RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399492.6

CD27-AS1-201, CD27 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CD27-AS1, Length 1,094 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27-AS1-201ENST00000399492 SIVA1O15304 175 aa8.62□□□□□ -1.03
CD27-AS1-201ENST00000399492 IGLC6P0CF74 106 aa8.62□□□□□ -1.03
CD27-AS1-201ENST00000399492 PEA15Q15121 130 aa8.62□□□□□ -1.03
CD27-AS1-201ENST00000399492 C1orf134Q5TEV5 83 aa8.62□□□□□ -1.03
CD27-AS1-201ENST00000399492 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa8.62□□□□□ -1.03
CD27-AS1-201ENST00000399492 SMIM7Q9BQ49 75 aa8.62□□□□□ -1.03
CD27-AS1-201ENST00000399492 LY96Q9Y6Y9 160 aa8.62□□□□□ -1.03
CD27-AS1-201ENST00000399492 F2Z2F3 143 aa8.61□□□□□ -1.03
CD27-AS1-201ENST00000399492 TIRAPP58753 221 aa8.61□□□□□ -1.03
CD27-AS1-201ENST00000399492 CACNG7P62955 275 aa8.61□□□□□ -1.03
CD27-AS1-201ENST00000399492 SOHLH1Q5JUK2 328 aa8.61□□□□□ -1.03
CD27-AS1-201ENST00000399492 LINC00336Q6ZUF6 198 aa8.61□□□□□ -1.03
CD27-AS1-201ENST00000399492 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
CD27-AS1-201ENST00000399492 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa8.61□□□□□ -1.03
CD27-AS1-201ENST00000399492 TPPP3Q9BW30 176 aa8.61□□□□□ -1.03
CD27-AS1-201ENST00000399492 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
CD27-AS1-201ENST00000399492 A0A1W2PPQ1 181 aa8.6□□□□□ -1.03
CD27-AS1-201ENST00000399492 GAGE12JA6NER3 117 aa8.6□□□□□ -1.03
CD27-AS1-201ENST00000399492 RTL8CO15255 209 aa8.6□□□□□ -1.03
CD27-AS1-201ENST00000399492 GATCO43716 136 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CD27-AS1-201ENST00000399492 RAB4BP61018 213 aa8.6□□□□□ -1.03
CD27-AS1-201ENST00000399492 GAGE1Q13065 139 aa8.6□□□□□ -1.03
CD27-AS1-201ENST00000399492 GAGE4Q13068 117 aa8.6□□□□□ -1.03
CD27-AS1-201ENST00000399492 GAGE5Q13069 117 aa8.6□□□□□ -1.03
CD27-AS1-201ENST00000399492 GAGE13Q4V321 117 aa8.6□□□□□ -1.03
CD27-AS1-201ENST00000399492 TTC32Q5I0X7 151 aa8.6□□□□□ -1.03
CD27-AS1-201ENST00000399492 WDR73Q6P4I2 378 aa8.6□□□□□ -1.03
CD27-AS1-201ENST00000399492 LYZL1Q6UWQ5 148 aa8.6□□□□□ -1.03
CD27-AS1-201ENST00000399492 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa8.6□□□□□ -1.03
CD27-AS1-201ENST00000399492 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa8.6□□□□□ -1.03
CD27-AS1-201ENST00000399492 SMDT1Q9H4I9 107 aa8.6□□□□□ -1.03
CD27-AS1-201ENST00000399492 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CD27-AS1-201ENST00000399492 RAB14P61106 215 aa8.59□□□□□ -1.03
CD27-AS1-201ENST00000399492 TMEM241Q24JQ0 296 aa8.59□□□□□ -1.03
CD27-AS1-201ENST00000399492 FAM74A3Q4VXF1 159 aa8.59□□□□□ -1.03
CD27-AS1-201ENST00000399492 FAM231DQ6ZW35 169 aa8.59□□□□□ -1.03
CD27-AS1-201ENST00000399492 GTSF1LQ9H1H1 148 aa8.59□□□□□ -1.03
CD27-AS1-201ENST00000399492 Q9UF83 564 aa8.59□□□□□ -1.03
CD27-AS1-201ENST00000399492 C9JQL5 133 aa8.58□□□□□ -1.04
CD27-AS1-201ENST00000399492 F5H697 171 aa8.58□□□□□ -1.04
CD27-AS1-201ENST00000399492 SMIM17P0DL12 118 aa8.58□□□□□ -1.04
CD27-AS1-201ENST00000399492 ERVFC1-1P60608 527 aa8.58□□□□□ -1.04
CD27-AS1-201ENST00000399492 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CD27-AS1-201ENST00000399492 LINC01551Q86U37 167 aa8.58□□□□□ -1.04
CD27-AS1-201ENST00000399492 C6orf223Q8N319 242 aa8.58□□□□□ -1.04
CD27-AS1-201ENST00000399492 MSRB1Q9NZV6 116 aa8.58□□□□□ -1.04
CD27-AS1-201ENST00000399492 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa8.58□□□□□ -1.04
CD27-AS1-201ENST00000399492 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa8.57□□□□□ -1.04
CD27-AS1-201ENST00000399492 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa8.57□□□□□ -1.04
