RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000197058.1

Gm42827-201, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Gm42827, Length 1,515 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Foxa3P35584 353 aa4.85□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Hist1h1dP43277 221 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Nkx2-1P50220 372 aa4.85□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Cox6b1P56391 86 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Fhl1P97447 280 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Rhox4fQ2MDF8 205 aa4.85□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Rhox4cQ2MDG1 205 aa4.85□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 CenptQ3TJM4 515 aa4.85□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Cd300lbQ3U497 209 aa4.85□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Ceacam12Q3UKP4 300 aa4.85□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Ccl12Q62401 104 aa4.85□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 AdoQ6PDY2 256 aa4.85□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Olfr688Q6W049 321 aa4.85□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Q80W69 301 aa4.85□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Zfp874aQ8BX23 447 aa4.85□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Cmc2Q8K199 79 aa4.85□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Olfr1138Q8VFQ9 311 aa4.85□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Olfr1447Q8VFX3 309 aa4.85□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Olfr638Q8VH20 321 aa4.85□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Wdr13Q91V09 485 aa4.85□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Uqcc1Q9CWU6 295 aa4.85□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Tceal8Q9CZY2 117 aa4.85□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 MrapQ9D159 127 aa4.85□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Rhox4aQ9D3I8 205 aa4.85□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Q9DAL9 119 aa4.85□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 HpgdsQ9JHF7 199 aa4.85□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Ackr1Q9QUI6 334 aa4.85□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 TpbgQ9Z0L0 426 aa4.85□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Vamp5Q9Z2P8 102 aa4.85□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Gm4707V9GXN5 68 aa4.85□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Sorl1O88307 2215 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Dnah14A0A140LIJ4 4489 aa4.84□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Ighv1-20A0A0A6YX66 117 aa4.84□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Ighv1-47A0A0A6YY41 117 aa4.84□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Trbv30A0A0B4J1P1 111 aa4.84□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Fthl17bA2AHC5 176 aa4.84□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Fthl17cA2AHC6 176 aa4.84□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Olfr1018A2ASV3 311 aa4.84□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Gm17333C6EQI3 125 aa4.84□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Gm15440D3Z3P4 90 aa4.84□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Olfr250E9PV37 331 aa4.84□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Gm17349F7BGH6 99 aa4.84□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 FblP35550 327 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 OsmP53347 263 aa4.84□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Tcl1b2P56841 117 aa4.84□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 PmchP56942 165 aa4.84□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 B3gat2P59270 324 aa4.84□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 ElobP62869 118 aa4.84□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 UbdP63072 162 aa4.84□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Olfr1442Q0VEV7 312 aa4.84□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Fthl17fQ3SXD2 176 aa4.84□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Ctxn2Q3URE8 81 aa4.84□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Q504N7 393 aa4.84□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Rnase12Q5GAM8 145 aa4.84□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Ewsr1Q61545 655 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Ifna15Q61718 190 aa4.84□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Mindy2Q6PDI6 601 aa4.84□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Olfr876Q7TRE4 310 aa4.84□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Lrtm2Q8BGX3 370 aa4.84□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Srsf7Q8BL97 267 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Q8BN57 294 aa4.84□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Lyrm2Q8R033 88 aa4.84□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Il34Q8R1R4 235 aa4.84□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 SptssaQ8R207 71 aa4.84□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Olfr873Q8VFJ0 319 aa4.84□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Olfr513Q8VFZ3 309 aa4.84□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Olfr1238Q8VG59 315 aa4.84□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 MpiQ924M7 423 aa4.84□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Ndufa6Q9CQZ5 131 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Pnrc2Q9CR73 140 aa4.84□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Fxyd6Q9D164 94 aa4.84□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Aig1Q9D8B1 262 aa4.84□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Q9DAE8 263 aa4.84□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Gng12Q9DAS9 72 aa4.84□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Znf593Q9DB42 134 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Fam216aQ9DB54 251 aa4.84□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Trappc2lQ9JME7 139 aa4.84□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Gng13Q9JMF3 67 aa4.84□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 St6galnac5Q9QYJ1 336 aa4.84□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Psmb3Q9R1P1 205 aa4.84□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Ccl8Q9Z121 97 aa4.84□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Prss1Q9Z1R9 246 aa4.84□□□□□ -1.63
Gm42827-201ENSMUST00000197058 B230359F08RikA0A0B4J1K3 109 aa4.83□□□□□ -1.64
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Ighv1-67A0A0G2JFN9 117 aa4.83□□□□□ -1.64
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Gm45800A0A1B0GT24 152 aa4.83□□□□□ -1.64
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Gm14403A2BFU4 402 aa4.83□□□□□ -1.64
Gm42827-201ENSMUST00000197058 AsmtD3KU66 387 aa4.83□□□□□ -1.64
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Vmn2r83E9Q0G7 864 aa4.83□□□□□ -1.64
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Gm6665F6Y363 85 aa4.83□□□□□ -1.64
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Gm21761J3QK00 171 aa4.83□□□□□ -1.64
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Smlr1J3QMJ4 66 aa4.83□□□□□ -1.64
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Gm20767O70517 169 aa4.83□□□□□ -1.64
Gm42827-201ENSMUST00000197058 P04945 108 aa4.83□□□□□ -1.64
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Hoxb5P09079 269 aa4.83□□□□□ -1.64
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Acrv1P50289 261 aa4.83□□□□□ -1.64
Gm42827-201ENSMUST00000197058 NfybP63139 207 aa4.83□□□□□ -1.64
Gm42827-201ENSMUST00000197058 UqcrhP99028 89 aa4.83□□□□□ -1.64
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Tppp2Q0P5Y3 170 aa4.83□□□□□ -1.64
Gm42827-201ENSMUST00000197058 Zfp72Q0VFY0 435 aa4.83□□□□□ -1.64
Gm42827-201ENSMUST00000197058 PilrbQ2YFS2 224 aa4.83□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 120.9 ms