RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462125.5

C9orf3-210, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-210ENST00000462125 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
C9orf3-210ENST00000462125 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
C9orf3-210ENST00000462125 M0R381 172 aa8.86□□□□□ -0.99
C9orf3-210ENST00000462125 CTRLP40313 264 aa8.86□□□□□ -0.99
C9orf3-210ENST00000462125 CAMPP49913 170 aa8.86□□□□□ -0.99
C9orf3-210ENST00000462125 BAGE3Q86Y29 109 aa8.86□□□□□ -0.99
C9orf3-210ENST00000462125 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa8.86□□□□□ -0.99
C9orf3-210ENST00000462125 A0A087WWL8 130 aa8.85□□□□□ -0.99
C9orf3-210ENST00000462125 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa8.85□□□□□ -0.99
C9orf3-210ENST00000462125 LRCOL1A6NCL2 159 aa8.85□□□□□ -0.99
C9orf3-210ENST00000462125 SNAI2O43623 268 aa8.85□□□□□ -0.99
C9orf3-210ENST00000462125 HIST1H2BLQ99880 126 aa8.85□□□□□ -0.99
C9orf3-210ENST00000462125 IGHV3-30P01768 117 aa8.84□□□□□ -0.99
C9orf3-210ENST00000462125 IGHV3-33P01772 117 aa8.84□□□□□ -0.99
C9orf3-210ENST00000462125 IGLC6P0CF74 106 aa8.84□□□□□ -0.99
C9orf3-210ENST00000462125 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa8.84□□□□□ -0.99
C9orf3-210ENST00000462125 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa8.84□□□□□ -0.99
C9orf3-210ENST00000462125 FABP4P15090 132 aa8.84□□□□□ -0.99
C9orf3-210ENST00000462125 LAGE3Q14657 143 aa8.84□□□□□ -0.99
C9orf3-210ENST00000462125 FAM74A4Q5TZK3 123 aa8.84□□□□□ -0.99
C9orf3-210ENST00000462125 Q8N1X5 172 aa8.84□□□□□ -0.99
C9orf3-210ENST00000462125 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa8.84□□□□□ -0.99
C9orf3-210ENST00000462125 OR10D4PQ8NGN7 298 aa8.84□□□□□ -0.99
C9orf3-210ENST00000462125 C12orf57Q99622 126 aa8.84□□□□□ -0.99
C9orf3-210ENST00000462125 CNFNQ9BYD5 112 aa8.84□□□□□ -0.99
C9orf3-210ENST00000462125 OR5AL1P0C617 328 aa8.83□□□□□ -1
C9orf3-210ENST00000462125 GZMBP10144 247 aa8.83□□□□□ -1
C9orf3-210ENST00000462125 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP8.83□□□□□ -1
C9orf3-210ENST00000462125 CACNG7P62955 275 aa8.83□□□□□ -1
C9orf3-210ENST00000462125 LYZL1Q6UWQ5 148 aa8.83□□□□□ -1
C9orf3-210ENST00000462125 IFITM10A6NMD0 228 aa8.82□□□□□ -1
C9orf3-210ENST00000462125 PDZD11Q5EBL8 140 aa8.82□□□□□ -1
C9orf3-210ENST00000462125 OR10AG1Q8NH19 301 aa8.82□□□□□ -1
C9orf3-210ENST00000462125 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
C9orf3-210ENST00000462125 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa8.81□□□□□ -1
C9orf3-210ENST00000462125 PSCAO43653 123 aa8.81□□□□□ -1
C9orf3-210ENST00000462125 SERF1AO75920 110 aa8.81□□□□□ -1
C9orf3-210ENST00000462125 UBE2D3P61077 147 aa8.81□□□□□ -1
C9orf3-210ENST00000462125 UBE2D2P62837 147 aa8.81□□□□□ -1
C9orf3-210ENST00000462125 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
C9orf3-210ENST00000462125 KIAA1644Q3SXP7 199 aa8.81□□□□□ -1
C9orf3-210ENST00000462125 SMIM15Q7Z3B0 74 aa8.81□□□□□ -1
C9orf3-210ENST00000462125 Q8N3U1 123 aa8.81□□□□□ -1
C9orf3-210ENST00000462125 C18orf32Q8TCD1 76 aa8.81□□□□□ -1
C9orf3-210ENST00000462125 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
C9orf3-210ENST00000462125 TPPP3Q9BW30 176 aa8.81□□□□□ -1
C9orf3-210ENST00000462125 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa8.8□□□□□ -1
C9orf3-210ENST00000462125 RAB4AP20338 218 aa8.8□□□□□ -1
C9orf3-210ENST00000462125 XGP55808 180 aa8.8□□□□□ -1
