RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000073961.7

Ptpre-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptpre, Length 5,410 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpre-201ENSMUST00000073961 1700067P10RikG3X8U2 183 aa14.6□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Pax9P47242 342 aa14.6□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Supt4h1aP63271 117 aa14.6□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Gng5Q80SZ7 68 aa14.6□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 GchfrP99025 84 aa14.6□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Samd10Q7TST3 202 aa14.6□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 NracQ8BNX7 165 aa14.6□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Spink6Q8BT20 105 aa14.6□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Olfr523Q8VFE7 317 aa14.6□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Siglec12Q91Y57 467 aa14.6□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Tex36Q9D5N9 219 aa14.6□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 eef1akmt3D3YWP0 232 aa14.6□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Olfr779E9PUS9 130 aa14.6□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Gm21974F6W3F3 119 aa14.6□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 CrygsO35486 178 aa14.6□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Vmn1r70Q8R254 298 aa14.6□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Fbln7Q501P1 440 aa14.6□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Igkv4-91A0A075B5L2 119 aa14.59□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Efnb3O35393 340 aa14.59□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 LtaP09225 202 aa14.59□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Gm12888Q3UW77 119 aa14.59□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Cacna1bO55017 2327 aa14.59□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Fam117aQ7TNF9 451 aa14.59□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Ifitm2Q99J93 144 aa14.59□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Higd1bQ99JY6 98 aa14.59□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Reg4Q9D8G5 157 aa14.59□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 V1ra8Q9EQ48 279 aa14.59□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 4931422A03RikA2BHN9 113 aa14.59□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Gm20878L7N244 103 aa14.59□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Zfp36l2P23949 484 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Gm10842Q3U587 122 aa14.59□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Gm10912Q3UXH0 145 aa14.59□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Olfr1419Q7TQS2 343 aa14.59□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Poc1aQ8JZX3 405 aa14.59□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 4930544G11RikQ9CR99 193 aa14.59□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Siglec15A7E1W8 342 aa14.58□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Olfr322Q5NCC8 327 aa14.58□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Ighv1-67A0A0G2JFN9 117 aa14.58□□□□□ -0.08
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Shisal1Q0VBP7 198 aa14.58□□□□□ -0.08
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Cphx2Q8BX39 182 aa14.58□□□□□ -0.08
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Muc15Q8C6Z1 331 aa14.58□□□□□ -0.08
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Trav4-4-dv10A0A075B651 110 aa14.58□□□□□ -0.08
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Ighv7-2A0A0A6YX91 119 aa14.58□□□□□ -0.08
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Ighv1-76A0A0G2JFE9 117 aa14.58□□□□□ -0.08
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Trav7-5A0A0G2JFX6 112 aa14.58□□□□□ -0.08
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Gm20458E9PXJ7 78 aa14.58□□□□□ -0.08
Ptpre-201ENSMUST00000073961 UngP97931 306 aa14.58□□□□□ -0.08
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Gm10645Q3UPY1 145 aa14.58□□□□□ -0.08
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Prss41Q920S2 322 aa14.58□□□□□ -0.08
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Gm45717A0A1B0GT68 152 aa14.57□□□□□ -0.08
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Foxc2Q61850 494 aa14.57□□□□□ -0.08
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Dusp14Q9JLY7 198 aa14.57□□□□□ -0.08
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Plxna1P70206 1894 aa14.57□□□□□ -0.08
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Sumo2P61957 95 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Slc25a47Q6IS41 310 aa14.57□□□□□ -0.08
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Spta1P08032 2415 aa14.57□□□□□ -0.08
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Gm20854Q62461 227 aa14.57□□□□□ -0.08
Ptpre-201ENSMUST00000073961 H2-DMb2Q31099 261 aa14.57□□□□□ -0.08
Ptpre-201ENSMUST00000073961 DnlzQ9D113 177 aa14.57□□□□□ -0.08
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Iah1Q9DB29 249 aa14.57□□□□□ -0.08
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Timp3P39876 211 aa14.56□□□□□ -0.08
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Sh3bgrl3Q91VW3 93 aa14.56□□□□□ -0.08
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Rnf115Q9D0C1 305 aa14.56□□□□□ -0.08
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Hs3st3b1Q9QZS6 390 aa14.56□□□□□ -0.08
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Dkk1O54908 272 aa14.56□□□□□ -0.08
Ptpre-201ENSMUST00000073961 PcolceQ61398 468 aa14.56□□□□□ -0.08
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Psmg3Q9CZH3 122 aa14.56□□□□□ -0.08
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Morn2Q6UL01 79 aa14.56□□□□□ -0.08
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Olfr33Q8VGX7 318 aa14.56□□□□□ -0.08
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Trav6d-3A0A075B6B3 112 aa14.56□□□□□ -0.08
Ptpre-201ENSMUST00000073961 PspnO70300 156 aa14.56□□□□□ -0.08
Ptpre-201ENSMUST00000073961 ApohQ01339 345 aa14.56□□□□□ -0.08
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Tmem241Q3UME2 297 aa14.56□□□□□ -0.08
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Trav6-3Q5R1E6 112 aa14.56□□□□□ -0.08
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Tnfrsf9P20334 256 aa14.56□□□□□ -0.08
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Dynlt3P56387 116 aa14.56□□□□□ -0.08
Ptpre-201ENSMUST00000073961 PlnP61014 52 aa14.56□□□□□ -0.08
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Znf691Q3TDE8 283 aa14.56□□□□□ -0.08
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Mbnl2Q8C181 373 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
Ptpre-201ENSMUST00000073961 BC106179Q8C9L1 186 aa14.56□□□□□ -0.08
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Gbf1Q6DFZ1 1861 aa14.55□□□□□ -0.08
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Otx1P80205 355 aa14.55□□□□□ -0.08
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Asphd1Q2TA57 360 aa14.55□□□□□ -0.08
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Olfr498Q8VEW2 330 aa14.55□□□□□ -0.08
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Q91WE4 72 aa14.55□□□□□ -0.08
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Rnf126Q91YL2 313 aa14.55□□□□□ -0.08
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Arid2E9Q7E2 1828 aa14.55□□□□□ -0.08
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Zdbf2Q5SS00 2493 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Igh-VJ558P01758 117 aa14.55□□□□□ -0.08
Ptpre-201ENSMUST00000073961 C1qtnf9Q4ZJN1 333 aa14.55□□□□□ -0.08
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Trav7n-4A0A075B620 113 aa14.55□□□□□ -0.08
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Igkv9-123A0A140T8N8 117 aa14.55□□□□□ -0.08
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Phlda3Q9WV95 125 aa14.55□□□□□ -0.08
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Fbln5Q9WVH9 448 aa14.55□□□□□ -0.08
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Prima1Q810F0 153 aa14.55□□□□□ -0.08
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Rnf151Q9CQ29 239 aa14.55□□□□□ -0.08
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Dkk2Q9QYZ8 259 aa14.55□□□□□ -0.08
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Vopp1Q8R1C3 172 aa14.54□□□□□ -0.08
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Cela3bQ9CQ52 269 aa14.54□□□□□ -0.08
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Tcrg-V6A0A075B5Y8 134 aa14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 30.6 ms