RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496447.5

PTPRF-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRF, Length 5,887 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-215ENST00000496447 MT-ATP8P03928 68 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRF-215ENST00000496447 DEFB1P60022 68 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRF-215ENST00000496447 NDUFA1O15239 70 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRF-215ENST00000496447 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa10.06□□□□□ -0.8
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PTPRF-215ENST00000496447 H3BT86 120 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRF-215ENST00000496447 COX7B2Q8TF08 81 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRF-215ENST00000496447 KMT2EQ8IZD2 1858 aa10.06□□□□□ -0.8
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PTPRF-215ENST00000496447 C11orf71Q6IPW1 123 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRF-215ENST00000496447 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
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