C9orf3-210ENST00000462125 KRTAP10-1P60331 282 aa8.8□□□□□ -1
C9orf3-210ENST00000462125 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
C9orf3-210ENST00000462125 NIT1Q86X76 327 aa8.8□□□□□ -1
C9orf3-210ENST00000462125 TM2D2Q9BX73 214 aa8.8□□□□□ -1
C9orf3-210ENST00000462125 TMEM191AQ9H0A3 160 aa8.8□□□□□ -1
C9orf3-210ENST00000462125 Q9HAA7 133 aa8.8□□□□□ -1
C9orf3-210ENST00000462125 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
C9orf3-210ENST00000462125 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa8.8□□□□□ -1
C9orf3-210ENST00000462125 PPBPP02775 128 aa8.79□□□□□ -1
C9orf3-210ENST00000462125 PMCHP20382 165 aa8.79□□□□□ -1
C9orf3-210ENST00000462125 GCSHP23434 173 aa8.79□□□□□ -1
C9orf3-210ENST00000462125 S100A12P80511 92 aa8.79□□□□□ -1
C9orf3-210ENST00000462125 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
C9orf3-210ENST00000462125 SPANXN1Q5VSR9 72 aa8.79□□□□□ -1
C9orf3-210ENST00000462125 Q8N814 137 aa8.79□□□□□ -1
C9orf3-210ENST00000462125 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
C9orf3-210ENST00000462125 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
C9orf3-210ENST00000462125 TWIST1Q15672 202 aa8.78□□□□□ -1
C9orf3-210ENST00000462125 FAM104BQ5XKR9 115 aa8.78□□□□□ -1
C9orf3-210ENST00000462125 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa8.78□□□□□ -1
C9orf3-210ENST00000462125 CHCHD7Q9BUK0 85 aa8.78□□□□□ -1
C9orf3-210ENST00000462125 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa8.78□□□□□ -1
C9orf3-210ENST00000462125 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa8.77□□□□□ -1.01
C9orf3-210ENST00000462125 MUC21A0A140T8X8 626 aa8.77□□□□□ -1.01
C9orf3-210ENST00000462125 HSBP1O75506 76 aa8.77□□□□□ -1.01
C9orf3-210ENST00000462125 NTF3P20783 257 aa8.77□□□□□ -1.01
C9orf3-210ENST00000462125 PYY3Q5JQD4 70 aa8.77□□□□□ -1.01
C9orf3-210ENST00000462125 ORMDL3Q8N138 153 aa8.77□□□□□ -1.01
C9orf3-210ENST00000462125 COX11Q9Y6N1 276 aa8.77□□□□□ -1.01
C9orf3-210ENST00000462125 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa8.76□□□□□ -1.01
C9orf3-210ENST00000462125 AMTP48728 403 aa8.76□□□□□ -1.01
C9orf3-210ENST00000462125 ZNF56Q15929 161 aa8.76□□□□□ -1.01
C9orf3-210ENST00000462125 IQCJQ1A5X6 159 aa8.76□□□□□ -1.01
C9orf3-210ENST00000462125 NIT2Q9NQR4 276 aa8.76□□□□□ -1.01
C9orf3-210ENST00000462125 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa8.75□□□□□ -1.01
C9orf3-210ENST00000462125 LINC00310P59036 64 aa8.75□□□□□ -1.01
C9orf3-210ENST00000462125 SSTP61278 116 aa8.75□□□□□ -1.01
C9orf3-210ENST00000462125 KLK12Q9UKR0 248 aa8.75□□□□□ -1.01
C9orf3-210ENST00000462125 FAT1Q14517 4588 aa8.75□□□□□ -1.01
C9orf3-210ENST00000462125 A0A087WX48 190 aa8.74□□□□□ -1.01
C9orf3-210ENST00000462125 F5H697 171 aa8.74□□□□□ -1.01
C9orf3-210ENST00000462125 NUPR1O60356 82 aa8.74□□□□□ -1.01
C9orf3-210ENST00000462125 SMIM17P0DL12 118 aa8.74□□□□□ -1.01
C9orf3-210ENST00000462125 WFDC2Q14508 124 aa8.74□□□□□ -1.01
C9orf3-210ENST00000462125 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
C9orf3-210ENST00000462125 PRELID3AQ96N28 172 aa8.74□□□□□ -1.01
C9orf3-210ENST00000462125 AP1S3Q96PC3 154 aa8.74□□□□□ -1.01
C9orf3-210ENST00000462125 M0QY20 66 aa8.73□□□□□ -1.01
C9orf3-210ENST00000462125 LINC00614P0C842 121 aa8.73□□□□□ -1.01
C9orf3-210ENST00000462125 CKS2P33552 79 aa8.73□□□□□ -1.01
C9orf3-210ENST00000462125 TMEM97Q5BJF2 176 aa8.73□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 96 ms