RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390606.3

IGHV3-20-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable 3-20, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene IGHV3-20, Length 415 nt, Biotype IG V gene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-20-201ENST00000390606 PKHD1P08F94 4074 aa14.84□□□□□ -0.03
IGHV3-20-201ENST00000390606 M0QY20 66 aa14.84□□□□□ -0.03
IGHV3-20-201ENST00000390606 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
IGHV3-20-201ENST00000390606 TMEM241Q24JQ0 296 aa14.84□□□□□ -0.03
IGHV3-20-201ENST00000390606 SUMO4Q6EEV6 95 aa14.84□□□□□ -0.03
IGHV3-20-201ENST00000390606 NFE4Q86UQ8 179 aa14.84□□□□□ -0.03
IGHV3-20-201ENST00000390606 DPH3P1Q9H4G8 78 aa14.84□□□□□ -0.03
IGHV3-20-201ENST00000390606 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa14.83□□□□□ -0.04
IGHV3-20-201ENST00000390606 RPL23P62829 140 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
IGHV3-20-201ENST00000390606 TWIST1Q15672 202 aa14.83□□□□□ -0.04
IGHV3-20-201ENST00000390606 ISOC2Q96AB3 205 aa14.83□□□□□ -0.04
IGHV3-20-201ENST00000390606 TSKUQ8WUA8 353 aa14.81□□□□□ -0.04
IGHV3-20-201ENST00000390606 PGLYRP4Q96LB8 373 aa14.81□□□□□ -0.04
IGHV3-20-201ENST00000390606 NAT8Q9UHE5 227 aa14.81□□□□□ -0.04
IGHV3-20-201ENST00000390606 V9GYV3 84 aa14.81□□□□□ -0.04
IGHV3-20-201ENST00000390606 H7C1H1 209 aa14.8□□□□□ -0.04
IGHV3-20-201ENST00000390606 NIT1Q86X76 327 aa14.8□□□□□ -0.04
IGHV3-20-201ENST00000390606 GFRA4Q9GZZ7 299 aa14.8□□□□□ -0.04
IGHV3-20-201ENST00000390606 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa14.79□□□□□ -0.04
IGHV3-20-201ENST00000390606 DNAJC30Q96LL9 226 aa14.79□□□□□ -0.04
IGHV3-20-201ENST00000390606 FAM231BA6NCW3 169 aa14.78□□□□□ -0.04
IGHV3-20-201ENST00000390606 HIGD1CA8MV81 97 aa14.78□□□□□ -0.04
IGHV3-20-201ENST00000390606 ADIRFQ15847 76 aa14.78□□□□□ -0.04
IGHV3-20-201ENST00000390606 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
IGHV3-20-201ENST00000390606 C15orf54Q8N8G6 183 aa14.78□□□□□ -0.04
IGHV3-20-201ENST00000390606 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
IGHV3-20-201ENST00000390606 LAGE3Q14657 143 aa14.77□□□□□ -0.05
IGHV3-20-201ENST00000390606 RASL11AQ6T310 242 aa14.77□□□□□ -0.05
IGHV3-20-201ENST00000390606 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa14.77□□□□□ -0.05
IGHV3-20-201ENST00000390606 RAB14P61106 215 aa14.76□□□□□ -0.05
IGHV3-20-201ENST00000390606 IFITM2Q01629 132 aa14.76□□□□□ -0.05
IGHV3-20-201ENST00000390606 KRTAP10-2P60368 255 aa14.75□□□□□ -0.05
IGHV3-20-201ENST00000390606 SPATA12Q7Z6I5 190 aa14.75□□□□□ -0.05
IGHV3-20-201ENST00000390606 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
IGHV3-20-201ENST00000390606 GATD1Q8NB37 220 aa14.75□□□□□ -0.05
IGHV3-20-201ENST00000390606 Q9HAA7 133 aa14.75□□□□□ -0.05
IGHV3-20-201ENST00000390606 NIT2Q9NQR4 276 aa14.75□□□□□ -0.05
IGHV3-20-201ENST00000390606 A0A1B0GUT8 65 aa14.74□□□□□ -0.05
IGHV3-20-201ENST00000390606 TMEM97Q5BJF2 176 aa14.74□□□□□ -0.05
IGHV3-20-201ENST00000390606 CLLU1Q5K131 121 aa14.74□□□□□ -0.05
IGHV3-20-201ENST00000390606 CHCHD7Q9BUK0 85 aa14.74□□□□□ -0.05
IGHV3-20-201ENST00000390606 A0A087WTM6 91 aa14.73□□□□□ -0.05
IGHV3-20-201ENST00000390606 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa14.73□□□□□ -0.05
IGHV3-20-201ENST00000390606 SMIM15Q7Z3B0 74 aa14.73□□□□□ -0.05
IGHV3-20-201ENST00000390606 BORCS7Q96B45 105 aa14.73□□□□□ -0.05
IGHV3-20-201ENST00000390606 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa14.73□□□□□ -0.05
IGHV3-20-201ENST00000390606 NUP35Q8NFH5 326 aa14.72□□□□□ -0.05
IGHV3-20-201ENST00000390606 C16orf90A8MZG2 172 aa14.71□□□□□ -0.05
IGHV3-20-201ENST00000390606 FRZBQ92765 325 aa14.71□□□□□ -0.05
