RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580814.1

TSG101-211, Transcript of tumor susceptibility 101, humanhuman

TSL 2

Gene TSG101, Length 441 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSG101-211ENST00000580814 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa3.34□□□□□ -1.87
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TSG101-211ENST00000580814 ERC2-IT1O76042 136 aa3.34□□□□□ -1.87
TSG101-211ENST00000580814 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa3.34□□□□□ -1.87
TSG101-211ENST00000580814 C18orf32Q8TCD1 76 aa3.34□□□□□ -1.87
TSG101-211ENST00000580814 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.88
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TSG101-211ENST00000580814 MYO5CQ9NQX4 1742 aa3.31□□□□□ -1.88
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TSG101-211ENST00000580814 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
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TSG101-211ENST00000580814 ABCC1P33527 1531 aa3.27□□□□□ -1.89
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TSG101-211ENST00000580814 SMIM13P0DJ93 91 aa3.26□□□□□ -1.89
TSG101-211ENST00000580814 SMIM11AP58511 58 aa3.26□□□□□ -1.89
TSG101-211ENST00000580814 MOBPQ13875 183 aa3.26□□□□□ -1.89
TSG101-211ENST00000580814 SFTA2Q6UW10 78 aa3.26□□□□□ -1.89
TSG101-211ENST00000580814 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
TSG101-211ENST00000580814 FAM223AQ8IWN6 122 aa3.26□□□□□ -1.89
TSG101-211ENST00000580814 PRO1854Q9UHT4 67 aa3.26□□□□□ -1.89
TSG101-211ENST00000580814 LHFPL6Q9Y693 200 aa3.26□□□□□ -1.89
TSG101-211ENST00000580814 NWD2Q9ULI1 1742 aa3.26□□□□□ -1.89
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