RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568566.5

TSC2-223, Transcript of TSC complex subunit 2, human

TSL 3

Gene TSC2, Length 542 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TSC2-223	ENST00000568566	NTF3	P20783	257 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TSC2-223	ENST00000568566	CTRL	P40313	264 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TSC2-223	ENST00000568566	KRTAP10-2	P60368	255 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TSC2-223	ENST00000568566	GAGE1	Q13065	139 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TSC2-223	ENST00000568566	GAGE4	Q13068	117 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TSC2-223	ENST00000568566	GAGE5	Q13069	117 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TSC2-223	ENST00000568566	GAGE13	Q4V321	117 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TSC2-223	ENST00000568566	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TSC2-223	ENST00000568566	RASL11A	Q6T310	242 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TSC2-223	ENST00000568566	ZFP82	Q8N141	532 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TSC2-223	ENST00000568566	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TSC2-223	ENST00000568566	TSKU	Q8WUA8	353 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TSC2-223	ENST00000568566	PRO0255	Q9UI72	69 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TSC2-223	ENST00000568566		A0A1B0GW15	77 aa		5.72	□□□□□ -1.49
TSC2-223	ENST00000568566		A0A1W2PPQ1	181 aa		5.72	□□□□□ -1.49
TSC2-223	ENST00000568566	EPM2A	B3EWF7	344 aa		5.72	□□□□□ -1.49
TSC2-223	ENST00000568566	S100A8	P05109	93 aa		5.72	□□□□□ -1.49
TSC2-223	ENST00000568566	ELOB	Q15370	118 aa		5.72	□□□□□ -1.49
TSC2-223	ENST00000568566	ATP5L2	Q7Z4Y8	100 aa		5.72	□□□□□ -1.49
TSC2-223	ENST00000568566	CBLN2	Q8IUK8	224 aa		5.72	□□□□□ -1.49
TSC2-223	ENST00000568566		Q8N3U1	123 aa		5.72	□□□□□ -1.49
TSC2-223	ENST00000568566	NUP35	Q8NFH5	326 aa		5.72	□□□□□ -1.49
TSC2-223	ENST00000568566	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		5.72	□□□□□ -1.49
TSC2-223	ENST00000568566	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		5.71	□□□□□ -1.5
TSC2-223	ENST00000568566	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		5.71	□□□□□ -1.5
TSC2-223	ENST00000568566	COLCA2	A8K830	154 aa		5.71	□□□□□ -1.5
TSC2-223	ENST00000568566	HIGD1C	A8MV81	97 aa		5.71	□□□□□ -1.5
TSC2-223	ENST00000568566		A8MWV9	139 aa		5.71	□□□□□ -1.5
TSC2-223	ENST00000568566	SCO1	O75880	301 aa		5.71	□□□□□ -1.5
TSC2-223	ENST00000568566	MT-ND6	P03923	174 aa		5.71	□□□□□ -1.5
TSC2-223	ENST00000568566	MGP	P08493	103 aa		5.71	□□□□□ -1.5
TSC2-223	ENST00000568566	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		5.71	□□□□□ -1.5
TSC2-223	ENST00000568566	LINC00694	P0DN24	101 aa		5.71	□□□□□ -1.5
TSC2-223	ENST00000568566	WDR73	Q6P4I2	378 aa		5.71	□□□□□ -1.5
TSC2-223	ENST00000568566	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		5.71	□□□□□ -1.5
TSC2-223	ENST00000568566	SYT8	Q8NBV8	401 aa		5.71	□□□□□ -1.5
TSC2-223	ENST00000568566	BORCS7	Q96B45	105 aa		5.71	□□□□□ -1.5
TSC2-223	ENST00000568566	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		5.71	□□□□□ -1.5
TSC2-223	ENST00000568566	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		5.7	□□□□□ -1.5
TSC2-223	ENST00000568566	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		5.7	□□□□□ -1.5
TSC2-223	ENST00000568566	RAB5A	P20339	215 aa		5.7	□□□□□ -1.5
TSC2-223	ENST00000568566	CCL18	P55774	89 aa		5.7	□□□□□ -1.5
TSC2-223	ENST00000568566	TWIST1	Q15672	202 aa		5.7	□□□□□ -1.5
TSC2-223	ENST00000568566	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		5.7	□□□□□ -1.5
TSC2-223	ENST00000568566	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		5.7	□□□□□ -1.5
TSC2-223	ENST00000568566	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		5.7	□□□□□ -1.5
TSC2-223	ENST00000568566	YPEL4	Q96NS1	127 aa		5.7	□□□□□ -1.5
