RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395211.6

TMOD1-203, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,259 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-203ENST00000395211 UBE2E1P51965 193 aa7.33□□□□□ -1.24
TMOD1-203ENST00000395211 RHOHQ15669 191 aa7.33□□□□□ -1.24
TMOD1-203ENST00000395211 H3BRN7 92 aa7.32□□□□□ -1.24
TMOD1-203ENST00000395211 IGHV1-2P23083 117 aa7.32□□□□□ -1.24
TMOD1-203ENST00000395211 TOMM6Q96B49 74 aa7.32□□□□□ -1.24
TMOD1-203ENST00000395211 PKDREJQ9NTG1 2253 aa7.32□□□□□ -1.24
TMOD1-203ENST00000395211 OXTP01178 125 aa7.32□□□□□ -1.24
TMOD1-203ENST00000395211 IGHV3-23P01764 117 aa7.32□□□□□ -1.24
TMOD1-203ENST00000395211 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
TMOD1-203ENST00000395211 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
TMOD1-203ENST00000395211 Q0VFX4 171 aa7.32□□□□□ -1.24
TMOD1-203ENST00000395211 LYPD1Q8N2G4 141 aa7.32□□□□□ -1.24
TMOD1-203ENST00000395211 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
TMOD1-203ENST00000395211 SMCR5Q8TEV8 140 aa7.32□□□□□ -1.24
TMOD1-203ENST00000395211 JPT2Q9H910 190 aa7.32□□□□□ -1.24
TMOD1-203ENST00000395211 OXLD1Q5BKU9 147 aa7.31□□□□□ -1.24
TMOD1-203ENST00000395211 ICOSQ9Y6W8 199 aa7.31□□□□□ -1.24
TMOD1-203ENST00000395211 EDN2P20800 178 aa7.31□□□□□ -1.24
TMOD1-203ENST00000395211 UCNP55089 124 aa7.31□□□□□ -1.24
TMOD1-203ENST00000395211 RPS28P62857 69 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
TMOD1-203ENST00000395211 DEFB123Q8N688 67 aa7.31□□□□□ -1.24
TMOD1-203ENST00000395211 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD1-203ENST00000395211 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
TMOD1-203ENST00000395211 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD1-203ENST00000395211 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD1-203ENST00000395211 RNF182Q8N6D2 247 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF491Q8N8L2 437 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD1-203ENST00000395211 MRAPQ8TCY5 172 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD1-203ENST00000395211 FAM19A4Q96LR4 140 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD1-203ENST00000395211 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD1-203ENST00000395211 H3BT86 120 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD1-203ENST00000395211 RPL39P62891 51 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD1-203ENST00000395211 DYNAPQ8N1N2 210 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD1-203ENST00000395211 TTTY12Q9BZ98 90 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD1-203ENST00000395211 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD1-203ENST00000395211 A0A0G2JNJ9 132 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD1-203ENST00000395211 PRAC2D3DTV9 90 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD1-203ENST00000395211 IGLV2-23P01705 113 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD1-203ENST00000395211 Q9UFV3 132 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD1-203ENST00000395211 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa7.29□□□□□ -1.24
TMOD1-203ENST00000395211 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa7.29□□□□□ -1.24
TMOD1-203ENST00000395211 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa7.29□□□□□ -1.24
TMOD1-203ENST00000395211 LINC00643Q86TS7 51 aa7.29□□□□□ -1.24
TMOD1-203ENST00000395211 A0A0B4J2C4 111 aa7.29□□□□□ -1.24
TMOD1-203ENST00000395211 S100A4P26447 101 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
TMOD1-203ENST00000395211 IMUPQ9GZP8 106 aa7.29□□□□□ -1.24
