RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514515.5

NREP-222, Transcript of neuronal regeneration related protein, human

TSL 1 (best)

Gene NREP, Length 3,564 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NREP-222	ENST00000514515	TRBV12-3	P01733	135 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NREP-222	ENST00000514515	C1orf122	Q6ZSJ8	110 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NREP-222	ENST00000514515	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NREP-222	ENST00000514515	CARD19	Q96LW7	228 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NREP-222	ENST00000514515	SS18L2	Q9UHA2	77 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NREP-222	ENST00000514515	TRAV12-3	A0A0B4J271	114 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NREP-222	ENST00000514515	TMEM262	E9PQX1	116 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NREP-222	ENST00000514515	LINC01619	G3V211	115 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NREP-222	ENST00000514515	TTC32	Q5I0X7	151 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NREP-222	ENST00000514515	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
NREP-222	ENST00000514515	VCX2	Q9H322	139 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NREP-222	ENST00000514515	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NREP-222	ENST00000514515		B5MCH6	92 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NREP-222	ENST00000514515	GAGE2B	Q13066	116 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NREP-222	ENST00000514515	FHL3	Q13643	280 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NREP-222	ENST00000514515	GAGE2E	Q4V326	116 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NREP-222	ENST00000514515	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NREP-222	ENST00000514515	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NREP-222	ENST00000514515	ZNF292	O60281	2723 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NREP-222	ENST00000514515	DCHS2	Q6V1P9	2916 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NREP-222	ENST00000514515	MUC6	Q6W4X9	2439 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NREP-222	ENST00000514515	GATA3	P23771	443 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NREP-222	ENST00000514515	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
NREP-222	ENST00000514515	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		4.78	□□□□□ -1.65
NREP-222	ENST00000514515	CRYGD	P07320	174 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NREP-222	ENST00000514515	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NREP-222	ENST00000514515	UBE2D3	P61077	147 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NREP-222	ENST00000514515	NPC2	P61916	151 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NREP-222	ENST00000514515	UBE2D2	P62837	147 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NREP-222	ENST00000514515	FOXC1	Q12948	553 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NREP-222	ENST00000514515	EBI3	Q14213	229 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NREP-222	ENST00000514515	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NREP-222	ENST00000514515	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NREP-222	ENST00000514515	IGHV3-30	P01768	117 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NREP-222	ENST00000514515	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NREP-222	ENST00000514515	UBE2E1	P51965	193 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NREP-222	ENST00000514515	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
NREP-222	ENST00000514515	TCF15	Q12870	199 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NREP-222	ENST00000514515	IGF2-AS	Q6U949	168 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NREP-222	ENST00000514515	SPX	Q9BT56	116 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NREP-222	ENST00000514515	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NREP-222	ENST00000514515	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NREP-222	ENST00000514515	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NREP-222	ENST00000514515	CENPVL3	A0A0U1RRI6	287 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NREP-222	ENST00000514515	TSHB	P01222	138 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NREP-222	ENST00000514515	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
NREP-222	ENST00000514515	COX6B1	P14854	86 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NREP-222	ENST00000514515	GPHB5	Q86YW7	130 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NREP-222	ENST00000514515	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NREP-222	ENST00000514515	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NREP-222	ENST00000514515	ZNRF2	Q8NHG8	242 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NREP-222	ENST00000514515	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NREP-222	ENST00000514515	TMEM141	Q96I45	108 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NREP-222	ENST00000514515	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NREP-222	ENST00000514515	NPFF	O15130	113 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NREP-222	ENST00000514515	CDSN	Q15517	529 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NREP-222	ENST00000514515	IGHV1-69D	A0A0B4J2H0	117 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NREP-222	ENST00000514515	NBL1	P41271	181 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NREP-222	ENST00000514515	SIRPD	Q9H106	197 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NREP-222	ENST00000514515	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NREP-222	ENST00000514515		A0A0J9YXV3	536 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NREP-222	ENST00000514515	IGIP	A6NJ69	53 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NREP-222	ENST00000514515	GAGE5	Q13069	117 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NREP-222	ENST00000514515	GAGE6	Q13070	117 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NREP-222	ENST00000514515	ITLN2	Q8WWU7	325 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
NREP-222	ENST00000514515	BPESC1	Q9GZL8	116 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NREP-222	ENST00000514515	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NREP-222	ENST00000514515	ATXN8	Q156A1	80 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NREP-222	ENST00000514515	ZNF876P	Q49A33	203 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NREP-222	ENST00000514515	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
NREP-222	ENST00000514515	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NREP-222	ENST00000514515	KLK9	Q9UKQ9	250 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NREP-222	ENST00000514515		U3KQE9	123 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NREP-222	ENST00000514515	TEX49	A0A1B0GTD5	131 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NREP-222	ENST00000514515	ID1	P41134	155 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NREP-222	ENST00000514515	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NREP-222	ENST00000514515	FAM223B	A6NKX1	122 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NREP-222	ENST00000514515	RNF223	E7ERA6	249 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NREP-222	ENST00000514515	NDUFA4	O00483	81 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NREP-222	ENST00000514515	IGHV3-33	P01772	117 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NREP-222	ENST00000514515	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NREP-222	ENST00000514515	C2orf82	Q6UX34	121 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NREP-222	ENST00000514515	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NREP-222	ENST00000514515		Q8N1Y9	231 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NREP-222	ENST00000514515	TIMM17A	Q99595	171 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NREP-222	ENST00000514515	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NREP-222	ENST00000514515	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NREP-222	ENST00000514515	COX6C	P09669	75 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NREP-222	ENST00000514515	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NREP-222	ENST00000514515	ZNF580	Q9UK33	172 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NREP-222	ENST00000514515	NCOR2	Q9Y618	2525 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NREP-222	ENST00000514515	CD28	P10747	220 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NREP-222	ENST00000514515	LINC01620	Q4KN68	170 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NREP-222	ENST00000514515	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NREP-222	ENST00000514515	LEPROT	O15243	131 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NREP-222	ENST00000514515	COL12A1	Q99715	3063 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NREP-222	ENST00000514515	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NREP-222	ENST00000514515		A0A087WW49	117 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NREP-222	ENST00000514515		A0A0U1RRA0	63 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NREP-222	ENST00000514515	CRLF1	O75462	422 aa		4.73	□□□□□ -1.65

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