RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000075084.4

Trim58-201, Transcript of E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trim58, Length 2,192 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58-201ENSMUST00000075084 Meox2P32443 303 aa14.71□□□□□ -0.05
Trim58-201ENSMUST00000075084 Fam173aQ501J2 229 aa14.71□□□□□ -0.05
Trim58-201ENSMUST00000075084 Olfr411Q7TRW8 315 aa14.71□□□□□ -0.05
Trim58-201ENSMUST00000075084 Tmem167bQ80X45 74 aa14.71□□□□□ -0.05
Trim58-201ENSMUST00000075084 Gm10309Q8C648 119 aa14.71□□□□□ -0.05
Trim58-201ENSMUST00000075084 Ovol1Q9WTJ2 267 aa14.71□□□□□ -0.05
Trim58-201ENSMUST00000075084 Igkv14-130A0A0G2JF45 117 aa14.7□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Platr25A0A1Y7VIZ1 466 aa14.7□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Tnfsf11O35235 316 aa14.7□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Adat3Q6PAT0 349 aa14.7□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Vmn1r70Q8R254 298 aa14.7□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Olfr211Q8VGH2 309 aa14.7□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Olfr1272Q8VGN8 308 aa14.7□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Ighv1-31A0A0A6YWK5 117 aa14.7□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Igkv1-131A0A140T8M8 120 aa14.7□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Mettl8A2AUU0 281 aa14.7□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Olfr609E9Q4X7 319 aa14.7□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Pfn1P62962 140 aa14.7□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 2810408A11RikQ6NSU2 435 aa14.7□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Zfp420Q7TMN8 578 aa14.7□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Gm9949Q8C9F4 104 aa14.7□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Olfr1102Q8VES2 324 aa14.7□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Olfr577Q8VH11 312 aa14.7□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 ChodlQ9CXM0 273 aa14.7□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Ssbp3Q9D032 388 aa14.7□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Cml1Q9JIZ0 222 aa14.7□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Kcnip3Q9QXT8 256 aa14.7□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Irf2bp2E9Q1P8 570 aa14.69□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 P01787 123 aa14.69□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Gm4792Q569Q2 183 aa14.69□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Znrf2Q71FD5 238 aa14.69□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Dram1Q9DC58 238 aa14.69□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 PigpQ9JHG1 132 aa14.69□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Gab2Q9Z1S8 665 aa14.69□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Myo9aQ8C170 2542 aa14.69□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Csmd1Q923L3 3564 aa14.68□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Vma21-psA0A140T8R2 101 aa14.68□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Olfr1191-ps1A0A1L1STD5 311 aa14.68□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Olfr1024A2ASU7 327 aa14.68□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Samt1A2BED8 237 aa14.68□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Gm15140A2BEE3 237 aa14.68□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 eef1akmt3D3YWP0 232 aa14.68□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Gm9970F6ZED4 185 aa14.68□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Casp6O08738 276 aa14.68□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Fgfbp1O70514 251 aa14.68□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Evi2aP20934 223 aa14.68□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Hmx3P42581 356 aa14.68□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Sult1a1P52840 291 aa14.68□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Gm10803Q3TZS6 135 aa14.68□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 HaaoQ78JT3 286 aa14.68□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Angptl6Q8R0Z6 457 aa14.68□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Olfr1445Q8VFW9 314 aa14.68□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Hdgfl3Q9JMG7 202 aa14.68□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Mixl1Q9WUI0 231 aa14.68□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Hoxa5P09021 270 aa14.68□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Mrps10Q80ZK0 160 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Olfr123Q8VFQ1 309 aa14.68□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Shisal2bQ9D1Y9 158 aa14.68□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Pus1Q9WU56 423 aa14.68□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Ighv14-2A0A075B5R7 117 aa14.67□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Ighv1-39A0A075B5V5 117 aa14.67□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 CntfrO88507 372 aa14.67□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Cd79bP15530 228 aa14.67□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Edn1P22387 202 aa14.67□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Olfr1434Q7TQR9 312 aa14.67□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Olfr1535Q7TQU0 326 aa14.67□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Cox19Q8K0C8 92 aa14.67□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Nicn1Q9CQM0 213 aa14.67□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Pygo1Q9D0P5 417 aa14.67□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Tmem239Q9DA47 151 aa14.67□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Gpa33Q9JKA5 319 aa14.67□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Dolpp1Q9JMF7 238 aa14.67□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Timm23Q9WTQ8 209 aa14.67□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Gm10203F6QJ09 66 aa14.67□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 ColqO35348 457 aa14.67□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Ptbp1P17225 527 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Vstm2aQ8R0A6 236 aa14.67□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Olfr1242Q8VGM6 306 aa14.67□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Parm1Q923D3 296 aa14.67□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Errfi1Q99JZ7 461 aa14.67□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Tm2d1Q99MB3 208 aa14.67□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Col6a4A2AX52 2309 aa14.67□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Gm9195A0A140LHT4 2805 aa14.66□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Trav4-4-dv10A0A075B651 110 aa14.66□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Olfr624F8VQI7 308 aa14.66□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 HexbP20060 536 aa14.66□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 NdnP25233 325 aa14.66□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Sfrp2P97299 295 aa14.66□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Olfr435Q8VFS3 313 aa14.66□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Olfr1258Q8VGN6 311 aa14.66□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Rnf2Q9CQJ4 336 aa14.66□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Zdhhc16Q9ESG8 361 aa14.66□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Gm44596A0A0N4SVA0 210 aa14.66□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Vmn1r78K7N608 313 aa14.66□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 LtaP09225 202 aa14.66□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 F7P70375 446 aa14.66□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Olfr147Q60886 317 aa14.66□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Srsf1Q6PDM2 248 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 Rnase2aQ8K196 155 aa14.66□□□□□ -0.06
Trim58-201ENSMUST00000075084 AU041133A0A0J9YVH3 498 aa14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 61.3 ms