TMOD1-203ENST00000395211 C11orf21Q9P2W6 132 aa7.29□□□□□ -1.24
TMOD1-203ENST00000395211 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa7.29□□□□□ -1.24
TMOD1-203ENST00000395211 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa7.28□□□□□ -1.24
TMOD1-203ENST00000395211 C17orf100A8MU93 164 aa7.28□□□□□ -1.24
TMOD1-203ENST00000395211 SDIM1Q6ZPB5 146 aa7.28□□□□□ -1.24
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF575Q86XF7 245 aa7.28□□□□□ -1.24
TMOD1-203ENST00000395211 ZNRF2Q8NHG8 242 aa7.28□□□□□ -1.24
TMOD1-203ENST00000395211 KALRNO60229 2985 aa7.28□□□□□ -1.24
TMOD1-203ENST00000395211 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa7.28□□□□□ -1.24
TMOD1-203ENST00000395211 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa7.28□□□□□ -1.24
TMOD1-203ENST00000395211 CRYGDP07320 174 aa7.28□□□□□ -1.24
TMOD1-203ENST00000395211 CRYGAP11844 174 aa7.28□□□□□ -1.24
TMOD1-203ENST00000395211 WT1P19544 449 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
TMOD1-203ENST00000395211 Q5XG85 94 aa7.28□□□□□ -1.24
TMOD1-203ENST00000395211 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa7.27□□□□□ -1.25
TMOD1-203ENST00000395211 A0A0U1RQV1 116 aa7.27□□□□□ -1.25
TMOD1-203ENST00000395211 CNFNQ9BYD5 112 aa7.27□□□□□ -1.25
TMOD1-203ENST00000395211 PEMTQ9UBM1 199 aa7.27□□□□□ -1.25
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF580Q9UK33 172 aa7.27□□□□□ -1.25
TMOD1-203ENST00000395211 ATOX1O00244 68 aa7.27□□□□□ -1.25
TMOD1-203ENST00000395211 GAFA1Q96PS6 74 aa7.27□□□□□ -1.25
TMOD1-203ENST00000395211 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
TMOD1-203ENST00000395211 TMEM223A0PJW6 202 aa7.26□□□□□ -1.25
TMOD1-203ENST00000395211 TMEM258P61165 79 aa7.26□□□□□ -1.25
TMOD1-203ENST00000395211 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
TMOD1-203ENST00000395211 MSMPQ1L6U9 139 aa7.26□□□□□ -1.25
TMOD1-203ENST00000395211 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa7.26□□□□□ -1.25
TMOD1-203ENST00000395211 RNF7Q9UBF6 113 aa7.26□□□□□ -1.25
TMOD1-203ENST00000395211 CACNA1EQ15878 2313 aa7.26□□□□□ -1.25
TMOD1-203ENST00000395211 PCNX1Q96RV3 2341 aa7.26□□□□□ -1.25
TMOD1-203ENST00000395211 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa7.26□□□□□ -1.25
TMOD1-203ENST00000395211 I3L2K1 104 aa7.26□□□□□ -1.25
TMOD1-203ENST00000395211 PFN2P35080 140 aa7.26□□□□□ -1.25
TMOD1-203ENST00000395211 LINC00336Q6ZUF6 198 aa7.26□□□□□ -1.25
TMOD1-203ENST00000395211 WFDC11Q8NEX6 87 aa7.26□□□□□ -1.25
TMOD1-203ENST00000395211 C2orf48Q96LS8 159 aa7.26□□□□□ -1.25
TMOD1-203ENST00000395211 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa7.26□□□□□ -1.25
TMOD1-203ENST00000395211 ABCA4P78363 2273 aa7.26□□□□□ -1.25
TMOD1-203ENST00000395211 I3L3M4 83 aa7.26□□□□□ -1.25
TMOD1-203ENST00000395211 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
TMOD1-203ENST00000395211 CRYGBP07316 175 aa7.26□□□□□ -1.25
TMOD1-203ENST00000395211 PDE6HQ13956 83 aa7.26□□□□□ -1.25
TMOD1-203ENST00000395211 C8orf31Q8N9H6 132 aa7.26□□□□□ -1.25
TMOD1-203ENST00000395211 A0A087WVE0 104 aa7.25□□□□□ -1.25
TMOD1-203ENST00000395211 F5H697 171 aa7.25□□□□□ -1.25
TMOD1-203ENST00000395211 IGLV3-19P01714 112 aa7.25□□□□□ -1.25
TMOD1-203ENST00000395211 IGFBP4P22692 258 aa7.25□□□□□ -1.25
TMOD1-203ENST00000395211 SYNJ2BPP57105 145 aa7.25□□□□□ -1.25
TMOD1-203ENST00000395211 NDPQ00604 133 aa7.25□□□□□ -1.25
TMOD1-203ENST00000395211 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
TMOD1-203ENST00000395211 TSHBP01222 138 aa7.25□□□□□ -1.25
TMOD1-203ENST00000395211 ATP5G1P05496 136 aa7.25□□□□□ -1.25
TMOD1-203ENST00000395211 SEC61GP60059 68 aa7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.4 ms