IGHV3-20-201ENST00000390606 A0A087WX48 190 aa14.7□□□□□ -0.06
IGHV3-20-201ENST00000390606 IQCJQ1A5X6 159 aa14.7□□□□□ -0.06
IGHV3-20-201ENST00000390606 KLK12Q9UKR0 248 aa14.7□□□□□ -0.06
IGHV3-20-201ENST00000390606 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa14.69□□□□□ -0.06
IGHV3-20-201ENST00000390606 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa14.69□□□□□ -0.06
IGHV3-20-201ENST00000390606 TMEM262E9PQX1 116 aa14.69□□□□□ -0.06
IGHV3-20-201ENST00000390606 MPV17L2Q567V2 206 aa14.69□□□□□ -0.06
IGHV3-20-201ENST00000390606 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
IGHV3-20-201ENST00000390606 CHCHD5Q9BSY4 110 aa14.69□□□□□ -0.06
IGHV3-20-201ENST00000390606 TMEM191AQ9H0A3 160 aa14.69□□□□□ -0.06
IGHV3-20-201ENST00000390606 NAT8BQ9UHF3 227 aa14.69□□□□□ -0.06
IGHV3-20-201ENST00000390606 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa14.68□□□□□ -0.06
IGHV3-20-201ENST00000390606 LRCOL1A6NCL2 159 aa14.68□□□□□ -0.06
IGHV3-20-201ENST00000390606 RNF185Q96GF1 192 aa14.68□□□□□ -0.06
IGHV3-20-201ENST00000390606 LRP1BQ9NZR2 4599 aa14.68□□□□□ -0.06
IGHV3-20-201ENST00000390606 KIAA1109Q2LD37 5005 aa14.67□□□□□ -0.06
IGHV3-20-201ENST00000390606 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa14.67□□□□□ -0.06
IGHV3-20-201ENST00000390606 EREGO14944 169 aa14.67□□□□□ -0.06
IGHV3-20-201ENST00000390606 PSCAO43653 123 aa14.67□□□□□ -0.06
IGHV3-20-201ENST00000390606 RIGQ13278 110 aa14.67□□□□□ -0.06
IGHV3-20-201ENST00000390606 ELOBQ15370 118 aa14.67□□□□□ -0.06
IGHV3-20-201ENST00000390606 KCNIP4Q6PIL6 250 aa14.67□□□□□ -0.06
IGHV3-20-201ENST00000390606 ATRAIDQ6UW56 229 aa14.66□□□□□ -0.06
IGHV3-20-201ENST00000390606 TM2D2Q9BX73 214 aa14.66□□□□□ -0.06
IGHV3-20-201ENST00000390606 GAS8-AS1O95177 125 aa14.65□□□□□ -0.06
IGHV3-20-201ENST00000390606 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.06
IGHV3-20-201ENST00000390606 PKIAP61925 76 aa14.65□□□□□ -0.06
IGHV3-20-201ENST00000390606 GAGE6Q13070 117 aa14.65□□□□□ -0.06
IGHV3-20-201ENST00000390606 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa14.65□□□□□ -0.06
IGHV3-20-201ENST00000390606 UBE2WQ96B02 151 aa14.65□□□□□ -0.06
IGHV3-20-201ENST00000390606 RAB4AP20338 218 aa14.64□□□□□ -0.07
IGHV3-20-201ENST00000390606 AMN1Q8IY45 258 aa14.64□□□□□ -0.07
IGHV3-20-201ENST00000390606 Q8N976 141 aa14.64□□□□□ -0.07
IGHV3-20-201ENST00000390606 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa14.64□□□□□ -0.07
IGHV3-20-201ENST00000390606 DNAH5Q8TE73 4624 aa14.64□□□□□ -0.07
IGHV3-20-201ENST00000390606 RBX1P62877 108 aa14.63□□□□□ -0.07
IGHV3-20-201ENST00000390606 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa14.63□□□□□ -0.07
IGHV3-20-201ENST00000390606 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa14.62□□□□□ -0.07
IGHV3-20-201ENST00000390606 COTL1Q14019 142 aa14.62□□□□□ -0.07
IGHV3-20-201ENST00000390606 ENHOQ6UWT2 76 aa14.62□□□□□ -0.07
IGHV3-20-201ENST00000390606 TMEM243Q9BU79 118 aa14.62□□□□□ -0.07
IGHV3-20-201ENST00000390606 HERC2O95714 4834 aa14.61□□□□□ -0.07
IGHV3-20-201ENST00000390606 SDHAF1A6NFY7 115 aa14.61□□□□□ -0.07
IGHV3-20-201ENST00000390606 ANGP03950 147 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
IGHV3-20-201ENST00000390606 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
IGHV3-20-201ENST00000390606 WFDC2Q14508 124 aa14.61□□□□□ -0.07
IGHV3-20-201ENST00000390606 CDPF1Q6NVV7 123 aa14.61□□□□□ -0.07
IGHV3-20-201ENST00000390606 RMI2Q96E14 147 aa14.61□□□□□ -0.07
IGHV3-20-201ENST00000390606 COX11Q9Y6N1 276 aa14.61□□□□□ -0.07
IGHV3-20-201ENST00000390606 RPS10P46783 165 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
IGHV3-20-201ENST00000390606 Q0VG73 95 aa14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88.8 ms