RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541990.5

THBS3-211, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS3, Length 2,928 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-211ENST00000541990 H7C2G1 150 aa6.86□□□□□ -1.31
THBS3-211ENST00000541990 IGHV3-11P01762 117 aa6.86□□□□□ -1.31
THBS3-211ENST00000541990 ORMDL2Q53FV1 153 aa6.86□□□□□ -1.31
THBS3-211ENST00000541990 SLC50A1Q9BRV3 221 aa6.86□□□□□ -1.31
THBS3-211ENST00000541990 ZNF688P0C7X2 276 aa6.85□□□□□ -1.31
THBS3-211ENST00000541990 Q8N6K4 173 aa6.85□□□□□ -1.31
THBS3-211ENST00000541990 A8MWV9 139 aa6.85□□□□□ -1.31
THBS3-211ENST00000541990 IGHV3-30P01768 117 aa6.85□□□□□ -1.31
THBS3-211ENST00000541990 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa6.85□□□□□ -1.31
THBS3-211ENST00000541990 ARL3P36405 182 aa6.85□□□□□ -1.31
THBS3-211ENST00000541990 MINOS1Q5TGZ0 78 aa6.85□□□□□ -1.31
THBS3-211ENST00000541990 JPT2Q9H910 190 aa6.85□□□□□ -1.31
THBS3-211ENST00000541990 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa6.85□□□□□ -1.31
THBS3-211ENST00000541990 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa6.84□□□□□ -1.31
THBS3-211ENST00000541990 GNRH2O43555 120 aa6.84□□□□□ -1.31
THBS3-211ENST00000541990 SBSPONQ8IVN8 264 aa6.84□□□□□ -1.31
THBS3-211ENST00000541990 C11orf44Q8N8P7 122 aa6.84□□□□□ -1.31
THBS3-211ENST00000541990 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa6.84□□□□□ -1.31
THBS3-211ENST00000541990 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
THBS3-211ENST00000541990 TRAV4A0A0B4J268 109 aa6.84□□□□□ -1.31
THBS3-211ENST00000541990 F6UB75 175 aa6.84□□□□□ -1.31
THBS3-211ENST00000541990 SCGB1C2P0DMR2 95 aa6.84□□□□□ -1.31
THBS3-211ENST00000541990 GPHB5Q86YW7 130 aa6.84□□□□□ -1.31
THBS3-211ENST00000541990 ZNRF2Q8NHG8 242 aa6.84□□□□□ -1.31
THBS3-211ENST00000541990 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa6.83□□□□□ -1.32
THBS3-211ENST00000541990 C9JAW5 83 aa6.83□□□□□ -1.32
THBS3-211ENST00000541990 C10orf126Q8N4M7 172 aa6.83□□□□□ -1.32
THBS3-211ENST00000541990 C5orf56Q8N8D9 126 aa6.83□□□□□ -1.32
THBS3-211ENST00000541990 AMELXQ99217 191 aa6.83□□□□□ -1.32
THBS3-211ENST00000541990 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
THBS3-211ENST00000541990 CITED1Q99966 193 aa6.83□□□□□ -1.32
THBS3-211ENST00000541990 ZNF580Q9UK33 172 aa6.83□□□□□ -1.32
THBS3-211ENST00000541990 TRBV12-3P01733 135 aa6.83□□□□□ -1.32
THBS3-211ENST00000541990 S100A4P26447 101 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
THBS3-211ENST00000541990 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa6.83□□□□□ -1.32
THBS3-211ENST00000541990 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa6.83□□□□□ -1.32
THBS3-211ENST00000541990 CCDC179H3BU77 68 aa6.83□□□□□ -1.32
THBS3-211ENST00000541990 GAGE5Q13069 117 aa6.83□□□□□ -1.32
THBS3-211ENST00000541990 GAGE6Q13070 117 aa6.83□□□□□ -1.32
THBS3-211ENST00000541990 TMEM170BQ5T4T1 132 aa6.83□□□□□ -1.32
THBS3-211ENST00000541990 ZFAND6Q6FIF0 208 aa6.83□□□□□ -1.32
THBS3-211ENST00000541990 C16orf92Q96LL3 132 aa6.83□□□□□ -1.32
THBS3-211ENST00000541990 C2CD3Q4AC94 2353 aa6.83□□□□□ -1.32
THBS3-211ENST00000541990 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa6.82□□□□□ -1.32
THBS3-211ENST00000541990 SLC25A20O43772 301 aa6.82□□□□□ -1.32
THBS3-211ENST00000541990 TEX29Q8N6K0 151 aa6.82□□□□□ -1.32
THBS3-211ENST00000541990 DPH3P1Q9H4G8 78 aa6.82□□□□□ -1.32
THBS3-211ENST00000541990 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa6.82□□□□□ -1.32
