RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528920.5

TSTA3-208, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 5

Gene TSTA3, Length 964 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-208ENST00000528920 IMMP2LQ96T52 175 aa10□□□□□ -0.81
TSTA3-208ENST00000528920 PCLOQ9Y6V0 5065 aa9.99□□□□□ -0.81
TSTA3-208ENST00000528920 F5H697 171 aa9.99□□□□□ -0.81
TSTA3-208ENST00000528920 EVI2AP22794 236 aa9.99□□□□□ -0.81
TSTA3-208ENST00000528920 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
TSTA3-208ENST00000528920 WFDC10BQ8IUB3 73 aa9.99□□□□□ -0.81
TSTA3-208ENST00000528920 TSKUQ8WUA8 353 aa9.99□□□□□ -0.81
TSTA3-208ENST00000528920 YPEL4Q96NS1 127 aa9.99□□□□□ -0.81
TSTA3-208ENST00000528920 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa9.99□□□□□ -0.81
TSTA3-208ENST00000528920 GTSF1LQ9H1H1 148 aa9.99□□□□□ -0.81
TSTA3-208ENST00000528920 RTL8CO15255 209 aa9.98□□□□□ -0.81
TSTA3-208ENST00000528920 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
TSTA3-208ENST00000528920 TWIST1Q15672 202 aa9.98□□□□□ -0.81
TSTA3-208ENST00000528920 C1orf134Q5TEV5 83 aa9.98□□□□□ -0.81
TSTA3-208ENST00000528920 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
TSTA3-208ENST00000528920 PGLYRP4Q96LB8 373 aa9.98□□□□□ -0.81
TSTA3-208ENST00000528920 GFRA4Q9GZZ7 299 aa9.98□□□□□ -0.81
TSTA3-208ENST00000528920 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa9.98□□□□□ -0.81
TSTA3-208ENST00000528920 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa9.97□□□□□ -0.81
TSTA3-208ENST00000528920 FAM231BA6NCW3 169 aa9.97□□□□□ -0.81
TSTA3-208ENST00000528920 MGPP08493 103 aa9.97□□□□□ -0.81
TSTA3-208ENST00000528920 LELP1Q5T871 98 aa9.97□□□□□ -0.81
TSTA3-208ENST00000528920 DPH3P1Q9H4G8 78 aa9.97□□□□□ -0.81
TSTA3-208ENST00000528920 KIAA1109Q2LD37 5005 aa9.97□□□□□ -0.81
TSTA3-208ENST00000528920 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa9.96□□□□□ -0.82
TSTA3-208ENST00000528920 COLCA2A8K830 154 aa9.96□□□□□ -0.82
TSTA3-208ENST00000528920 HIGD1CA8MV81 97 aa9.96□□□□□ -0.82
TSTA3-208ENST00000528920 DNAH10OSP0CZ25 163 aa9.96□□□□□ -0.82
TSTA3-208ENST00000528920 UBE2D3P61077 147 aa9.96□□□□□ -0.82
TSTA3-208ENST00000528920 UBE2D2P62837 147 aa9.96□□□□□ -0.82
TSTA3-208ENST00000528920 ELOBQ15370 118 aa9.96□□□□□ -0.82
TSTA3-208ENST00000528920 OR10J3Q5JRS4 329 aa9.96□□□□□ -0.82
TSTA3-208ENST00000528920 LINC00336Q6ZUF6 198 aa9.96□□□□□ -0.82
TSTA3-208ENST00000528920 C6orf223Q8N319 242 aa9.96□□□□□ -0.82
TSTA3-208ENST00000528920 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa9.96□□□□□ -0.82
TSTA3-208ENST00000528920 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa9.95□□□□□ -0.82
TSTA3-208ENST00000528920 S100PP25815 95 aa9.95□□□□□ -0.82
TSTA3-208ENST00000528920 SUMO4Q6EEV6 95 aa9.95□□□□□ -0.82
TSTA3-208ENST00000528920 KCNIP4Q6PIL6 250 aa9.95□□□□□ -0.82
TSTA3-208ENST00000528920 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa9.95□□□□□ -0.82
TSTA3-208ENST00000528920 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa9.94□□□□□ -0.82
TSTA3-208ENST00000528920 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa9.94□□□□□ -0.82
TSTA3-208ENST00000528920 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa9.94□□□□□ -0.82
TSTA3-208ENST00000528920 H7C1H1 209 aa9.94□□□□□ -0.82
TSTA3-208ENST00000528920 M0QY20 66 aa9.94□□□□□ -0.82
TSTA3-208ENST00000528920 BTF3P20290 206 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
TSTA3-208ENST00000528920 BORCS7Q96B45 105 aa9.94□□□□□ -0.82
TSTA3-208ENST00000528920 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa9.93□□□□□ -0.82
