RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495571.5

VWA3B-220, Transcript of von Willebrand factor A domain containing 3B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene VWA3B, Length 2,711 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3B-220ENST00000495571 IGF2RP11717 2491 aa6.4□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 COL6A6A6NMZ7 2263 aa6.4□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 CHD6Q8TD26 2715 aa6.4□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 A0A0J9YXY3 114 aa6.4□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa6.4□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 CRYGAP11844 174 aa6.4□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 C22orf24Q9Y442 160 aa6.4□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 LST1O00453 97 aa6.4□□□□□ -1.39
VWA3B-220ENST00000495571 LINC00336Q6ZUF6 198 aa6.4□□□□□ -1.39
VWA3B-220ENST00000495571 FANCD2OSQ96PS1 177 aa6.4□□□□□ -1.39
VWA3B-220ENST00000495571 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa6.4□□□□□ -1.39
VWA3B-220ENST00000495571 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
VWA3B-220ENST00000495571 GNRH2O43555 120 aa6.39□□□□□ -1.39
VWA3B-220ENST00000495571 LOXP28300 417 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
VWA3B-220ENST00000495571 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
VWA3B-220ENST00000495571 DCANP1Q8TF63 244 aa6.39□□□□□ -1.39
VWA3B-220ENST00000495571 PKIGQ9Y2B9 76 aa6.39□□□□□ -1.39
VWA3B-220ENST00000495571 BSNQ9UPA5 3926 aa6.39□□□□□ -1.39
VWA3B-220ENST00000495571 USP24Q9UPU5 2620 aa6.39□□□□□ -1.39
VWA3B-220ENST00000495571 A0A0J9YXV3 536 aa6.39□□□□□ -1.39
VWA3B-220ENST00000495571 J3QLI3 93 aa6.39□□□□□ -1.39
VWA3B-220ENST00000495571 NXPH4O95158 308 aa6.39□□□□□ -1.39
VWA3B-220ENST00000495571 NDPQ00604 133 aa6.39□□□□□ -1.39
VWA3B-220ENST00000495571 DEFB109BQ30KR1 87 aa6.39□□□□□ -1.39
VWA3B-220ENST00000495571 ZNF876PQ49A33 203 aa6.39□□□□□ -1.39
VWA3B-220ENST00000495571 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
VWA3B-220ENST00000495571 C5orf38Q86SI9 138 aa6.39□□□□□ -1.39
VWA3B-220ENST00000495571 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa6.38□□□□□ -1.39
VWA3B-220ENST00000495571 H3BT86 120 aa6.38□□□□□ -1.39
VWA3B-220ENST00000495571 TRACP01848 142 aa6.38□□□□□ -1.39
VWA3B-220ENST00000495571 COX7A1P24310 79 aa6.38□□□□□ -1.39
VWA3B-220ENST00000495571 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
VWA3B-220ENST00000495571 SLC50A1Q9BRV3 221 aa6.38□□□□□ -1.39
VWA3B-220ENST00000495571 UPK3BQ9BT76 320 aa6.38□□□□□ -1.39
VWA3B-220ENST00000495571 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa6.38□□□□□ -1.39
VWA3B-220ENST00000495571 A0A087WWL8 130 aa6.37□□□□□ -1.39
VWA3B-220ENST00000495571 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
VWA3B-220ENST00000495571 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
VWA3B-220ENST00000495571 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa6.37□□□□□ -1.39
VWA3B-220ENST00000495571 SLC25A15Q9Y619 301 aa6.37□□□□□ -1.39
VWA3B-220ENST00000495571 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa6.37□□□□□ -1.39
VWA3B-220ENST00000495571 CTSGP08311 255 aa6.37□□□□□ -1.39
VWA3B-220ENST00000495571 IGHV1-8P0DP01 117 aa6.37□□□□□ -1.39
VWA3B-220ENST00000495571 KLRB1Q12918 225 aa6.37□□□□□ -1.39
VWA3B-220ENST00000495571 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
VWA3B-220ENST00000495571 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
VWA3B-220ENST00000495571 CCL17Q92583 94 aa6.37□□□□□ -1.39
VWA3B-220ENST00000495571 DPH3P1Q9H4G8 78 aa6.37□□□□□ -1.39