THBS3-211ENST00000541990 MUC4Q99102 2169 aa6.82□□□□□ -1.32
THBS3-211ENST00000541990 A4D1N5 150 aa6.82□□□□□ -1.32
THBS3-211ENST00000541990 VCX2Q9H322 139 aa6.82□□□□□ -1.32
THBS3-211ENST00000541990 YAE1D1Q9NRH1 226 aa6.82□□□□□ -1.32
THBS3-211ENST00000541990 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
THBS3-211ENST00000541990 DSCR9P59020 149 aa6.81□□□□□ -1.32
THBS3-211ENST00000541990 FAM110AQ9BQ89 295 aa6.81□□□□□ -1.32
THBS3-211ENST00000541990 ATRQ13535 2644 aa6.81□□□□□ -1.32
THBS3-211ENST00000541990 IGIPA6NJ69 53 aa6.81□□□□□ -1.32
THBS3-211ENST00000541990 EDN2P20800 178 aa6.81□□□□□ -1.32
THBS3-211ENST00000541990 EBI3Q14213 229 aa6.81□□□□□ -1.32
THBS3-211ENST00000541990 SLC25A29Q8N8R3 303 aa6.81□□□□□ -1.32
THBS3-211ENST00000541990 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
THBS3-211ENST00000541990 A0A087WWL8 130 aa6.8□□□□□ -1.32
THBS3-211ENST00000541990 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
THBS3-211ENST00000541990 PRO1854Q9UHT4 67 aa6.8□□□□□ -1.32
THBS3-211ENST00000541990 TRAV2A0A0B4J234 112 aa6.8□□□□□ -1.32
THBS3-211ENST00000541990 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa6.8□□□□□ -1.32
THBS3-211ENST00000541990 LINC00315P59091 139 aa6.8□□□□□ -1.32
THBS3-211ENST00000541990 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa6.8□□□□□ -1.32
THBS3-211ENST00000541990 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
THBS3-211ENST00000541990 METTL26Q96S19 204 aa6.8□□□□□ -1.32
THBS3-211ENST00000541990 PF4V1P10720 104 aa6.8□□□□□ -1.32
THBS3-211ENST00000541990 ASIPP42127 132 aa6.8□□□□□ -1.32
THBS3-211ENST00000541990 DUX3Q96PT4 197 aa6.8□□□□□ -1.32
THBS3-211ENST00000541990 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa6.79□□□□□ -1.32
THBS3-211ENST00000541990 SCGB2A1O75556 95 aa6.79□□□□□ -1.32
THBS3-211ENST00000541990 IGHV3-33P01772 117 aa6.79□□□□□ -1.32
THBS3-211ENST00000541990 SHISA2Q6UWI4 295 aa6.79□□□□□ -1.32
THBS3-211ENST00000541990 C18orf65Q6ZTR6 163 aa6.79□□□□□ -1.32
THBS3-211ENST00000541990 Q8N1Y9 231 aa6.79□□□□□ -1.32
THBS3-211ENST00000541990 MOB4Q9Y3A3 225 aa6.79□□□□□ -1.32
THBS3-211ENST00000541990 A6NDX4 124 aa6.79□□□□□ -1.32
THBS3-211ENST00000541990 J3QQQ9 107 aa6.79□□□□□ -1.32
THBS3-211ENST00000541990 RHODO00212 210 aa6.79□□□□□ -1.32
THBS3-211ENST00000541990 SRD5A1P18405 259 aa6.79□□□□□ -1.32
THBS3-211ENST00000541990 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
THBS3-211ENST00000541990 KRTAP1-1Q07627 177 aa6.79□□□□□ -1.32
THBS3-211ENST00000541990 PMVKQ15126 192 aa6.79□□□□□ -1.32
THBS3-211ENST00000541990 LYRM7Q5U5X0 104 aa6.79□□□□□ -1.32
THBS3-211ENST00000541990 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
THBS3-211ENST00000541990 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa6.78□□□□□ -1.32
THBS3-211ENST00000541990 HERVK_113P61574 105 aa6.78□□□□□ -1.32
THBS3-211ENST00000541990 SUMO4Q6EEV6 95 aa6.78□□□□□ -1.32
THBS3-211ENST00000541990 Q6ZSV7 163 aa6.78□□□□□ -1.32
THBS3-211ENST00000541990 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.78□□□□□ -1.32
THBS3-211ENST00000541990 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa6.78□□□□□ -1.32
THBS3-211ENST00000541990 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
THBS3-211ENST00000541990 TRAV41A0A0B4J266 112 aa6.78□□□□□ -1.32
THBS3-211ENST00000541990 TRAV21A0A0B4J279 112 aa6.78□□□□□ -1.32
THBS3-211ENST00000541990 OOSP1A8MZH6 123 aa6.78□□□□□ -1.32
THBS3-211ENST00000541990 ODF3Q96PU9 254 aa6.78□□□□□ -1.32
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