CD27-AS1-201ENST00000399492 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa8.57□□□□□ -1.04
CD27-AS1-201ENST00000399492 PRSS29PA6NIE9 313 aa8.57□□□□□ -1.04
CD27-AS1-201ENST00000399492 A8MWL6 223 aa8.57□□□□□ -1.04
CD27-AS1-201ENST00000399492 NTF3P20783 257 aa8.57□□□□□ -1.04
CD27-AS1-201ENST00000399492 ZNF56Q15929 161 aa8.57□□□□□ -1.04
CD27-AS1-201ENST00000399492 LELP1Q5T871 98 aa8.57□□□□□ -1.04
CD27-AS1-201ENST00000399492 AP1S3Q96PC3 154 aa8.57□□□□□ -1.04
CD27-AS1-201ENST00000399492 LINC00694P0DN24 101 aa8.56□□□□□ -1.04
CD27-AS1-201ENST00000399492 BTF3P20290 206 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
CD27-AS1-201ENST00000399492 EVI2AP22794 236 aa8.56□□□□□ -1.04
CD27-AS1-201ENST00000399492 LINC00315P59091 139 aa8.56□□□□□ -1.04
CD27-AS1-201ENST00000399492 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
CD27-AS1-201ENST00000399492 OR10J3Q5JRS4 329 aa8.56□□□□□ -1.04
CD27-AS1-201ENST00000399492 WFDC10BQ8IUB3 73 aa8.56□□□□□ -1.04
CD27-AS1-201ENST00000399492 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
CD27-AS1-201ENST00000399492 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa8.56□□□□□ -1.04
CD27-AS1-201ENST00000399492 OSTCQ9NRP0 149 aa8.56□□□□□ -1.04
CD27-AS1-201ENST00000399492 KMT2AQ03164 3969 aa8.55□□□□□ -1.04
CD27-AS1-201ENST00000399492 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa8.55□□□□□ -1.04
CD27-AS1-201ENST00000399492 K7EP13 123 aa8.55□□□□□ -1.04
CD27-AS1-201ENST00000399492 TRGC1P0CF51 173 aa8.55□□□□□ -1.04
CD27-AS1-201ENST00000399492 DNAH10OSP0CZ25 163 aa8.55□□□□□ -1.04
CD27-AS1-201ENST00000399492 CTRLP40313 264 aa8.55□□□□□ -1.04
CD27-AS1-201ENST00000399492 CT83Q5H943 113 aa8.55□□□□□ -1.04
CD27-AS1-201ENST00000399492 DNAH6Q9C0G6 4158 aa8.55□□□□□ -1.04
CD27-AS1-201ENST00000399492 A0A087WWC5 75 aa8.54□□□□□ -1.04
CD27-AS1-201ENST00000399492 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa8.54□□□□□ -1.04
CD27-AS1-201ENST00000399492 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CD27-AS1-201ENST00000399492 RPL23P62829 140 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CD27-AS1-201ENST00000399492 TWIST1Q15672 202 aa8.54□□□□□ -1.04
CD27-AS1-201ENST00000399492 C15orf54Q8N8G6 183 aa8.54□□□□□ -1.04
CD27-AS1-201ENST00000399492 OR10G8Q8NGN5 311 aa8.54□□□□□ -1.04
CD27-AS1-201ENST00000399492 GTSF1Q8WW33 167 aa8.54□□□□□ -1.04
CD27-AS1-201ENST00000399492 CNFNQ9BYD5 112 aa8.54□□□□□ -1.04
CD27-AS1-201ENST00000399492 NAT8Q9UHE5 227 aa8.54□□□□□ -1.04
CD27-AS1-201ENST00000399492 MGPP08493 103 aa8.53□□□□□ -1.04
CD27-AS1-201ENST00000399492 UBE2D3P61077 147 aa8.53□□□□□ -1.04
CD27-AS1-201ENST00000399492 UBE2D2P62837 147 aa8.53□□□□□ -1.04
CD27-AS1-201ENST00000399492 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa8.53□□□□□ -1.04
CD27-AS1-201ENST00000399492 ISOC2Q96AB3 205 aa8.53□□□□□ -1.04
CD27-AS1-201ENST00000399492 PGLYRP4Q96LB8 373 aa8.53□□□□□ -1.04
CD27-AS1-201ENST00000399492 DPH3P1Q9H4G8 78 aa8.53□□□□□ -1.04
CD27-AS1-201ENST00000399492 H7C1H1 209 aa8.52□□□□□ -1.05
CD27-AS1-201ENST00000399492 IFITM2Q01629 132 aa8.52□□□□□ -1.05
CD27-AS1-201ENST00000399492 ADIRFQ15847 76 aa8.52□□□□□ -1.05
CD27-AS1-201ENST00000399492 LINC01556Q5JQF7 62 aa8.52□□□□□ -1.05
CD27-AS1-201ENST00000399492 CLLU1Q5K131 121 aa8.52□□□□□ -1.05
CD27-AS1-201ENST00000399492 TSKUQ8WUA8 353 aa8.52□□□□□ -1.05
CD27-AS1-201ENST00000399492 GFRA4Q9GZZ7 299 aa8.52□□□□□ -1.05
CD27-AS1-201ENST00000399492 A0A1B0GVY2 172 aa8.51□□□□□ -1.05
CD27-AS1-201ENST00000399492 FAM231BA6NCW3 169 aa8.51□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.2 ms