RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	TWIST1	Q15672	202 aa		9.95	□□□□□ -0.82
SSR4-208	ENST00000471880	SMIM7	Q9BQ49	75 aa		9.95	□□□□□ -0.82
SSR4-208	ENST00000471880	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		9.94	□□□□□ -0.82
SSR4-208	ENST00000471880		H7C1H1	209 aa		9.94	□□□□□ -0.82
SSR4-208	ENST00000471880	NTF3	P20783	257 aa		9.94	□□□□□ -0.82
SSR4-208	ENST00000471880	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		9.94	□□□□□ -0.82
SSR4-208	ENST00000471880	TM2D2	Q9BX73	214 aa		9.94	□□□□□ -0.82
SSR4-208	ENST00000471880	KLK12	Q9UKR0	248 aa		9.94	□□□□□ -0.82
SSR4-208	ENST00000471880	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		9.93	□□□□□ -0.82
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF727	A8MUV8	499 aa		9.93	□□□□□ -0.82
SSR4-208	ENST00000471880	LAGE3	Q14657	143 aa		9.93	□□□□□ -0.82
SSR4-208	ENST00000471880	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		9.93	□□□□□ -0.82
SSR4-208	ENST00000471880	NIT1	Q86X76	327 aa		9.93	□□□□□ -0.82
SSR4-208	ENST00000471880	OR10G8	Q8NGN5	311 aa		9.93	□□□□□ -0.82
SSR4-208	ENST00000471880	LYPD6B	Q8NI32	183 aa		9.93	□□□□□ -0.82
SSR4-208	ENST00000471880	FAM210A	Q96ND0	272 aa		9.93	□□□□□ -0.82
SSR4-208	ENST00000471880	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		9.93	□□□□□ -0.82
SSR4-208	ENST00000471880	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		9.93	□□□□□ -0.82
SSR4-208	ENST00000471880	HSPG2	P98160	4391 aa		9.92	□□□□□ -0.82
SSR4-208	ENST00000471880	TRBV6-8	A0A0A6YYG3	113 aa		9.92	□□□□□ -0.82
SSR4-208	ENST00000471880	SMIM15	Q7Z3B0	74 aa		9.92	□□□□□ -0.82
SSR4-208	ENST00000471880	UBE2W	Q96B02	151 aa		9.92	□□□□□ -0.82
SSR4-208	ENST00000471880	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		9.92	□□□□□ -0.82
SSR4-208	ENST00000471880	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	9.91	□□□□□ -0.82
SSR4-208	ENST00000471880	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		9.91	□□□□□ -0.82
SSR4-208	ENST00000471880	LECT2	O14960	151 aa		9.91	□□□□□ -0.82
SSR4-208	ENST00000471880	CTRL	P40313	264 aa		9.91	□□□□□ -0.82
SSR4-208	ENST00000471880	ELOB	Q15370	118 aa		9.91	□□□□□ -0.82
SSR4-208	ENST00000471880	BORCS7	Q96B45	105 aa		9.91	□□□□□ -0.82
SSR4-208	ENST00000471880	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		9.91	□□□□□ -0.82
SSR4-208	ENST00000471880	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		9.91	□□□□□ -0.82
SSR4-208	ENST00000471880	CRP	P02741	224 aa		9.9	□□□□□ -0.82
SSR4-208	ENST00000471880	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	9.9	□□□□□ -0.82
SSR4-208	ENST00000471880	C15orf54	Q8N8G6	183 aa		9.9	□□□□□ -0.82
SSR4-208	ENST00000471880	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		9.9	□□□□□ -0.82
SSR4-208	ENST00000471880	RMI2	Q96E14	147 aa		9.9	□□□□□ -0.82
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP4-5	Q9BYR2	181 aa		9.9	□□□□□ -0.82
SSR4-208	ENST00000471880	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		9.89	□□□□□ -0.83
SSR4-208	ENST00000471880		A8MWL6	223 aa		9.89	□□□□□ -0.83
SSR4-208	ENST00000471880		M0QY20	66 aa		9.89	□□□□□ -0.83
SSR4-208	ENST00000471880	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	9.89	□□□□□ -0.83
SSR4-208	ENST00000471880	GAGE6	Q13070	117 aa		9.89	□□□□□ -0.83
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		9.89	□□□□□ -0.83
SSR4-208	ENST00000471880	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		9.89	□□□□□ -0.83
SSR4-208	ENST00000471880	RASL11A	Q6T310	242 aa		9.89	□□□□□ -0.83
SSR4-208	ENST00000471880	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		9.89	□□□□□ -0.83
SSR4-208	ENST00000471880	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		9.89	□□□□□ -0.83
SSR4-208	ENST00000471880	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		9.88	□□□□□ -0.83
SSR4-208	ENST00000471880	CDK2AP2	O75956	126 aa		9.88	□□□□□ -0.83
