RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 MSMPQ1L6U9 139 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-209ENST00000550857 NUP35Q8NFH5 326 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-209ENST00000550857 VSIG2Q96IQ7 327 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-209ENST00000550857 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-209ENST00000550857 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-209ENST00000550857 KRTAP10-9P60411 292 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-209ENST00000550857 SPAG11BQ08648 103 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-209ENST00000550857 XCL1P47992 114 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-209ENST00000550857 SPRNQ5BIV9 151 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-209ENST00000550857 DYNAPQ8N1N2 210 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-209ENST00000550857 KLK12Q9UKR0 248 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-209ENST00000550857 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-209ENST00000550857 NIT1Q86X76 327 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-209ENST00000550857 DNAH12Q6ZR08 3092 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-209ENST00000550857 K7ERU9 68 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-209ENST00000550857 GAGE2BQ13066 116 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-209ENST00000550857 UFSP1Q6NVU6 142 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-209ENST00000550857 MUC7Q8TAX7 377 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-209ENST00000550857 LINC00205P59089 165 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-209ENST00000550857 PLCE1Q9P212 2302 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-209ENST00000550857 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-209ENST00000550857 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-209ENST00000550857 F6UB75 175 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-209ENST00000550857 IGLV1-40P01703 118 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-209ENST00000550857 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-209ENST00000550857 IFITM1P13164 125 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-209ENST00000550857 C5orf30Q96GV9 206 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-209ENST00000550857 WFDC1Q9HC57 220 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-209ENST00000550857 Q8N6K4 173 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-209ENST00000550857 PRSS47A8MTI9 375 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-209ENST00000550857 CLUHP3Q96NS8 147 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-209ENST00000550857 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-209ENST00000550857 TMEM213A2RRL7 107 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-209ENST00000550857 HSD52Q0P140 79 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-209ENST00000550857 C1orf134Q5TEV5 83 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-209ENST00000550857 F8WDY8 70 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-209ENST00000550857 C3orf84H3BNL1 204 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-209ENST00000550857 Q6ZVH6 145 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-209ENST00000550857 MED13Q9UHV7 2174 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-209ENST00000550857 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-209ENST00000550857 LTAP01374 205 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-209ENST00000550857 NCKAP5O14513 1909 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-209ENST00000550857 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-209ENST00000550857 IGLV1-51P01701 117 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-209ENST00000550857 PFN2P35080 140 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-209ENST00000550857 SCRT2Q9NQ03 307 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-209ENST00000550857 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-209ENST00000550857 LELP1Q5T871 98 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-209ENST00000550857 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-209ENST00000550857 A0A0U1RRA0 63 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-209ENST00000550857 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-209ENST00000550857 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF581Q9P0T4 197 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRB-209ENST00000550857 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRB-209ENST00000550857 Q8N1Y9 231 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRB-209ENST00000550857 SPANXDQ9BXN6 97 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRB-209ENST00000550857 OXLD1Q5BKU9 147 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRB-209ENST00000550857 CCDC140Q96MF4 163 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRB-209ENST00000550857 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRB-209ENST00000550857 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRB-209ENST00000550857 FGF6P10767 208 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRB-209ENST00000550857 PROK1P58294 105 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRB-209ENST00000550857 ABCA2Q9BZC7 2435 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRB-209ENST00000550857 WISP2O76076 250 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRB-209ENST00000550857 CRYBA4P53673 196 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRB-209ENST00000550857 MTURNQ8N3F0 131 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRB-209ENST00000550857 GNRH2O43555 120 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRB-209ENST00000550857 Q5BKY6 102 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRB-209ENST00000550857 CARD19Q96LW7 228 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRB-209ENST00000550857 ADAMTS20P59510 1910 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRB-209ENST00000550857 F8VRH5 84 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRB-209ENST00000550857 H0YGX0 51 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRB-209ENST00000550857 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
PTPRB-209ENST00000550857 SOCS3O14543 225 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRB-209ENST00000550857 CRYGBP07316 175 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRB-209ENST00000550857 LGALS9CQ6DKI2 356 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRB-209ENST00000550857 COX7B2Q8TF08 81 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRB-209ENST00000550857 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-209ENST00000550857 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-209ENST00000550857 MSRB1Q9NZV6 116 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-209ENST00000550857 ESDP10768 282 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-209ENST00000550857 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-209ENST00000550857 SMR3AQ99954 134 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-209ENST00000550857 DEFB4AO15263 64 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-209ENST00000550857 SERF1AO75920 110 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-209ENST00000550857 CLPSL2Q6UWE3 100 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-209ENST00000550857 GTSF1Q8WW33 167 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-209ENST00000550857 LRRK2Q5S007 2527 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-209ENST00000550857 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-209ENST00000550857 GAGE12HA6NDE8 117 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-209ENST00000550857 MPV17L2Q567V2 206 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-209ENST00000550857 DSCR8Q96T75 97 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-209ENST00000550857 REG3AQ06141 175 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-209ENST00000550857 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-209ENST00000550857 SUMO4Q6EEV6 95 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-209ENST00000550857 CYTL1Q9NRR1 136 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-209ENST00000550857 SYCNQ0VAF6 134 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-209ENST00000550857 GAGE2EQ4V326 116 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-209ENST00000550857 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-209ENST00000550857 HTTP42858 3142 aa6.05□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.4 ms