RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476941.5

TRPC1-203, Transcript of transient receptor potential cation channel subfamily C member 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPC1, Length 3,061 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1-203ENST00000476941 KLRB1Q12918 225 aa14.65□□□□□ -0.06
TRPC1-203ENST00000476941 ANKRD29Q8N6D5 301 aa14.65□□□□□ -0.06
TRPC1-203ENST00000476941 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa14.64□□□□□ -0.07
TRPC1-203ENST00000476941 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa14.64□□□□□ -0.07
TRPC1-203ENST00000476941 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa14.64□□□□□ -0.07
TRPC1-203ENST00000476941 SLC25A16P16260 332 aa14.64□□□□□ -0.07
TRPC1-203ENST00000476941 PRAC2D3DTV9 90 aa14.64□□□□□ -0.07
TRPC1-203ENST00000476941 CLEC19AQ6UXS0 136 aa14.64□□□□□ -0.07
TRPC1-203ENST00000476941 IGHG4P01861 327 aa14.63□□□□□ -0.07
TRPC1-203ENST00000476941 SCGB1C2P0DMR2 95 aa14.63□□□□□ -0.07
TRPC1-203ENST00000476941 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TRPC1-203ENST00000476941 IL17RELQ6ZVW7 336 aa14.63□□□□□ -0.07
TRPC1-203ENST00000476941 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa14.63□□□□□ -0.07
TRPC1-203ENST00000476941 MSRB2Q9Y3D2 182 aa14.63□□□□□ -0.07
TRPC1-203ENST00000476941 TMEM262E9PQX1 116 aa14.62□□□□□ -0.07
TRPC1-203ENST00000476941 ATP6V0E1O15342 81 aa14.62□□□□□ -0.07
TRPC1-203ENST00000476941 C11orf71Q6IPW1 123 aa14.62□□□□□ -0.07
TRPC1-203ENST00000476941 TMEM219Q86XT9 240 aa14.62□□□□□ -0.07
TRPC1-203ENST00000476941 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa14.62□□□□□ -0.07
TRPC1-203ENST00000476941 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa14.62□□□□□ -0.07
TRPC1-203ENST00000476941 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TRPC1-203ENST00000476941 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa14.62□□□□□ -0.07
TRPC1-203ENST00000476941 SHISA2Q6UWI4 295 aa14.62□□□□□ -0.07
TRPC1-203ENST00000476941 Q8N9W7 124 aa14.62□□□□□ -0.07
TRPC1-203ENST00000476941 CD7P09564 240 aa14.61□□□□□ -0.07
TRPC1-203ENST00000476941 SAA4P35542 130 aa14.61□□□□□ -0.07
TRPC1-203ENST00000476941 NDUFA11Q86Y39 141 aa14.61□□□□□ -0.07
TRPC1-203ENST00000476941 C11orf21Q9P2W6 132 aa14.61□□□□□ -0.07
TRPC1-203ENST00000476941 VPS13CQ709C8 3753 aa14.61□□□□□ -0.07
TRPC1-203ENST00000476941 SPANXN1Q5VSR9 72 aa14.6□□□□□ -0.07
TRPC1-203ENST00000476941 GAGE2BQ13066 116 aa14.6□□□□□ -0.07
TRPC1-203ENST00000476941 GAGE2EQ4V326 116 aa14.6□□□□□ -0.07
TRPC1-203ENST00000476941 CITED1Q99966 193 aa14.6□□□□□ -0.07
TRPC1-203ENST00000476941 SMIM2Q9BVW6 85 aa14.6□□□□□ -0.07
TRPC1-203ENST00000476941 GAGE2DQ9UEU5 116 aa14.6□□□□□ -0.07
TRPC1-203ENST00000476941 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa14.6□□□□□ -0.07
TRPC1-203ENST00000476941 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa14.59□□□□□ -0.07
TRPC1-203ENST00000476941 BPESC1Q9GZL8 116 aa14.59□□□□□ -0.07
TRPC1-203ENST00000476941 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa14.59□□□□□ -0.07
TRPC1-203ENST00000476941 HERV-K104P63124 156 aa14.59□□□□□ -0.07
TRPC1-203ENST00000476941 CSPG4Q6UVK1 2322 aa14.59□□□□□ -0.07
TRPC1-203ENST00000476941 SNCGO76070 127 aa14.58□□□□□ -0.08
TRPC1-203ENST00000476941 AJUBAQ96IF1 538 aa14.58□□□□□ -0.08
TRPC1-203ENST00000476941 SCGB2A1O75556 95 aa14.57□□□□□ -0.08
TRPC1-203ENST00000476941 SMIM20Q8N5G0 67 aa14.57□□□□□ -0.08
TRPC1-203ENST00000476941 Q8N6K4 173 aa14.57□□□□□ -0.08
TRPC1-203ENST00000476941 RASL10AQ92737 203 aa14.57□□□□□ -0.08
