RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558300.1

TMOD3-202, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 2

Gene TMOD3, Length 430 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-202ENST00000558300 TMEM262E9PQX1 116 aa0.97□□□□□ -2.25
TMOD3-202ENST00000558300 F2Z2F3 143 aa0.97□□□□□ -2.25
TMOD3-202ENST00000558300 SPINK8P0C7L1 97 aa0.97□□□□□ -2.25
TMOD3-202ENST00000558300 C10orf128Q5T292 105 aa0.97□□□□□ -2.25
TMOD3-202ENST00000558300 Q5VV11 94 aa0.97□□□□□ -2.25
TMOD3-202ENST00000558300 ACBD7Q8N6N7 88 aa0.97□□□□□ -2.25
TMOD3-202ENST00000558300 SMIM11BQ8TCY0 68 aa0.97□□□□□ -2.25
TMOD3-202ENST00000558300 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa0.96□□□□□ -2.26
TMOD3-202ENST00000558300 SNCAP37840 140 aa0.96□□□□□ -2.26
TMOD3-202ENST00000558300 C6orf52Q5T4I8 152 aa0.96□□□□□ -2.26
TMOD3-202ENST00000558300 Q9H521 79 aa0.96□□□□□ -2.26
TMOD3-202ENST00000558300 MRC1P22897 1456 aa0.96□□□□□ -2.26
TMOD3-202ENST00000558300 SCAPERQ9BY12 1400 aa0.96□□□□□ -2.26
TMOD3-202ENST00000558300 F5P12259 2224 aa0.96□□□□□ -2.26
TMOD3-202ENST00000558300 CCNB3Q8WWL7 1395 aa0.96□□□□□ -2.26
TMOD3-202ENST00000558300 JMJD1CQ15652 2540 aa0.95□□□□□ -2.26
TMOD3-202ENST00000558300 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa0.95□□□□□ -2.26
TMOD3-202ENST00000558300 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP0.95□□□□□ -2.26
TMOD3-202ENST00000558300 A0A0D9SG42 100 aa0.95□□□□□ -2.26
TMOD3-202ENST00000558300 S100A10P60903 97 aa0.95□□□□□ -2.26
TMOD3-202ENST00000558300 VMO1Q7Z5L0 202 aa0.95□□□□□ -2.26
TMOD3-202ENST00000558300 BAGE3Q86Y29 109 aa0.95□□□□□ -2.26
TMOD3-202ENST00000558300 MGST2Q99735 147 aa0.95□□□□□ -2.26
TMOD3-202ENST00000558300 TANC1Q9C0D5 1861 aa0.95□□□□□ -2.26
TMOD3-202ENST00000558300 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa0.94□□□□□ -2.26
TMOD3-202ENST00000558300 TMEM14DPA8MWL7 114 aa0.94□□□□□ -2.26
TMOD3-202ENST00000558300 PPP1R17O96001 155 aa0.94□□□□□ -2.26
TMOD3-202ENST00000558300 S100A8P05109 93 aa0.94□□□□□ -2.26
TMOD3-202ENST00000558300 ACYP2P14621 99 aa0.94□□□□□ -2.26
TMOD3-202ENST00000558300 GNG11P61952 73 aa0.94□□□□□ -2.26
TMOD3-202ENST00000558300 C10orf95Q9H7T3 257 aa0.94□□□□□ -2.26
TMOD3-202ENST00000558300 NPVFQ9HCQ7 196 aa0.94□□□□□ -2.26
TMOD3-202ENST00000558300 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa0.94□□□□□ -2.26
TMOD3-202ENST00000558300 LINC00474Q9P2X8 69 aa0.94□□□□□ -2.26
TMOD3-202ENST00000558300 R4GMQ9 66 aa0.94□□□□□ -2.26
TMOD3-202ENST00000558300 DOCK1Q14185 1865 aa0.93□□□□□ -2.26
TMOD3-202ENST00000558300 PRDM2Q13029 1718 aa0.93□□□□□ -2.26
TMOD3-202ENST00000558300 SSC5DA1L4H1 1573 aa0.93□□□□□ -2.26
TMOD3-202ENST00000558300 KRTDAPP60985 99 aa0.93□□□□□ -2.26
TMOD3-202ENST00000558300 DYNLRB1Q9NP97 96 aa0.93□□□□□ -2.26
TMOD3-202ENST00000558300 UQCR10Q9UDW1 63 aa0.93□□□□□ -2.26
TMOD3-202ENST00000558300 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa0.93□□□□□ -2.26
TMOD3-202ENST00000558300 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP0.93□□□□□ -2.26
TMOD3-202ENST00000558300 ZNF462Q96JM2 2506 aa0.92□□□□□ -2.26
TMOD3-202ENST00000558300 NAV3Q8IVL0 2385 aa0.92□□□□□ -2.26
TMOD3-202ENST00000558300 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa0.92□□□□□ -2.26
TMOD3-202ENST00000558300 MYOM1P52179 1685 aa0.92□□□□□ -2.26
TMOD3-202ENST00000558300 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa0.92□□□□□ -2.26
TMOD3-202ENST00000558300 M0R143 59 aa0.92□□□□□ -2.26
TMOD3-202ENST00000558300 LINC00032P0C843 101 aa0.92□□□□□ -2.26