VWA3B-220ENST00000495571 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
VWA3B-220ENST00000495571 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
VWA3B-220ENST00000495571 M0R1W7 72 aa6.36□□□□□ -1.39
VWA3B-220ENST00000495571 LINC00643Q86TS7 51 aa6.36□□□□□ -1.39
VWA3B-220ENST00000495571 Q8N2B8 174 aa6.36□□□□□ -1.39
VWA3B-220ENST00000495571 TIMM21Q9BVV7 248 aa6.36□□□□□ -1.39
VWA3B-220ENST00000495571 IMUPQ9GZP8 106 aa6.36□□□□□ -1.39
VWA3B-220ENST00000495571 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa6.36□□□□□ -1.39
VWA3B-220ENST00000495571 LEPROTO15243 131 aa6.36□□□□□ -1.39
VWA3B-220ENST00000495571 IGHG3P01860 377 aa6.36□□□□□ -1.39
VWA3B-220ENST00000495571 TIRAPP58753 221 aa6.36□□□□□ -1.39
VWA3B-220ENST00000495571 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
VWA3B-220ENST00000495571 FAM27E3Q08E93 113 aa6.36□□□□□ -1.39
VWA3B-220ENST00000495571 FHL2Q14192 279 aa6.36□□□□□ -1.39
VWA3B-220ENST00000495571 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
VWA3B-220ENST00000495571 A0A0U1RRA0 63 aa6.35□□□□□ -1.39
VWA3B-220ENST00000495571 AVPP01185 164 aa6.35□□□□□ -1.39
VWA3B-220ENST00000495571 LINC00315P59091 139 aa6.35□□□□□ -1.39
VWA3B-220ENST00000495571 FAM223AQ8IWN6 122 aa6.35□□□□□ -1.39
VWA3B-220ENST00000495571 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
VWA3B-220ENST00000495571 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa6.35□□□□□ -1.39
VWA3B-220ENST00000495571 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa6.35□□□□□ -1.39
VWA3B-220ENST00000495571 C20orf173Q96LM9 149 aa6.35□□□□□ -1.39
VWA3B-220ENST00000495571 C1orf43Q9BWL3 253 aa6.35□□□□□ -1.39
VWA3B-220ENST00000495571 VPS13CQ709C8 3753 aa6.35□□□□□ -1.39
VWA3B-220ENST00000495571 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa6.34□□□□□ -1.39
VWA3B-220ENST00000495571 SEM1Q6ZVN7 128 aa6.34□□□□□ -1.39
VWA3B-220ENST00000495571 LINC00311Q8N616 119 aa6.34□□□□□ -1.39
VWA3B-220ENST00000495571 FAM218AQ96MZ4 157 aa6.34□□□□□ -1.39
VWA3B-220ENST00000495571 F6UB75 175 aa6.34□□□□□ -1.39
VWA3B-220ENST00000495571 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa6.34□□□□□ -1.39
VWA3B-220ENST00000495571 VMO1Q7Z5L0 202 aa6.34□□□□□ -1.39
VWA3B-220ENST00000495571 Q9HAA7 133 aa6.34□□□□□ -1.39
VWA3B-220ENST00000495571 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa6.34□□□□□ -1.4
VWA3B-220ENST00000495571 S100A4P26447 101 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.4
VWA3B-220ENST00000495571 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa6.34□□□□□ -1.4
VWA3B-220ENST00000495571 IGLV1-47P01700 117 aa6.33□□□□□ -1.4
VWA3B-220ENST00000495571 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
VWA3B-220ENST00000495571 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
VWA3B-220ENST00000495571 HILS1P60008 231 aa6.33□□□□□ -1.4
VWA3B-220ENST00000495571 SUMO4Q6EEV6 95 aa6.33□□□□□ -1.4
VWA3B-220ENST00000495571 TMEM61Q8N0U2 210 aa6.33□□□□□ -1.4
VWA3B-220ENST00000495571 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.33□□□□□ -1.4
VWA3B-220ENST00000495571 WFDC9Q8NEX5 89 aa6.33□□□□□ -1.4
VWA3B-220ENST00000495571 ZFAND3Q9H8U3 227 aa6.33□□□□□ -1.4
VWA3B-220ENST00000495571 PEMTQ9UBM1 199 aa6.33□□□□□ -1.4
VWA3B-220ENST00000495571 LYNX1G3V0Z9 82 aa6.33□□□□□ -1.4
VWA3B-220ENST00000495571 BUB3O43684 328 aa6.33□□□□□ -1.4
VWA3B-220ENST00000495571 LYNX1P0DP58 116 aa6.33□□□□□ -1.4
VWA3B-220ENST00000495571 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
VWA3B-220ENST00000495571 FAM104AQ969W3 186 aa6.33□□□□□ -1.4
VWA3B-220ENST00000495571 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa6.33□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.6 ms