SSR4-208	ENST00000471880	TEX261	Q6UWH6	196 aa		9.88	□□□□□ -0.83
SSR4-208	ENST00000471880	GTSF1	Q8WW33	167 aa		9.88	□□□□□ -0.83
SSR4-208	ENST00000471880	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		9.87	□□□□□ -0.83
SSR4-208	ENST00000471880	PKIA	P61925	76 aa		9.87	□□□□□ -0.83
SSR4-208	ENST00000471880	MPV17L2	Q567V2	206 aa		9.87	□□□□□ -0.83
SSR4-208	ENST00000471880	WDR73	Q6P4I2	378 aa		9.87	□□□□□ -0.83
SSR4-208	ENST00000471880	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		9.87	□□□□□ -0.83
SSR4-208	ENST00000471880	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		9.87	□□□□□ -0.83
SSR4-208	ENST00000471880	LINC01551	Q86U37	167 aa		9.87	□□□□□ -0.83
SSR4-208	ENST00000471880		Q8N814	137 aa		9.87	□□□□□ -0.83
SSR4-208	ENST00000471880	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		9.87	□□□□□ -0.83
SSR4-208	ENST00000471880	ABCA13	Q86UQ4	5058 aa		9.87	□□□□□ -0.83
SSR4-208	ENST00000471880	IGLV2-33	A0A075B6J2	118 aa	Predicted RBP	9.86	□□□□□ -0.83
SSR4-208	ENST00000471880	IGHV1-24	A0A0C4DH33	117 aa		9.86	□□□□□ -0.83
SSR4-208	ENST00000471880	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		9.86	□□□□□ -0.83
SSR4-208	ENST00000471880	GCSH	P23434	173 aa		9.86	□□□□□ -0.83
SSR4-208	ENST00000471880	PEA15	Q15121	130 aa		9.86	□□□□□ -0.83
SSR4-208	ENST00000471880	ADIRF	Q15847	76 aa		9.86	□□□□□ -0.83
SSR4-208	ENST00000471880	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		9.86	□□□□□ -0.83
SSR4-208	ENST00000471880		Q8N976	141 aa		9.86	□□□□□ -0.83
SSR4-208	ENST00000471880	BAALC	Q8WXS3	180 aa		9.86	□□□□□ -0.83
SSR4-208	ENST00000471880	NIT2	Q9NQR4	276 aa		9.86	□□□□□ -0.83
SSR4-208	ENST00000471880	COX11	Q9Y6N1	276 aa		9.86	□□□□□ -0.83
SSR4-208	ENST00000471880	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	9.85	□□□□□ -0.83
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM241	Q24JQ0	296 aa		9.85	□□□□□ -0.83
SSR4-208	ENST00000471880	ATRAID	Q6UW56	229 aa		9.85	□□□□□ -0.83
SSR4-208	ENST00000471880	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		9.85	□□□□□ -0.83
SSR4-208	ENST00000471880	HIGD1C	A8MV81	97 aa		9.84	□□□□□ -0.83
SSR4-208	ENST00000471880	UBE2L6	O14933	153 aa		9.84	□□□□□ -0.83
SSR4-208	ENST00000471880		Q0VG73	95 aa		9.84	□□□□□ -0.83
SSR4-208	ENST00000471880	WFDC2	Q14508	124 aa		9.84	□□□□□ -0.83
SSR4-208	ENST00000471880	CT83	Q5H943	113 aa		9.84	□□□□□ -0.83
SSR4-208	ENST00000471880	CNFN	Q9BYD5	112 aa		9.84	□□□□□ -0.83
SSR4-208	ENST00000471880	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	9.83	□□□□□ -0.84
SSR4-208	ENST00000471880	AMT	P48728	403 aa		9.83	□□□□□ -0.84
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP10-1	P60331	282 aa		9.83	□□□□□ -0.84
SSR4-208	ENST00000471880	SRSF3	P84103	164 aa	Known RBP	9.83	□□□□□ -0.84
SSR4-208	ENST00000471880	COTL1	Q14019	142 aa		9.83	□□□□□ -0.84
SSR4-208	ENST00000471880	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		9.83	□□□□□ -0.84
SSR4-208	ENST00000471880	GATD1	Q8NB37	220 aa		9.83	□□□□□ -0.84
SSR4-208	ENST00000471880	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	9.83	□□□□□ -0.84
SSR4-208	ENST00000471880	TSKU	Q8WUA8	353 aa		9.83	□□□□□ -0.84
SSR4-208	ENST00000471880	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	9.83	□□□□□ -0.84
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM243	Q9BU79	118 aa		9.83	□□□□□ -0.84
SSR4-208	ENST00000471880	OSTC	Q9NRP0	149 aa		9.83	□□□□□ -0.84
SSR4-208	ENST00000471880	HLA-DQA1	P01909	254 aa		9.82	□□□□□ -0.84
SSR4-208	ENST00000471880	RBX1	P62877	108 aa		9.82	□□□□□ -0.84
SSR4-208	ENST00000471880	NAT8	Q9UHE5	227 aa		9.82	□□□□□ -0.84
SSR4-208	ENST00000471880		A0A1B0GUT8	65 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SSR4-208	ENST00000471880		C9JQL5	133 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SSR4-208	ENST00000471880	RPL23	P62829	140 aa	Known RBP	9.81	□□□□□ -0.84

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