,9
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Slc4a3P16283 1227 aa26,89■■□□□ 1,89
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP26,88■■□□□ 1,89
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP26,87■■□□□ 1,89
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Mphosph9A6H5Y1 991 aa26,84■■□□□ 1,89
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 PnisrA2AJT4 805 aaKnown RBP26,83■■□□□ 1,89
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 18,6 ms