TRPC1-203ENST00000476941 CCDC179H3BU77 68 aa14.57□□□□□ -0.08
TRPC1-203ENST00000476941 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
TRPC1-203ENST00000476941 SBSPONQ8IVN8 264 aa14.57□□□□□ -0.08
TRPC1-203ENST00000476941 GAGE12JA6NER3 117 aa14.57□□□□□ -0.08
TRPC1-203ENST00000476941 RHODO00212 210 aa14.57□□□□□ -0.08
TRPC1-203ENST00000476941 GAGE7O76087 117 aa14.57□□□□□ -0.08
TRPC1-203ENST00000476941 GAGE12FP0CL80 117 aa14.57□□□□□ -0.08
TRPC1-203ENST00000476941 GAGE12GP0CL81 117 aa14.57□□□□□ -0.08
TRPC1-203ENST00000476941 GAGE12IP0CL82 117 aa14.57□□□□□ -0.08
TRPC1-203ENST00000476941 SRD5A1P18405 259 aa14.57□□□□□ -0.08
TRPC1-203ENST00000476941 GAGE4Q13068 117 aa14.57□□□□□ -0.08
TRPC1-203ENST00000476941 ORMDL2Q53FV1 153 aa14.57□□□□□ -0.08
TRPC1-203ENST00000476941 Q6ZQT7 251 aa14.57□□□□□ -0.08
TRPC1-203ENST00000476941 BAALCQ8WXS3 180 aa14.57□□□□□ -0.08
TRPC1-203ENST00000476941 TOMM6Q96B49 74 aa14.56□□□□□ -0.08
TRPC1-203ENST00000476941 TRAV4A0A0B4J268 109 aa14.56□□□□□ -0.08
TRPC1-203ENST00000476941 TTC32Q5I0X7 151 aa14.56□□□□□ -0.08
TRPC1-203ENST00000476941 SIRPDQ9H106 197 aa14.56□□□□□ -0.08
TRPC1-203ENST00000476941 C9JAW5 83 aa14.55□□□□□ -0.08
TRPC1-203ENST00000476941 SLC25A20O43772 301 aa14.55□□□□□ -0.08
TRPC1-203ENST00000476941 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa14.55□□□□□ -0.08
TRPC1-203ENST00000476941 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa14.55□□□□□ -0.08
TRPC1-203ENST00000476941 COX6B1P14854 86 aa14.55□□□□□ -0.08
TRPC1-203ENST00000476941 MINOS1Q5TGZ0 78 aa14.55□□□□□ -0.08
TRPC1-203ENST00000476941 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa14.55□□□□□ -0.08
TRPC1-203ENST00000476941 SPRY2O43597 315 aa14.55□□□□□ -0.08
TRPC1-203ENST00000476941 CFC1BP0CG36 223 aa14.55□□□□□ -0.08
TRPC1-203ENST00000476941 CFC1P0CG37 223 aa14.55□□□□□ -0.08
TRPC1-203ENST00000476941 EMP1P54849 157 aa14.55□□□□□ -0.08
TRPC1-203ENST00000476941 BRD3OSQ6XYD6 125 aa14.55□□□□□ -0.08
TRPC1-203ENST00000476941 C2orf66Q6UXQ4 117 aa14.54□□□□□ -0.08
TRPC1-203ENST00000476941 CRLF1O75462 422 aa14.54□□□□□ -0.08
TRPC1-203ENST00000476941 C10orf126Q8N4M7 172 aa14.54□□□□□ -0.08
TRPC1-203ENST00000476941 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
TRPC1-203ENST00000476941 A0A0J9YY99 117 aa14.53□□□□□ -0.08
TRPC1-203ENST00000476941 BUB3O43684 328 aa14.53□□□□□ -0.08
TRPC1-203ENST00000476941 RAX2Q96IS3 184 aa14.53□□□□□ -0.08
TRPC1-203ENST00000476941 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
TRPC1-203ENST00000476941 CCDC140Q96MF4 163 aa14.52□□□□□ -0.08
TRPC1-203ENST00000476941 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa14.52□□□□□ -0.08
TRPC1-203ENST00000476941 ITPR1Q14643 2758 aa14.52□□□□□ -0.08
TRPC1-203ENST00000476941 RPL32P62910 135 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
TRPC1-203ENST00000476941 Q6ZS46 218 aa14.52□□□□□ -0.08
TRPC1-203ENST00000476941 DEFB1P60022 68 aa14.52□□□□□ -0.09
TRPC1-203ENST00000476941 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
TRPC1-203ENST00000476941 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
TRPC1-203ENST00000476941 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
TRPC1-203ENST00000476941 IFITM1P13164 125 aa14.51□□□□□ -0.09
TRPC1-203ENST00000476941 EBI3Q14213 229 aa14.51□□□□□ -0.09
TRPC1-203ENST00000476941 SLC50A1Q9BRV3 221 aa14.51□□□□□ -0.09
TRPC1-203ENST00000476941 PRO1854Q9UHT4 67 aa14.51□□□□□ -0.09
TRPC1-203ENST00000476941 H7C2G1 150 aa14.51□□□□□ -0.09
TRPC1-203ENST00000476941 UBE2E1P51965 193 aa14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.5 ms