RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538064.1

LRRK1-211, Transcript of leucine rich repeat kinase 1, humanhuman

TSL 5

Gene LRRK1, Length 493 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRK1-211ENST00000538064 GAGE5Q13069 117 aa10□□□□□ -0.81
LRRK1-211ENST00000538064 LAGE3Q14657 143 aa10□□□□□ -0.81
LRRK1-211ENST00000538064 GAGE13Q4V321 117 aa10□□□□□ -0.81
LRRK1-211ENST00000538064 CT83Q5H943 113 aa10□□□□□ -0.81
LRRK1-211ENST00000538064 WDR73Q6P4I2 378 aa10□□□□□ -0.81
LRRK1-211ENST00000538064 LYZL1Q6UWQ5 148 aa10□□□□□ -0.81
LRRK1-211ENST00000538064 OSTCQ9NRP0 149 aa10□□□□□ -0.81
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LRRK1-211ENST00000538064 PSCAO43653 123 aa9.99□□□□□ -0.81
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LRRK1-211ENST00000538064 IGHV3-33P01772 117 aa9.99□□□□□ -0.81
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LRRK1-211ENST00000538064 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa9.99□□□□□ -0.81
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LRRK1-211ENST00000538064 A0A087WX48 190 aa9.86□□□□□ -0.83
LRRK1-211ENST00000538064 LINC00862A6NCI5 91 aa9.86□□□□□ -0.83
LRRK1-211ENST00000538064 TMEM191AQ9H0A3 160 aa9.86□□□□□ -0.83
LRRK1-211ENST00000538064 NIT2Q9NQR4 276 aa9.86□□□□□ -0.83
LRRK1-211ENST00000538064 A0A1B0GW15 77 aa9.85□□□□□ -0.83
LRRK1-211ENST00000538064 HAMPP81172 84 aa9.85□□□□□ -0.83
LRRK1-211ENST00000538064 ELOBQ15370 118 aa9.85□□□□□ -0.83
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