TSC2-223	ENST00000568566	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		5.7	□□□□□ -1.5
TSC2-223	ENST00000568566	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		5.7	□□□□□ -1.5
TSC2-223	ENST00000568566	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		5.69	□□□□□ -1.5
TSC2-223	ENST00000568566		F2Z2F3	143 aa		5.69	□□□□□ -1.5
TSC2-223	ENST00000568566		F5H697	171 aa		5.69	□□□□□ -1.5
TSC2-223	ENST00000568566	SMKR1	H3BMG3	65 aa		5.69	□□□□□ -1.5
TSC2-223	ENST00000568566		H3BNG1	76 aa		5.69	□□□□□ -1.5
TSC2-223	ENST00000568566		M0QY20	66 aa		5.69	□□□□□ -1.5
TSC2-223	ENST00000568566	CACNG7	P62955	275 aa		5.69	□□□□□ -1.5
TSC2-223	ENST00000568566	ZNF56	Q15929	161 aa		5.69	□□□□□ -1.5
TSC2-223	ENST00000568566	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		5.69	□□□□□ -1.5
TSC2-223	ENST00000568566	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		5.69	□□□□□ -1.5
TSC2-223	ENST00000568566	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
TSC2-223	ENST00000568566	RNF185	Q96GF1	192 aa		5.69	□□□□□ -1.5
TSC2-223	ENST00000568566	CNFN	Q9BYD5	112 aa		5.69	□□□□□ -1.5
TSC2-223	ENST00000568566	URGCP-MRPS24	S4R325	110 aa		5.69	□□□□□ -1.5
TSC2-223	ENST00000568566	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		5.68	□□□□□ -1.5
TSC2-223	ENST00000568566	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	5.68	□□□□□ -1.5
TSC2-223	ENST00000568566	RAB5B	P61020	215 aa		5.68	□□□□□ -1.5
TSC2-223	ENST00000568566	RIG	Q13278	110 aa		5.68	□□□□□ -1.5
TSC2-223	ENST00000568566	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
TSC2-223	ENST00000568566		Q5VSD8	79 aa		5.68	□□□□□ -1.5
TSC2-223	ENST00000568566	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
TSC2-223	ENST00000568566	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		5.68	□□□□□ -1.5
TSC2-223	ENST00000568566	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
TSC2-223	ENST00000568566	GATD1	Q8NB37	220 aa		5.68	□□□□□ -1.5
TSC2-223	ENST00000568566	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		5.68	□□□□□ -1.5
TSC2-223	ENST00000568566	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		5.67	□□□□□ -1.5
TSC2-223	ENST00000568566		A0A1B0GUT8	65 aa		5.67	□□□□□ -1.5
TSC2-223	ENST00000568566	HLA-DQA1	P01909	254 aa		5.67	□□□□□ -1.5
TSC2-223	ENST00000568566	SRI	P30626	198 aa		5.67	□□□□□ -1.5
TSC2-223	ENST00000568566	RPS10	P46783	165 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
TSC2-223	ENST00000568566	CAMP	P49913	170 aa		5.67	□□□□□ -1.5
TSC2-223	ENST00000568566	RAB4B	P61018	213 aa		5.67	□□□□□ -1.5
TSC2-223	ENST00000568566	SLA	Q13239	276 aa		5.67	□□□□□ -1.5
TSC2-223	ENST00000568566	RHOH	Q15669	191 aa		5.67	□□□□□ -1.5
TSC2-223	ENST00000568566	TTC32	Q5I0X7	151 aa		5.67	□□□□□ -1.5
TSC2-223	ENST00000568566	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		5.67	□□□□□ -1.5
TSC2-223	ENST00000568566	AMN1	Q8IY45	258 aa		5.67	□□□□□ -1.5
TSC2-223	ENST00000568566	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		5.67	□□□□□ -1.5
TSC2-223	ENST00000568566	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		5.67	□□□□□ -1.5
TSC2-223	ENST00000568566	AP1S3	Q96PC3	154 aa		5.67	□□□□□ -1.5
TSC2-223	ENST00000568566	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		5.67	□□□□□ -1.5
TSC2-223	ENST00000568566		Q9H8V8	135 aa		5.67	□□□□□ -1.5
TSC2-223	ENST00000568566	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
TSC2-223	ENST00000568566	TGIF2-C20orf24	A0A0A6YYL0	155 aa		5.66	□□□□□ -1.5
TSC2-223	ENST00000568566		A0A1B0GXF2	115 aa		5.66	□□□□□ -1.5
TSC2-223	ENST00000568566	RHOD	O00212	210 aa		5.66	□□□□□ -1.5
TSC2-223	ENST00000568566	NCR2	O95944	276 aa		5.66	□□□□□ -1.5
TSC2-223	ENST00000568566	RAB4A	P20338	218 aa		5.66	□□□□□ -1.5
TSC2-223	ENST00000568566	UBE2D3	P61077	147 aa		5.66	□□□□□ -1.5
TSC2-223	ENST00000568566	UBE2D2	P62837	147 aa		5.66	□□□□□ -1.5
TSC2-223	ENST00000568566	HBB	P68871	147 aa		5.66	□□□□□ -1.5

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