TSTA3-208ENST00000528920 A0A1B0GUT8 65 aa9.93□□□□□ -0.82
TSTA3-208ENST00000528920 K7EP13 123 aa9.93□□□□□ -0.82
TSTA3-208ENST00000528920 LINC01556Q5JQF7 62 aa9.93□□□□□ -0.82
TSTA3-208ENST00000528920 SMIM15Q7Z3B0 74 aa9.93□□□□□ -0.82
TSTA3-208ENST00000528920 DNAJC30Q96LL9 226 aa9.93□□□□□ -0.82
TSTA3-208ENST00000528920 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa9.92□□□□□ -0.82
TSTA3-208ENST00000528920 PRSS29PA6NIE9 313 aa9.92□□□□□ -0.82
TSTA3-208ENST00000528920 RASL11AQ6T310 242 aa9.92□□□□□ -0.82
TSTA3-208ENST00000528920 NUP35Q8NFH5 326 aa9.92□□□□□ -0.82
TSTA3-208ENST00000528920 BTF3L4Q96K17 158 aa9.92□□□□□ -0.82
TSTA3-208ENST00000528920 NAT8BQ9UHF3 227 aa9.92□□□□□ -0.82
TSTA3-208ENST00000528920 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
TSTA3-208ENST00000528920 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa9.91□□□□□ -0.82
TSTA3-208ENST00000528920 DNAH2Q9P225 4427 aa9.9□□□□□ -0.82
TSTA3-208ENST00000528920 RAB5AP20339 215 aa9.9□□□□□ -0.82
TSTA3-208ENST00000528920 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
TSTA3-208ENST00000528920 C10orf126Q8N4M7 172 aa9.9□□□□□ -0.82
TSTA3-208ENST00000528920 NIT2Q9NQR4 276 aa9.9□□□□□ -0.82
TSTA3-208ENST00000528920 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
TSTA3-208ENST00000528920 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa9.89□□□□□ -0.83
TSTA3-208ENST00000528920 RIGQ13278 110 aa9.89□□□□□ -0.83
TSTA3-208ENST00000528920 GATD1Q8NB37 220 aa9.89□□□□□ -0.83
TSTA3-208ENST00000528920 TMEM191AQ9H0A3 160 aa9.89□□□□□ -0.83
TSTA3-208ENST00000528920 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa9.88□□□□□ -0.83
TSTA3-208ENST00000528920 IGHV3-30P01768 117 aa9.88□□□□□ -0.83
TSTA3-208ENST00000528920 IGHV3-33P01772 117 aa9.88□□□□□ -0.83
TSTA3-208ENST00000528920 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa9.88□□□□□ -0.83
TSTA3-208ENST00000528920 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa9.88□□□□□ -0.83
TSTA3-208ENST00000528920 TMEM97Q5BJF2 176 aa9.88□□□□□ -0.83
TSTA3-208ENST00000528920 NIT1Q86X76 327 aa9.88□□□□□ -0.83
TSTA3-208ENST00000528920 FRZBQ92765 325 aa9.88□□□□□ -0.83
TSTA3-208ENST00000528920 RYR1P21817 5038 aa9.88□□□□□ -0.83
TSTA3-208ENST00000528920 DNAH17Q9UFH2 4485 aa9.88□□□□□ -0.83
TSTA3-208ENST00000528920 A0A1B0GVY2 172 aa9.87□□□□□ -0.83
TSTA3-208ENST00000528920 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa9.87□□□□□ -0.83
TSTA3-208ENST00000528920 TNP2Q05952 138 aa9.87□□□□□ -0.83
TSTA3-208ENST00000528920 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
TSTA3-208ENST00000528920 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa9.87□□□□□ -0.83
TSTA3-208ENST00000528920 NFE4Q86UQ8 179 aa9.87□□□□□ -0.83
TSTA3-208ENST00000528920 Q8N3U1 123 aa9.87□□□□□ -0.83
TSTA3-208ENST00000528920 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa9.86□□□□□ -0.83
TSTA3-208ENST00000528920 FAT2Q9NYQ8 4349 aa9.86□□□□□ -0.83
TSTA3-208ENST00000528920 A0A1B0GW15 77 aa9.85□□□□□ -0.83
TSTA3-208ENST00000528920 A0A1B0GXF2 115 aa9.85□□□□□ -0.83
TSTA3-208ENST00000528920 RAB4AP20338 218 aa9.85□□□□□ -0.83
TSTA3-208ENST00000528920 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
TSTA3-208ENST00000528920 RNF185Q96GF1 192 aa9.85□□□□□ -0.83
TSTA3-208ENST00000528920 RPS10P46783 165 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
TSTA3-208ENST00000528920 LAGE3Q14657 143 aa9.84□□□□□ -0.83
TSTA3-208ENST00000528920 COX19Q49B96 90 aa9.84□□□□□ -0.83
TSTA3-208ENST00000528920 AMN1Q8IY45 258 aa9.84□□□□□ -0.83
TSTA3-208ENST00000528920 CHCHD7Q9BUK0 85 aa9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 112.5 ms