Protein–RNA interactions for Protein: Q3URE8

Ctxn2, Cortexin-2, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctxn2Q3URE8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Ctxn2Q3URE8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ctxn2Q3URE8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ctxn2Q3URE8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ctxn2Q3URE8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Ctxn2Q3URE8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ctxn2Q3URE8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ctxn2Q3URE8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ctxn2Q3URE8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ctxn2Q3URE8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Ctxn2Q3URE8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ctxn2Q3URE8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ctxn2Q3URE8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ctxn2Q3URE8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Ctxn2Q3URE8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ctxn2Q3URE8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ctxn2Q3URE8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ctxn2Q3URE8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Ctxn2Q3URE8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ctxn2Q3URE8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ctxn2Q3URE8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ctxn2Q3URE8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ctxn2Q3URE8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ctxn2Q3URE8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ctxn2Q3URE8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ctxn2Q3URE8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ctxn2Q3URE8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ctxn2Q3URE8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ctxn2Q3URE8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ctxn2Q3URE8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ctxn2Q3URE8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ctxn2Q3URE8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ctxn2Q3URE8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ctxn2Q3URE8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ctxn2Q3URE8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ctxn2Q3URE8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ctxn2Q3URE8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ctxn2Q3URE8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ctxn2Q3URE8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ctxn2Q3URE8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ctxn2Q3URE8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ctxn2Q3URE8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ctxn2Q3URE8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ctxn2Q3URE8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ctxn2Q3URE8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ctxn2Q3URE8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ctxn2Q3URE8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ctxn2Q3URE8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ctxn2Q3URE8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ctxn2Q3URE8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ctxn2Q3URE8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ctxn2Q3URE8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ctxn2Q3URE8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ctxn2Q3URE8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ctxn2Q3URE8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctxn2Q3URE8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ctxn2Q3URE8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ctxn2Q3URE8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ctxn2Q3URE8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ctxn2Q3URE8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ctxn2Q3URE8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ctxn2Q3URE8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ctxn2Q3URE8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ctxn2Q3URE8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctxn2Q3URE8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctxn2Q3URE8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ctxn2Q3URE8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ctxn2Q3URE8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ctxn2Q3URE8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctxn2Q3URE8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctxn2Q3URE8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ctxn2Q3URE8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ctxn2Q3URE8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctxn2Q3URE8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ctxn2Q3URE8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctxn2Q3URE8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctxn2Q3URE8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ctxn2Q3URE8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctxn2Q3URE8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctxn2Q3URE8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctxn2Q3URE8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctxn2Q3URE8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ctxn2Q3URE8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctxn2Q3URE8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctxn2Q3URE8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctxn2Q3URE8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctxn2Q3URE8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ctxn2Q3URE8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctxn2Q3URE8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctxn2Q3URE8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctxn2Q3URE8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctxn2Q3URE8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ctxn2Q3URE8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctxn2Q3URE8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctxn2Q3URE8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctxn2Q3URE8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctxn2Q3URE8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctxn2Q3URE8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ctxn2Q3URE8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctxn2Q3URE8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms