RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637052.1

SYNGAP1-219, Transcript of synaptic Ras GTPase activating protein 1, human

TSL 5

Gene SYNGAP1, Length 100 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SYNGAP1-219	ENST00000637052	C2orf50	Q96LR7	162 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	LINC00479	Q96M42	142 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	SDHC	Q99643	169 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	PARL	Q9H300	379 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	TREM1	Q9NP99	234 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	NAP1L6	A6NFF2	107 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	USP17L23	D6RBM5	183 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	HBG1	P69891	147 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	HBG2	P69892	147 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	ATRAID	Q6UW56	229 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	KCNS1	Q96KK3	526 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	ATP5S	Q99766	215 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	NMES1	Q9C002	83 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	PVALB	P20472	110 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052	LGALSL	Q3ZCW2	172 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052	STX12	Q86Y82	276 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052	PTH2	Q96A98	100 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052	OTOR	Q9NRC9	128 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052	MBD2	Q9UBB5	411 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052	URGCP-MRPS24	S4R325	110 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052		A0A087WWC5	75 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052	PLA2G10	O15496	165 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052	GCG	P01275	180 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052	CHTF8	P0CG12	524 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052	C14orf177	Q52M58	125 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052	CMTM2	Q8TAZ6	248 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052	LINC01600	Q96MT4	127 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052		A0A087WX48	190 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052		A0A0D9SG52	128 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052	TMEM262	E9PQX1	116 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052		H0YIZ8	118 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052	TAAR5	O14804	337 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052	SIX6	O95475	246 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052	HLA-DQA1	P01909	254 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052	S100A5	P33763	92 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052	KRTAP10-8	P60410	259 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052		Q0VG73	95 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052	TRIQK	Q629K1	86 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052	C15orf54	Q8N8G6	183 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052	OR5AC2	Q9NZP5	309 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052	MUC2	Q02817	5179 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052		A0A087WYN8	130 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052		A8MWV9	139 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052	PHOX2A	O14813	284 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052	SLPI	P03973	132 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052	TCRB	P04435	133 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052	ELOB	Q15370	118 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052	MPV17L2	Q567V2	206 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052	KHDC3L	Q587J8	217 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052	DPH3	Q96FX2	82 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052	PSG8	Q9UQ74	426 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052		A0A087WWL8	130 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052	CENPX	A8MT69	81 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052	SEC11B	P0C7V7	166 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052	IL7	P13232	177 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052	SMUG1	Q53HV7	270 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052	PRNT	Q86SH4	94 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052	ARL6IP6	Q8N6S5	226 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052	OR10G9	Q8NGN4	311 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052	MUC21	A0A0G2JKD1	596 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052		A0A0J9YXV3	536 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052	GRIFIN	A4D1Z8	144 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052		H3BVH4	76 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052	CRP	P02741	224 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052	TCRA	P04437	139 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052	TAS2R45	P59539	299 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052	UBE2D3	P61077	147 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-219	ENST00000637052	UBE2D2	P62837	147 aa		4.53	□□□□□ -1.68

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