RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000239461.10

PRRX1-201, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRX1, Length 4,284 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-201ENST00000239461 A0A0U1RQV1 116 aa8.09□□□□□ -1.11
PRRX1-201ENST00000239461 ZNF580Q9UK33 172 aa8.09□□□□□ -1.11
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PRRX1-201ENST00000239461 CELSR2Q9HCU4 2923 aa8.09□□□□□ -1.11
PRRX1-201ENST00000239461 UBE2L6O14933 153 aa8.09□□□□□ -1.11
PRRX1-201ENST00000239461 C20orf78Q9BR46 151 aa8.09□□□□□ -1.11
PRRX1-201ENST00000239461 U3KQE9 123 aa8.09□□□□□ -1.11
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PRRX1-201ENST00000239461 LINC01549A6NIU2 74 aa8.01□□□□□ -1.13
PRRX1-201ENST00000239461 SCGB3A1Q96QR1 104 aa8.01□□□□□ -1.13
PRRX1-201ENST00000239461 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa8□□□□□ -1.13
PRRX1-201ENST00000239461 APCP25054 2843 aa8□□□□□ -1.13
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PRRX1-201ENST00000239461 C1orf195Q5TG92 126 aa8□□□□□ -1.13
PRRX1-201ENST00000239461 CHCHD5Q9BSY4 110 aa8□□□□□ -1.13
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