RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384085.1

RNU6-38P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-38P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-38P-201ENST00000384085 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa-1.17□□□□□ -2.6
RNU6-38P-201ENST00000384085 TCRAP04437 139 aa-1.18□□□□□ -2.6
RNU6-38P-201ENST00000384085 GID8Q9NWU2 228 aa-1.18□□□□□ -2.6
RNU6-38P-201ENST00000384085 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa-1.18□□□□□ -2.6
RNU6-38P-201ENST00000384085 GOLGA3Q08378 1498 aa-1.18□□□□□ -2.6
RNU6-38P-201ENST00000384085 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-38P-201ENST00000384085 TRAV22A0A0B4J277 110 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-38P-201ENST00000384085 SPRR1AP35321 89 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-38P-201ENST00000384085 NPC2P61916 151 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-38P-201ENST00000384085 TRIQKQ629K1 86 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-38P-201ENST00000384085 SNX29P2Q8IUI4 249 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-38P-201ENST00000384085 MNS1Q8NEH6 495 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-38P-201ENST00000384085 DYNLRB2Q8TF09 96 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-38P-201ENST00000384085 TENM2Q9NT68 2774 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-38P-201ENST00000384085 ERG28Q9UKR5 140 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-38P-201ENST00000384085 DOCK11Q5JSL3 2073 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-38P-201ENST00000384085 MED23Q9ULK4 1368 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-38P-201ENST00000384085 COL6A3P12111 3177 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-38P-201ENST00000384085 PLXNA2O75051 1894 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-38P-201ENST00000384085 KDM5CP41229 1560 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-38P-201ENST00000384085 RPL7P18124 248 aaKnown RBP-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-38P-201ENST00000384085 PTPRMP28827 1452 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-38P-201ENST00000384085 BSNQ9UPA5 3926 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-38P-201ENST00000384085 PDZD2O15018 2839 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-38P-201ENST00000384085 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-38P-201ENST00000384085 G3V318 75 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-38P-201ENST00000384085 SPRR2BP35325 72 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-38P-201ENST00000384085 CCDC115Q96NT0 180 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-38P-201ENST00000384085 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-38P-201ENST00000384085 CHD6Q8TD26 2715 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-38P-201ENST00000384085 LRP1BQ9NZR2 4599 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-38P-201ENST00000384085 VWFP04275 2813 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-38P-201ENST00000384085 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-38P-201ENST00000384085 ARAP1Q96P48 1450 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-38P-201ENST00000384085 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-38P-201ENST00000384085 ATPIF1Q9UII2 106 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-38P-201ENST00000384085 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-38P-201ENST00000384085 ROCK1Q13464 1354 aa-1.22□□□□□ -2.61
RNU6-38P-201ENST00000384085 CASZ1Q86V15 1759 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-38P-201ENST00000384085 KIF13AQ9H1H9 1805 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-38P-201ENST00000384085 TMEM238C9JI98 176 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-38P-201ENST00000384085 E2F6O75461 281 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-38P-201ENST00000384085 SPCS2Q15005 226 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-38P-201ENST00000384085 PCLOQ9Y6V0 5065 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-38P-201ENST00000384085 FAT2Q9NYQ8 4349 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-38P-201ENST00000384085 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-38P-201ENST00000384085 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-38P-201ENST00000384085 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-38P-201ENST00000384085 C2CD3Q4AC94 2353 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-38P-201ENST00000384085 AKAP11Q9UKA4 1901 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-38P-201ENST00000384085 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-38P-201ENST00000384085 RBP4P02753 201 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-38P-201ENST00000384085 CALML5Q9NZT1 146 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-38P-201ENST00000384085 NEBP20929 6669 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-38P-201ENST00000384085 PHIPQ8WWQ0 1821 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-38P-201ENST00000384085 CCDC179H3BU77 68 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-38P-201ENST00000384085 PIN1P1O15428 100 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-38P-201ENST00000384085 TMEM91Q6ZNR0 172 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-38P-201ENST00000384085 PCBD2Q9H0N5 130 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-38P-201ENST00000384085 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-38P-201ENST00000384085 ACANP16112 2415 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-38P-201ENST00000384085 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-38P-201ENST00000384085 J3QLW9 94 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-38P-201ENST00000384085 EDDM3BP56851 147 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-38P-201ENST00000384085 SPCS1Q9Y6A9 102 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-38P-201ENST00000384085 NRXN2Q9P2S2 1712 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-38P-201ENST00000384085 SMIM24O75264 130 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-38P-201ENST00000384085 DPM2O94777 84 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-38P-201ENST00000384085 PAEPP09466 180 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-38P-201ENST00000384085 G0S2P27469 103 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-38P-201ENST00000384085 BANF2Q9H503 90 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-38P-201ENST00000384085 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-38P-201ENST00000384085 WNK1Q9H4A3 2382 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-38P-201ENST00000384085 K7EQZ3 153 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-38P-201ENST00000384085 SAMD13Q5VXD3 122 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-38P-201ENST00000384085 TMEM35BQ8NCS4 154 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-38P-201ENST00000384085 BCL9LQ86UU0 1499 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-38P-201ENST00000384085 E5RI56 91 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-38P-201ENST00000384085 M0R2P5 195 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-38P-201ENST00000384085 YPEL1O60688 119 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-38P-201ENST00000384085 MT-ND4LP03901 98 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-38P-201ENST00000384085 HLA-DRB4P13762 266 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-38P-201ENST00000384085 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-38P-201ENST00000384085 CLLU1Q5K131 121 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-38P-201ENST00000384085 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR8I2Q8N0Y5 310 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-38P-201ENST00000384085 WFDC6Q9BQY6 131 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-38P-201ENST00000384085 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-38P-201ENST00000384085 CSPG4Q6UVK1 2322 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-38P-201ENST00000384085 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-38P-201ENST00000384085 LOC730098B7Z3J9 87 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-38P-201ENST00000384085 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-38P-201ENST00000384085 NPFFO15130 113 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-38P-201ENST00000384085 TOMM20LQ6UXN7 152 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF609O15014 1411 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-38P-201ENST00000384085 C10orf71Q711Q0 1435 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-38P-201ENST00000384085 TMEM128Q5BJH2 165 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-38P-201ENST00000384085 NPVFQ9HCQ7 196 aa-1.32□□□□□ -2.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48 ms