TMOD3-202ENST00000558300 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa0.92□□□□□ -2.26
TMOD3-202ENST00000558300 AMELXQ99217 191 aa0.92□□□□□ -2.26
TMOD3-202ENST00000558300 PRR15LQ9BU68 103 aa0.92□□□□□ -2.26
TMOD3-202ENST00000558300 GOLGA3Q08378 1498 aa0.92□□□□□ -2.26
TMOD3-202ENST00000558300 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa0.91□□□□□ -2.26
TMOD3-202ENST00000558300 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa0.91□□□□□ -2.26
TMOD3-202ENST00000558300 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa0.91□□□□□ -2.26
TMOD3-202ENST00000558300 LOC285556D6RIA3 1793 aa0.91□□□□□ -2.26
TMOD3-202ENST00000558300 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa0.91□□□□□ -2.26
TMOD3-202ENST00000558300 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa0.91□□□□□ -2.26
TMOD3-202ENST00000558300 NAP1L6A6NFF2 107 aa0.91□□□□□ -2.26
TMOD3-202ENST00000558300 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa0.91□□□□□ -2.26
TMOD3-202ENST00000558300 TRAPPC2P0DI81 140 aa0.91□□□□□ -2.26
TMOD3-202ENST00000558300 TRAPPC2BP0DI82 140 aa0.91□□□□□ -2.26
TMOD3-202ENST00000558300 SPAG11BQ08648 103 aa0.91□□□□□ -2.26
TMOD3-202ENST00000558300 SPAG11AQ6PDA7 123 aa0.91□□□□□ -2.26
TMOD3-202ENST00000558300 TSLPQ969D9 159 aa0.91□□□□□ -2.26
TMOD3-202ENST00000558300 MANBALQ9NQG1 85 aa0.91□□□□□ -2.26
TMOD3-202ENST00000558300 V9GYH0 126 aa0.91□□□□□ -2.26
TMOD3-202ENST00000558300 MYH8P13535 1937 aa0.91□□□□□ -2.26
TMOD3-202ENST00000558300 PI4KAP42356 2102 aa0.91□□□□□ -2.26
TMOD3-202ENST00000558300 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa0.9□□□□□ -2.27
TMOD3-202ENST00000558300 GNGT2O14610 69 aa0.9□□□□□ -2.27
TMOD3-202ENST00000558300 S100A3P33764 101 aa0.9□□□□□ -2.27
TMOD3-202ENST00000558300 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa0.9□□□□□ -2.27
TMOD3-202ENST00000558300 TMEM170BQ5T4T1 132 aa0.9□□□□□ -2.27
TMOD3-202ENST00000558300 Q6ZRX8 168 aa0.9□□□□□ -2.27
TMOD3-202ENST00000558300 FAIMQ9NVQ4 179 aa0.9□□□□□ -2.27
TMOD3-202ENST00000558300 TEX14Q8IWB6 1497 aa0.9□□□□□ -2.27
TMOD3-202ENST00000558300 ABCC5O15440 1437 aa0.89□□□□□ -2.27
TMOD3-202ENST00000558300 IFT172Q9UG01 1749 aa0.89□□□□□ -2.27
TMOD3-202ENST00000558300 DOCK2Q92608 1830 aa0.89□□□□□ -2.27
TMOD3-202ENST00000558300 TET3O43151 1660 aa0.89□□□□□ -2.27
TMOD3-202ENST00000558300 GAPVD1Q14C86 1478 aa0.89□□□□□ -2.27
TMOD3-202ENST00000558300 FYCO1Q9BQS8 1478 aa0.89□□□□□ -2.27
TMOD3-202ENST00000558300 SHANK2Q9UPX8 1470 aa0.89□□□□□ -2.27
TMOD3-202ENST00000558300 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa0.89□□□□□ -2.27
TMOD3-202ENST00000558300 M0R135 149 aa0.89□□□□□ -2.27
TMOD3-202ENST00000558300 HMGN4O00479 90 aa0.89□□□□□ -2.27
TMOD3-202ENST00000558300 APOC3P02656 99 aa0.89□□□□□ -2.27
TMOD3-202ENST00000558300 GCHFRP30047 84 aa0.89□□□□□ -2.27
TMOD3-202ENST00000558300 UBE2D3P61077 147 aa0.89□□□□□ -2.27
TMOD3-202ENST00000558300 PKIAP61925 76 aa0.89□□□□□ -2.27
TMOD3-202ENST00000558300 UBE2D2P62837 147 aa0.89□□□□□ -2.27
TMOD3-202ENST00000558300 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP0.89□□□□□ -2.27
TMOD3-202ENST00000558300 VAMP8Q9BV40 100 aa0.89□□□□□ -2.27
TMOD3-202ENST00000558300 PROK2Q9HC23 129 aa0.89□□□□□ -2.27
TMOD3-202ENST00000558300 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa0.89□□□□□ -2.27
TMOD3-202ENST00000558300 ABCC10Q5T3U5 1492 aa0.88□□□□□ -2.27
TMOD3-202ENST00000558300 UBA52P62987 128 aaKnown RBP0.88□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.3 ms