RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453410.1

C9orf135-AS1-202, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C9orf135-AS1, Length 975 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GAGE1Q13065 139 aa7.6□□□□□ -1.19
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GAGE4Q13068 117 aa7.6□□□□□ -1.19
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GAGE5Q13069 117 aa7.6□□□□□ -1.19
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TMEM241Q24JQ0 296 aa7.6□□□□□ -1.19
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GAGE13Q4V321 117 aa7.6□□□□□ -1.19
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 AP1S3Q96PC3 154 aa7.6□□□□□ -1.19
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C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TSKUQ8WUA8 353 aa7.58□□□□□ -1.2
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C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa7.58□□□□□ -1.2
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SMIM17P0DL12 118 aa7.57□□□□□ -1.2
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CLLU1Q5K131 121 aa7.57□□□□□ -1.2
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C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CEBPGP53567 150 aa7.56□□□□□ -1.2
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LAGE3Q14657 143 aa7.56□□□□□ -1.2
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OR10J3Q5JRS4 329 aa7.56□□□□□ -1.2
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C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NFE4Q86UQ8 179 aa7.56□□□□□ -1.2
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CHCHD7Q9BUK0 85 aa7.56□□□□□ -1.2
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C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DPH3P1Q9H4G8 78 aa7.56□□□□□ -1.2
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C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TWIST1Q15672 202 aa7.55□□□□□ -1.2
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF56Q15929 161 aa7.55□□□□□ -1.2
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TMEM97Q5BJF2 176 aa7.55□□□□□ -1.2
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SUMO4Q6EEV6 95 aa7.55□□□□□ -1.2
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NIT1Q86X76 327 aa7.55□□□□□ -1.2
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa7.54□□□□□ -1.2
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa7.54□□□□□ -1.2
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C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SSTP61278 116 aa7.54□□□□□ -1.2
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LCE3BQ5TA77 95 aa7.54□□□□□ -1.2
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RASL11AQ6T310 242 aa7.54□□□□□ -1.2
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa7.54□□□□□ -1.2
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C15orf54Q8N8G6 183 aa7.54□□□□□ -1.2
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NIT2Q9NQR4 276 aa7.54□□□□□ -1.2
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa7.54□□□□□ -1.2
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C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NUP35Q8NFH5 326 aa7.53□□□□□ -1.2
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C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PGLYRP4Q96LB8 373 aa7.52□□□□□ -1.21
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FAM229AH3BQW9 127 aa7.51□□□□□ -1.21
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C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ATRAIDQ6UW56 229 aa7.51□□□□□ -1.21
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NAT8BQ9UHF3 227 aa7.51□□□□□ -1.21
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DNAH8Q96JB1 4490 aa7.5□□□□□ -1.21
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C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 UQCC3Q6UW78 93 aa7.5□□□□□ -1.21
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SMIM15Q7Z3B0 74 aa7.5□□□□□ -1.21
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HSPG2P98160 4391 aa7.5□□□□□ -1.21
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 A0A087WTM6 91 aa7.49□□□□□ -1.21
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa7.49□□□□□ -1.21
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LRCOL1A6NCL2 159 aa7.49□□□□□ -1.21
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IGHV3-30P01768 117 aa7.49□□□□□ -1.21
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IGHV3-33P01772 117 aa7.49□□□□□ -1.21
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MGPP08493 103 aa7.49□□□□□ -1.21
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa7.49□□□□□ -1.21
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa7.49□□□□□ -1.21
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RAB4AP20338 218 aa7.49□□□□□ -1.21
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RIGQ13278 110 aa7.49□□□□□ -1.21
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ELOBQ15370 118 aa7.49□□□□□ -1.21
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RNF185Q96GF1 192 aa7.49□□□□□ -1.21
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 A0A1B0GUV1 79 aa7.48□□□□□ -1.21
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 A0A1B0GW15 77 aa7.48□□□□□ -1.21
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KRTAP10-2P60368 255 aa7.48□□□□□ -1.21
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 BORCS7Q96B45 105 aa7.48□□□□□ -1.21
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PRR34Q9NV39 138 aa7.48□□□□□ -1.21
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 COX11Q9Y6N1 276 aa7.48□□□□□ -1.21
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa7.47□□□□□ -1.21
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 A0A087WX48 190 aa7.47□□□□□ -1.21
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 A0A1B0GXF2 115 aa7.47□□□□□ -1.21
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PPP1R2P9O14990 202 aa7.47□□□□□ -1.21
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NCR2O95944 276 aa7.47□□□□□ -1.21
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